소핵 RNA SNORA2
Small nucleolar RNA SNORA2| 소핵 RNA SNORA2/SNORA34 계열 | |
|---|---|
 | |
| 식별자 | |
| 기호 | SNORA2 |
| Alt. 기호 | snoACA2 |
| Rfam | RF00410 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | Gene; snRNA; snoRNA; HACA-box |
| 도메인 | 에우카리오타 |
| 바둑 | GO:0006396 GO:0005730 |
| 그렇게 | SO:0000594 |
| PDB 구조 | PDBe |
분자생물학에서 SNORA2(ACA2)는 다른 작은 핵 RNA(snRNA)를 수정하는 비코딩 RNA(ncRNA)이다.소핵 RNA의 H/ACA 등급의 멤버로, 요리딘의 수정 부위를 가성분으로 안내한다.[1]
ACA2는 원래 GAR1 단백질과 연관되어 Hela 세포에서 복제되었다.예측 헤어핀-힌지-헤어핀-테일 구조를 가지고 있으며 보존된 H/ACA-박스 모티브를 가지고 있다.원래 ACA2의 두 시퀀스 변형이 식별되었다(ACA2a와 ACA2b라고 함).두 변형은 ACA34(SNORA34라고도 함)라는 동일한 연구에서 특징지어지는 또 다른 snoRNA와 약 66% 시퀀스 아이덴티티를 공유한다.인간 게놈에서 3개의 snoRNA(ACA2a, ACA2b, ACA34)는 모두 동일한 유전자의 인트론에 있는 것으로 밝혀졌다.이 유전자는 FLJ20436으로 언급된 예측 단백질을 암호화한다.[1]
두 변종 ACA2는 모두 28S 리보솜 RNA(rRNA)에 동일한 두 개의 예측 대상 사이트(U4263 및 U4282)를 가지고 있다.ACA34도 28S rRNA의 U4269 외에 이들 사이트 중 하나(U4282)를 대상으로 할 것으로 예측된다.[1][2]이러한 세 가지 snoRNA의 염기서열 유사성, 유전적 위치 및 예측 대상 부위는 진화 중 후속 유전자 중복 작용에 의해 생성되었음을 시사한다.[1]
참조
- ^ a b c d Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (July 2004). "Human box H/ACA pseudouridylation guide RNA machinery". Molecular and Cellular Biology. 24 (13): 5797–807. doi:10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC 480876. PMID 15199136.
- ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
외부 링크
