소핵 RNA SNORD64
Small nucleolar RNA SNORD64소형 핵극 RNA SNORD64 | |
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식별자 | |
기호 | SNORD64 |
Alt. 기호 | snoHBII-13 |
Rfam | RF00570 |
기타자료 | |
RNA형 | Gene; snRNA; snoRNA; C/D-box |
도메인 | 에우카리오타 |
바둑 | GO:0006396 GO:0005730 |
그렇게 | SO:0000593 |
PDB 구조 | PDBe |
분자생물학에서 SNORD64(일명 HBII-13)는 비코딩 RNA(ncRNA) 분자로, 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 생물 발생(수정)에서 기능한다.이러한 유형의 수정 RNA는 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.
SNORD64는 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 SnoRNA의 C/D 박스 클래스에 속한다.박스 C/D 계열의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1]
snoRNA HBII-13은 주로 뇌의 조직에서 발현되지만 폐, 신장, 근육에서도 발현된다.[2] 그러나 HBII-13은 확인된 표적 RNA가 없다.[3]The HBII-13 gene is located in a 460 kb intron of the large paternally-expressed transcription unit (SNURF-SNRNP-UBE3A AS) along with several other snoRNAs HBII-436, HBII-437, HBII-438A/B and the clusters of HBII-85, HBII-52.[4]이 숙주 유전자는 모성적으로 표현된 UBE3A 유전자에 대한 항응고증서다.
참조
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (October 2002). "Purified box C/D snoRNPs are able to reproduce site-specific 2'-O-methylation of target RNA in vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ Cavaillé J, Buiting K, Kiefmann M, Lalande M, Brannan CI, Horsthemke B, Bachellerie JP, Brosius J, Hüttenhofer A (December 2000). "Identification of brain-specific and imprinted small nucleolar RNA genes exhibiting an unusual genomic organization". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (26): 14311–6. doi:10.1073/pnas.250426397. PMC 18915. PMID 11106375.
- ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
- ^ Runte M, Hüttenhofer A, Gross S, Kiefmann M, Horsthemke B, Buiting K (November 2001). "The IC-SNURF-SNRPN transcript serves as a host for multiple small nucleolar RNA species and as an antisense RNA for UBE3A". Human Molecular Genetics. 10 (23): 2687–700. doi:10.1093/hmg/10.23.2687. PMID 11726556.
외부 링크
- Rfam의 소핵 RNA SNORD64 페이지
- snoRNABase의 SNORD64 입력