소핵 RNA SNORD47
Small nucleolar RNA SNORD47| 소핵 RNA SNORD47 | |
|---|---|
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| 식별자 | |
| 기호 | SNORD47 |
| Alt. 기호 | U47 |
| Rfam | RF00281 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | Gene; snRNA; snoRNA; C/D-box |
| 도메인 | 에우카리오타 |
| 바둑 | GO:0006396 GO:0005730 |
| 그렇게 | SO:0000593 |
| PDB 구조 | PDBe |
분자생물학에서 SNORD47(U47이라고도 함)은 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 개조에 작용하는 비코딩 RNA(ncRNA) 분자다.이러한 유형의 수정 RNA는 보통 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.
snoRNA U57은 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUAGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속한다.박스 C/D 계열의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1]
이 snoRNA는 원래 Hela 세포에서 복제되었고 북쪽의 얼룩에 의해 검증된 표현이다.[2]잔류물 C3866에서 리보솜 RNA(RNA) 28S의 2'O-리보오스 메틸화를 유도할 것으로 예측된다.생쥐의 직교 또한[3] 복제되었다.
이 snoRNA는 다른 C/D 박스 snoRNAs U44, U74, U75, U76, U77, U78, U79, U80, U81과 같은 유전자의 인트론에 암호화되어 있다.[4]
참조
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (October 2002). "Purified box C/D snoRNPs are able to reproduce site-specific 2'-O-methylation of target RNA in vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (June 1996). "Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a novel function for small nucleolar RNAs". Cell. 85 (7): 1077–88. doi:10.1016/S0092-8674(00)81308-2. PMID 8674114. S2CID 10418885.
- ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (June 2001). "RNomics: an experimental approach that identifies 201 candidates for novel, small, non-messenger RNAs in mouse". The EMBO Journal. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093/emboj/20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
- ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
외부 링크
- Rfam의 소핵 RNA SNORD47 페이지
- snoRNABase의 SNORD47 입력
