소핵 RNA SNORD88

Small nucleolar RNA SNORD88
소핵 RNA SNORD88
RF00604.jpg
SNORD88의 2차 구조 및 시퀀스 보존 예측
식별자
기호SNORD88
RfamRF00604
기타자료
RNA형Gene; snRNA; snoRNA; C/D-box
도메인에우카리오타
바둑GO:0006396 GO:0005730
그렇게SO:0000593
PDB 구조PDBe

분자생물학에서 소핵 RNA SNORD88(일명 HBII-180)은 비코딩 RNA(ncRNA) 분자로, 다른 소핵 RNA(snRNA)의 생물 발생(수정)에서 기능한다.이러한 유형의 수정 RNA는 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.

SNORD88은 C(UGUGAUGA) 및 D(CUGA) 상자 모티브가 포함된 SnoRNA의 C/D 박스 클래스에 속한다.C/D 박스 패밀리의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2′-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1]이 snoRNA는 마우스 snoRNA MBII-180의 인간 맞춤법이다.[2] SNORD88은 마우스 snoRNA MBII-211과도 관련이 있다. SNORD88은 28S 리보솜 RNA(rRNA) 잔류물 C3680의 2′O-리보오스 메틸화를 안내할 것으로 예측된다.[3]

SNORD88이 마이크로RNA와 비슷한 방식으로 더 작은 조각으로 가공돼 단백질 발현을 억제할 수 있다는 증거가 있다.[4][5]

참조

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (October 2002). "Purified box C/D snoRNPs are able to reproduce site-specific 2′-O-methylation of target RNA in vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (June 2001). "RNomics: an experimental approach that identifies 201 candidates for novel, small, non-messenger RNAs in mouse". The EMBO Journal. 20 (11): 2943–2953. doi:10.1093/emboj/20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
  4. ^ Ono M, Yamada K, Avolio F, Scott MS, van Koningsbruggen S, Barton GJ, Lamond AI (May 2010). "Analysis of human small nucleolar RNAs (snoRNA) and the development of snoRNA modulator of gene expression vectors". Molecular Biology of the Cell. 21 (9): 1569–1584. doi:10.1091/mbc.E10-01-0078. PMC 2861615. PMID 20219969.
  5. ^ Ono M, Scott MS, Yamada K, Avolio F, Barton GJ, Lamond AI (May 2011). "Identification of human miRNA precursors that resemble box C/D snoRNAs". Nucleic Acids Research. 39 (9): 3879–3891. doi:10.1093/nar/gkq1355. PMC 3089480. PMID 21247878.

외부 링크


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