소핵 RNA SNORD17

Small nucleolar RNA SNORD17
소핵 RNA SNORD17
RF00567.jpg
SNORD17의 2차 구조 및 시퀀스 보존 예측
식별자
기호SNORD17
Alt. 기호snoHBI-43
RfamRF00567
기타자료
RNA형Gene; snRNA; snoRNA; C/D-box
도메인에우카리오타
바둑GO:0006396 GO:0005730
그렇게SO:0000593
PDB 구조PDBe

분자생물학에서 SNORD17(일명 HBI-43)은 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 생물 발생(수정)에서 기능하는 비코딩 RNA(ncRNA) 분자다.이러한 유형의 수정 RNA는 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.

HBI-43은 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속한다.박스 C/D 계열의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1]

이 snoRNA는 마우스 HBI-43의 인간 맞춤법이다.[2]HBII-43은 U3797 위치에서 28s 리보솜 RNA(rRNA)의 2'O-리보오스 메틸화를 안내할 것으로 예측된다.[3]또한 이 잔류물(U3797)은 H/ACA 박스 snoRNA ACA48에 의해 가성질화(우리딘 잔류물이 가성질로 변환됨)로 예측된다.[3]

참조

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (October 2002). "Purified box C/D snoRNPs are able to reproduce site-specific 2'-O-methylation of target RNA in vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (June 2001). "RNomics: an experimental approach that identifies 201 candidates for novel, small, non-messenger RNAs in mouse". The EMBO Journal. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093/emboj/20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
  3. ^ a b Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.

외부 링크


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