소핵 RNA SNORD39

Small nucleolar RNA SNORD39
소핵 RNA SNORD55/SNORD39
RF00157.jpg
SNORD39의 2차 구조 및 시퀀스 보존 예측
식별자
기호SNORD39
Alt. 기호SNORD55; U39; U55
RfamRF00157
기타자료
RNA형Gene; snRNA; snoRNA; C/D-box
도메인에우카리오타
바둑GO:0006396 GO:0005730
그렇게SO:0000593
PDB 구조PDBe

분자생물학에서 snoRNA U39(SNORD39라고도 함)는 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 수정에서 기능하는 비코딩 RNA(ncRNA) 분자다.이러한 유형의 수정 RNA는 보통 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.

snoRNA U39는 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUAGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속한다.박스 C/D 계열의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1]

SnoRNA U39는 Hela 세포에서[2] 복제되었고 생물정보학 예측에 의해 독립적으로 특성화되었다(SNORD55라고도 함).[3]

U39/U55는 28S 리보솜 RNA(rRNA) C2791의 2'O-리보오스 메틸화를 안내할 것으로 예상된다.[4]

참조

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (October 2002). "Purified box C/D snoRNPs are able to reproduce site-specific 2'-O-methylation of target RNA in vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
  2. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (June 1996). "Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a novel function for small nucleolar RNAs". Cell. 85 (7): 1077–88. doi:10.1016/S0092-8674(00)81308-2. PMID 8674114. S2CID 10418885.
  3. ^ Nicoloso M, Qu LH, Michot B, Bachellerie JP (July 1996). "Intron-encoded, antisense small nucleolar RNAs: the characterization of nine novel species points to their direct role as guides for the 2'-O-ribose methylation of rRNAs". Journal of Molecular Biology. 260 (2): 178–95. doi:10.1006/jmbi.1996.0391. PMID 8764399.
  4. ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.

외부 링크


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