소핵 RNA SNORA40

Small nucleolar RNA SNORA40
소핵 RNA SNORA40
RF00561.jpg
SNORA40의 2차 구조시퀀스 보존 예측
식별자
기호스노라40
Alt. 기호snoACA40
RfamRF00561
기타자료
RNA형Gene; snRNA; snoRNA; HACA-box
도메인에우카리오타
바둑GO:0006396 GO:0005730
그렇게SO:0000594
PDB 구조PDBe

분자생물학에서 소핵 RNA ACA40snoRNA의 H/ACA 계열에 속하며 U4565 위치에서 28S rRNA 서브유닛의 가성화를 안내한다.snoRNA ACA40은 Kiss et al에 의한 대규모 복제를 이용하여 발견되었다.([1]2004) Hela 세포 추출물 면역억제제 항체에서 항 GAR1 항체.잔류물 28S rRNA U4546 및 18S rRNA 1174의 가성화를 안내할 것으로 예측된다.[1][2]이들 잔류물의 유사유래는 오펜간드와 바킨(1997),[3] 마덴(1990)에 의해 보고되었다.[4]ACA1, ACA8, ACA18, ACA25, ACA32ACA40과 C/D 박스 snoRNAs mgh28S-2409 및 mgh28S-2411은 동일한 호스트 유전자(MGC5306)를 공유한다.

참조

  1. ^ a b Kiss, Arnold M.; Jády, Beáta E.; Bertrand, Edouard; Kiss, Tamás (2004). "Human Box H/ACA Pseudouridylation Guide RNA Machinery". Molecular and Cellular Biology. 24 (13): 5797–5807. doi:10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC 480876. PMID 15199136.
  2. ^ Schattner P, Barberan-Soler S, Lowe TM (2006). "A computational screen for mammalian pseudouridylation guide H/ACA RNAs". RNA. 12 (1): 15–25. doi:10.1261/rna.2210406. PMC 1370881. PMID 16373490.
  3. ^ Ofengand, J; Bakin A (1997). "Mapping to nucleotide resolution of pseudouridine residues in large subunit ribosomal RNAs from representative eukaryotes, prokaryotes, archaebacteria, mitochondria and chloroplasts". J Mol Biol. 266 (2): 246–268. doi:10.1006/jmbi.1996.0737. PMID 9047361.
  4. ^ Maden BE (1990). "The numerous modified nucleotides in eukaryotic ribosomal RNA". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology. 39: 241–303. doi:10.1016/S0079-6603(08)60629-7. ISBN 9780125400398. PMID 2247610.

외부 링크