소핵 RNA sR8
Small nucleolar RNA sR8| sR8 | |
|---|---|
 sR8 컨센서스 시퀀스 | |
| 식별자 | |
| 기호 | sR8 |
| Rfam | RF01311 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | snoRNA; CD-박스 |
| 도메인 | 설포오부과, 테르모코쿠스과 |
| PDB 구조 | PDBe |
분자생물학에서 소핵 RNA sR8은 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속하는 비코딩 RNA이다. sR8은 다른 C/D 박스 snoRNA와 함께 리보솜 RNA의 표적 가닥에서 리보스의 2′-O-메틸화를 수행한다.[1][2]타겟팅은 C'/D' 박스뿐만 아니라 보존된 시퀀스의 짧은 섹션인 C와 D 박스 구성 요소(C와 D 박스의 내부 등가물)를 통해 달성된다.이러한 시퀀스는 대상 rRNA에 뉴클레오티드가 있는 염기서열로 메틸화를 지시한다.[3]
sR8 RNA는 리보뉴클레오프로틴(RNP) 콤플렉스에서 단백질 성분과 나란히 작용한다. sR8은 구조화된 줄기-루프 내에서 발견된 표적의 메틸화를 안내할 수 있으며, 이는 콤플렉스의 성분이 그러한 구조를 풀 수 있음을 의미한다.[3]
모델 시스템으로서
sR8은 '모델'[3] C/D 박스 sRNA로 간주되며, C/D 박스 snoRNA와 리보뉴클레오프로테인 복합체의 성질을 조사하는 여러 실험에 사용되어 왔다.[4][5]RNP는 전적으로 체외에서 구성될 수 있기 때문에 특히 연구에 유용하다.[3]
초열성 Methanocaldoccus jannaschii의 sR8 RNA는 C/D 박스 RNP의 3차원 구조를 설명하는데 사용되었다.[6]그 구조는 뜻밖에도 두 개의 RNA 분자가 같은 콤플렉스에 있는 여러 개의 단백질과 결합하는 희미한 것으로 밝혀졌다.[6][7]
참조
- ^ Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (October 2002). "Purified Box C/D snoRNPs Are Able to Reproduce Site-Specific 2'-O-Methylation of Target RNA in Vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ Kiss-Laszlo, Z; Henry Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Kiss T (1996). "Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a novel function for small nucleolar RNAs". Cell. 85 (7): 1077–1088. doi:10.1016/S0092-8674(00)81308-2. PMID 8674114. S2CID 10418885.
- ^ a b c d Appel CD, Maxwell ES (June 2007). "Structural features of the guide:target RNA duplex required for archaeal box C/D sRNA-guided nucleotide 2'-O-methylation". RNA. 13 (6): 899–911. doi:10.1261/rna.517307. PMC 1869030. PMID 17438123.
- ^ Tran, E.; Zhang, X.; Lackey, L.; Maxwell, E. S. (2005). "Conserved spacing between the box C/D and C'/D' RNPs of the archaeal box C/D sRNP complex is required for efficient 2'-O-methylation of target RNAs". RNA. 11 (3): 285–293. doi:10.1261/rna.7223405. PMC 1370718. PMID 15661846.
- ^ Rashid R, Aittaleb M, Chen Q, Spiegel K, Demeler B, Li H (October 2003). "Functional requirement for symmetric assembly of archaeal box C/D small ribonucleoprotein particles". J. Mol. Biol. 333 (2): 295–306. doi:10.1016/j.jmb.2003.08.012. PMID 14529617.
- ^ a b Bleichert F, Gagnon KT, Brown BA, et al. (September 2009). "A dimeric structure for archaeal box C/D small ribonucleoproteins". Science. 325 (5946): 1384–7. Bibcode:2009Sci...325.1384B. doi:10.1126/science.1176099. PMC 2975540. PMID 19745151.
- ^ "Study Reveals Unexpected Ancient Cellular Structure". PhysOrg.com.
외부 링크
