소핵 RNA SNORD101
Small nucleolar RNA SNORD101| 소핵 RNA SNORD101 | |
|---|---|
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| 식별자 | |
| 기호 | SNORD101 |
| Alt. 기호 | U101 |
| Rfam | RF00186 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | Gene; snRNA; snoRNA; CD-box |
| 도메인 | 에우카리오타 |
| 바둑 | GO:0006396 GO:0005730 |
| 그렇게 | SO:0000593 |
| PDB 구조 | PDBe |
분자생물학에서 snoRNA U101(SNORD101)은 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 수정에서 기능하는 비코딩 RNA(ncRNA) 분자다.이러한 유형의 수정 RNA는 보통 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.
snoRNA U101은 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUAGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속한다.박스 C/D 계열의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1]
U101은 보존된 C/D 박스 시퀀스 모티브를 위한 리보솜 단백질 유전자의 인트론 계산 선별과 북부 블롯팅에 의해 실험적으로 확인된 표현으로 확인되었다.[2] snoRNA U101은 리보솜 단백질 S12의 인트론 3에 있다.U101은 C/D 박스 snoRNA HBII-429, H/ACA 박스 snoRNA ACA33과 동일한 호스트 유전자를 공유한다.[3]
현재 U101에 대한 예측 메틸레이션 목표는 없다.[2][3]
참조
- ^ Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (October 2002). "Purified Box C/D snoRNPs Are Able to Reproduce Site-Specific 2'-O-Methylation of Target RNA in Vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ a b Vitali P, Royo H, Seitz H, Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (2003). "Identification of 13 novel human modification guide RNAs". Nucleic Acids Res. 31 (22): 6543–51. doi:10.1093/nar/gkg849. PMC 275545. PMID 14602913.
- ^ a b Lestrade, Laurent; Weber, Michel J. (2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Supplement 1: Database Issue): D158–D162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
외부 링크
