소핵 RNA SNORD66

Small nucleolar RNA SNORD66
소핵 RNA SNORD66
RF00572.jpg
SNORD66의 2차 구조 및 시퀀스 보존 예측
식별자
기호SNORD66
Alt. 기호snoHBII-142
RfamRF00572
기타자료
RNA형Gene; snRNA; snoRNA; C/D-box
도메인에우카리오타
바둑GO:0006396 GO:0005730
그렇게SO:0000593
PDB 구조PDBe

분자생물학에서 SNORD66(HBII-142라고도 함)은 비코딩 RNA(ncRNA) 분자로, 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 개조에 기능한다.이러한 유형의 수정 RNA는 보통 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.

HBII-142는 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUAGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속한다.박스 C/D 계열의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1]

HBII-142는 마우스 MBII-142 snoRNA의 인간 맞춤법이며 잔류물 C1272에서 18S 리보솜 RNA(RNA)의 2'O-리보오스 메틸화를 안내할 것으로 예측된다.[3]

22개의 서로 다른 비소세포 폐암 조직을 살펴본 실험 결과 SNORD33, SNORD66, SNORD76은 일치하는 비암성 폐조직에 비해 과도하게 발현된 것으로 나타났다.[4]

참조

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (October 2002). "Purified box C/D snoRNPs are able to reproduce site-specific 2'-O-methylation of target RNA in vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (June 2001). "RNomics: an experimental approach that identifies 201 candidates for novel, small, non-messenger RNAs in mouse". The EMBO Journal. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093/emboj/20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
  4. ^ Liao J, Yu L, Mei Y, Guarnera M, Shen J, Li R, Liu Z, Jiang F (July 2010). "Small nucleolar RNA signatures as biomarkers for non-small-cell lung cancer". Molecular Cancer. 9: 198. doi:10.1186/1476-4598-9-198. PMC 2919450. PMID 20663213.

외부 링크


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