소핵 RNA SNORD37

Small nucleolar RNA SNORD37
소핵 RNA SNORD37
RF00440.jpg
SNORD37의 2차 구조 및 시퀀스 보존 예측
식별자
기호SNORD37
Alt. 기호U37
RfamRF00440
기타자료
RNA형Gene; snRNA; snoRNA; C/D-box
도메인에우카리오타
바둑GO:0006396 GO:0005730
그렇게SO:0000593
PDB 구조PDBe

분자생물학에서 SNORD37(U37이라고도 함)은 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 수정에서 기능하는 비코딩 RNA(ncRNA) 분자다.이러한 유형의 수정 RNA는 보통 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.

snoRNA U37은 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUAGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속한다.C/D 박스 패밀리의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1][2]

이 snoRNA는 원래 전자 영역 내에 보존된 C/D 박스 모티브를 위한 척추동물 게놈의 컴퓨터 선별과 북방 블롯팅에 의해 실험적으로 확인된 표현에 의해 확인되었다.[3]생쥐 맞춤법이 확인되었다.[4]

SNORD37은 잔류물 A3697에서 28S 리보솜 RNA(rRNA)의 2'O-리보오스 메틸화를 유도할 것으로 예측된다.[5]

참조

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (October 2002). "Purified box C/D snoRNPs are able to reproduce site-specific 2'-O-methylation of target RNA in vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
  2. ^ Kiss T (April 2002). "Small nucleolar RNAs: an abundant group of noncoding RNAs with diverse cellular functions". Cell. 109 (2): 145–8. doi:10.1016/S0092-8674(02)00718-3. PMID 12007400. S2CID 8968788.
  3. ^ Nicoloso M, Qu LH, Michot B, Bachellerie JP (July 1996). "Intron-encoded, antisense small nucleolar RNAs: the characterization of nine novel species points to their direct role as guides for the 2'-O-ribose methylation of rRNAs". Journal of Molecular Biology. 260 (2): 178–95. doi:10.1006/jmbi.1996.0391. PMID 8764399.
  4. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (June 2001). "RNomics: an experimental approach that identifies 201 candidates for novel, small, non-messenger RNAs in mouse". The EMBO Journal. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093/emboj/20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
  5. ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.

외부 링크


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