PLA2G6
PLA2G6
85 kDa calcium-independent phospholipase A2, also known as 85/88 kDa calcium-independent phospholipase A2, Group VI phospholipase A2, Intracellular membrane-associated calcium-independent phospholipase A2 beta, or Patatin-like phospholipase domain-containing protein 9 is an enzyme that in humans is encoded by the PLA2G6 gene.[5][6][7][8][9][10]
구조
PLA2G6 유전자는 위치 13.1에서 22번 염색체의 p 암에 위치하며 80,605개의 염기쌍에 걸쳐 있다.[8] PLA2G6 유전자는 166개의 아미노산으로 구성된 18.6 kDa 단백질을 생성한다.[11][12] 그 결과 단백질의 구조는 리파아제 모티브를 포함하고 있으며 8개의 앤키린이 반복되는 것으로 나타났다.[5] 인간 PLA2G6 단백질은 설치류 PLA2G6와 달리 아미노산 염기서열 90%를 사람과 공유하는 것으로 알려져 있다. 이 삽입은 마지막 퍼팅 앤키린 반복을 교란시킬 뿐만 아니라, N-단자 단백질 결합 도메인을 C-단자 촉매 영역에서 분리하는 링커 영역으로서의 기능을 방해하는 것으로 나타났다.[5][13]
함수
PLA2G6 유전자는 인지질에서 지방산의 방출을 촉진하는 효소의 하위종류인 A2 효소를 위해 암호화된 것이다.[8] 이런 종류의 효소는 인산염을 분해(메타볼라이징)하는 역할을 한다. 인지질 신진대사는 세포막의 건전성을 유지하는 것을 돕는 것을 포함하여 많은 신체 과정에 필수적이다.
구체적으로는 PLA2G6 유전자에서 생성되는 A2 인산염효소는 PLA2 그룹 VI라고도 하며 세포막에 풍부한 인산염이라는 화합물의 수치를 조절하는 데 도움을 준다.[14] 인코딩된 단백질은 또한 포도당-절연 B세포에서 인광리피드 리모델링, 아라키돈산 방출, 질산염 유도 또는 바소프레신 유도 아라키돈산 방출, 그리고 로이코트리엔과 프로스타글란딘 합성, 파스 수용체 매개 세포 및 트랜스메브레인 이온 플럭스의 역할을 할 수 있다.[8][9]
또한, Cardiolipin(CL) 탈기화(deacylation)의 역할을 하고 있으며, 유사포드에서 F-actin 중합화 규제로 단세포 MCP1/CCL2 유도 화학요법의 속도와 방향성을 모두 필요로 한다. 촉매영역이 부족한 이소폼 ankyrin-iPLA2-1과 이소폼 ankyrin-iPLA2-2는 아마도 PLA2G6 활동의 음성 규제에 관여하고 있을 것이다.[9] 여러 개의 ISO 양식을 인코딩하는 여러 가지 대본 변형이 설명되었지만, 그 중 단 두 가지에 대한 전체 길이 특성이 현재까지 결정되었다.[8]
촉매 활성
Phosphatidylcholine + H2O = 1-acylglycerophosphocholin + 카복시산.[10][9]
모형 유기체
모델 유기체는 PLA2G6 기능 연구에 사용되어 왔다. Wellcome Trust Sanger Institute에서 Pla2g6라는tm1a(EUCOMM)Wtsi 조건부 녹아웃 마우스 라인이 생성되었다.[15] 수컷과 암컷은 삭제 효과를 판단하기 위해 표준화된 표현식 화면을[16] 거쳤다.[17][18][19][20] 수행된 추가 화면: - 심층 면역 표현식.[21]
| 특성 | 표현형 |
|---|---|
| 사용 가능한 모든 데이터:[16][21] | |
| P14의 동질성 생존성 | 정상 |
| 동족 생식 | 비정상적 |
| 체중 | 정상 |
| 신경학적 평가 | 정상 |
| 그립 강도 | 정상 |
| 이형학 | 정상 |
| 간접열량측정법 | 정상 |
| 포도당 공차 검정 | 정상 |
| 청각 뇌계 반응 | 정상 |
| 덱사 | 정상 |
| 방사선 촬영 | 정상 |
| 눈 형태학 | 정상 |
| 임상화학 | 정상 |
| 혈액학 16주 | 정상 |
| 말초혈구 백혈구 16주 | 정상 |
| 세포독성 T세포 기능 | 정상 |
| 비장면역결찰 | 정상 |
| 중신 림프절 면역항진 | 정상 |
| 골수 면역항진법 | 정상 |
| 표피 면역 구성 | 정상 |
| 트리추리스 챌린지 | 정상 |
임상적 유의성
PLA2G6의 돌연변이는 뇌철축적 2B(NBIA2B), 뇌철축적 2A(NBIA2A), 파킨슨병 14(PAR14), 유전성 척추측만증 등 미토콘드리아 결핍 및 관련 질환을 유발하는 것으로 나타났다.[22][9][10]
뇌 철 축적이 2B(NBIA2B)인 신경 디제너레이션
뇌철 축적 2B(Neurode generation, NBIA2B)는 뇌에 철이 축적되는 것과 관련된 신경퇴행성 질환으로, 주로 기저 갱년기에 있다. 지속적 외사성 기능장애가 경성, 디스토니아, 이질, 센서리모터 장애로 이어지는 것이 특징이다.[9][10]
뇌 철 축적이 2A(NBIA2A)인 뉴로디제너레이션(Neurode generation)
뇌철축적 2A(Neurode generation with brain iron accumulation 2A, NBIA2A)는 중추신경계 내 병리학적 차축 부종과 스피로이드 체질이 특징인 신경퇴행성 질환이다. 발병은 생후 처음 2년 이내에서 10세까지 사망한다.[9][10]
파킨슨병 14(PARK14)
파킨슨병 14(PARK14)는 파킨슨병, 디스토니아, 심한 인지저하, 뇌·소뇌 위축, 자기공명영상 기저 갱내 철분 부재가 특징인 성인-온셋 진행성 신경퇴행성 질환이다.[9][10]
유전성 척추측만증
유전성 척추측만증은 느리고 점진적이며 진행성 약함과 다리의 경련성(긴장성)이 특징인 유전성 퇴행성 척수 장애의 다양한 부류다. 초기 증상으로는 균형감각의 어려움, 다리에 쇠약함과 뻣뻣함, 근육 경련, 걸을 때 발가락을 끄는 것 등이 있을 수 있다. 장애의 어떤 형태에서는 방광 증상(요실금 등)이 나타나거나, 허약함과 경직감이 신체의 다른 부위로 전이될 수 있다. 진행률과 증상의 심각성은 상당히 가변적이다.[23]
이 유전자의 돌연변이와 관련된 또 다른 질병은 영아 신경축성 측위증이다.
상호작용
PLA2G6는 단백질-단백질 상호작용이 아래와 같은 것으로 나타났다.[24][9]
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000184381 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000042632 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ a b c Larsson PK, Claesson HE, Kennedy BP (Jan 1998). "Multiple splice variants of the human calcium-independent phospholipase A2 and their effect on enzyme activity". The Journal of Biological Chemistry. 273 (1): 207–14. doi:10.1074/jbc.273.1.207. PMID 9417066.
- ^ Wilson PA, Gardner SD, Lambie NM, Commans SA, Crowther DJ (Sep 2006). "Characterization of the human patatin-like phospholipase family". Journal of Lipid Research. 47 (9): 1940–9. doi:10.1194/jlr.M600185-JLR200. PMID 16799181.
- ^ Kienesberger PC, Oberer M, Lass A, Zechner R (Apr 2009). "Mammalian patatin domain containing proteins: a family with diverse lipolytic activities involved in multiple biological functions". Journal of Lipid Research. 50 Suppl: S63–8. doi:10.1194/jlr.R800082-JLR200. PMC 2674697. PMID 19029121.
- ^ a b c d e "Entrez Gene: PLA2G6 phospholipase A2, group VI (cytosolic, calcium-independent)".
이 글은 공개 도메인에 있는 이 출처의 텍스트를 통합한다.. - ^ a b c d e f g h i "PLA2G6 - 85/88 kDa calcium-independent phospholipase A2 - Homo sapiens (Human) - PLA2G6 gene & protein". Retrieved 2018-08-22.
이 문서에는 CC BY 4.0 라이센스에 따라 사용할 수 있는 텍스트가 포함되어 있다. - ^ a b c d e f "UniProt: the universal protein knowledgebase". Nucleic Acids Research. 45 (D1): D158–D169. January 2017. doi:10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (Oct 2013). "Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase". Circulation Research. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ "85/88 kDa calcium-independent phospholipase A2". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB).
- ^ Ma Z, Wang X, Nowatzke W, Ramanadham S, Turk J (Apr 1999). "Human pancreatic islets express mRNA species encoding two distinct catalytically active isoforms of group VI phospholipase A2 (iPLA2) that arise from an exon-skipping mechanism of alternative splicing of the transcript from the iPLA2 gene on chromosome 22q13.1". The Journal of Biological Chemistry. 274 (14): 9607–16. doi:10.1074/jbc.274.14.9607. PMC 3715997. PMID 10092647.
- ^ "PLA2G6". Genetics Home Reference. NCBI. 이 글은 공개 도메인에 있는 이 출처의 텍스트를 통합한다..
- ^ Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: high throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x.
- ^ a b "International Mouse Phenotyping Consortium".
- ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (Jun 2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
- ^ Dolgin E (Jun 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
- ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (Jan 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
- ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (Jul 2013). "Genome-wide generation and systematic phenotyping of knockout mice reveals new roles for many genes". Cell. 154 (2): 452–64. doi:10.1016/j.cell.2013.06.022. PMC 3717207. PMID 23870131.
- ^ a b "Infection and Immunity Immunophenotyping (3i) Consortium".
- ^ Ozes B, Karagoz N, Schüle R, Rebelo A, Sobrido MJ, Harmuth F, Synofzik M, Pascual SIP, Colak M, Ciftci-Kavaklioglu B, Kara B, Ordóñez-Ugalde A, Quintáns B, Gonzalez MA, Soysal A, Zuchner S, Battaloglu E (2017) PLA2G6 mutations associated with a continuous clinical spectrum from neuroaxonal dystrophy to hereditary spastic paraplegia. 크리네테 92(5):534-539
- ^ "Hereditary spastic paraplegia". www.uniprot.org.
- ^ Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I, Sasarman F, Weraarpachai W, Shoubridge EA, Warscheid B, Rehling P (December 2012). "MITRAC links mitochondrial protein translocation to respiratory-chain assembly and translational regulation". Cell. 151 (7): 1528–41. doi:10.1016/j.cell.2012.11.053. PMID 23260140.
추가 읽기
- Schröder HC, Perovic S, Kavsan V, Ushijima H, Müller WE (1998). "Mechanisms of prionSc- and HIV-1 gp120 induced neuronal cell death". Neurotoxicology. 19 (4–5): 683–8. PMID 9745929.
- Leslie CC (Feb 2004). "Regulation of arachidonic acid availability for eicosanoid production". Biochemistry and Cell Biology. 82 (1): 1–17. doi:10.1139/o03-080. PMID 15052324.
- Turk J, Ramanadham S (Oct 2004). "The expression and function of a group VIA calcium-independent phospholipase A2 (iPLA2beta) in beta-cells". Canadian Journal of Physiology and Pharmacology. 82 (10): 824–32. doi:10.1139/y04-064. PMID 15573142.
- Law MH, Cotton RG, Berger GE (Jun 2006). "The role of phospholipases A2 in schizophrenia". Molecular Psychiatry. 11 (6): 547–56. doi:10.1038/sj.mp.4001819. PMID 16585943.
- Tang J, Kriz RW, Wolfman N, Shaffer M, Seehra J, Jones SS (Mar 1997). "A novel cytosolic calcium-independent phospholipase A2 contains eight ankyrin motifs". The Journal of Biological Chemistry. 272 (13): 8567–75. doi:10.1074/jbc.272.13.8567. PMID 9079687.
- Mavoungou E, Georges-Courbot MC, Poaty-Mavoungou V, Nguyen HT, Yaba P, Delicat A, Georges AJ, Russo-Marie F (Sep 1997). "HIV and SIV envelope glycoproteins induce phospholipase A2 activation in human and macaque lymphocytes". Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes and Human Retrovirology. 16 (1): 1–9. doi:10.1097/00042560-199709010-00001. PMID 9377118.
- Larsson Forsell PK, Kennedy BP, Claesson HE (Jun 1999). "The human calcium-independent phospholipase A2 gene multiple enzymes with distinct properties from a single gene". European Journal of Biochemistry. 262 (2): 575–85. doi:10.1046/j.1432-1327.1999.00418.x. PMID 10336645.
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (Dec 1999). "The DNA sequence of human chromosome 22". Nature. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Kim SJ, Gershov D, Ma X, Brot N, Elkon KB (Sep 2002). "I-PLA(2) activation during apoptosis promotes the exposure of membrane lysophosphatidylcholine leading to binding by natural immunoglobulin M antibodies and complement activation". The Journal of Experimental Medicine. 196 (5): 655–65. doi:10.1084/jem.20020542. PMC 2194002. PMID 12208880.
- Hichami A, Joshi B, Simonin AM, Khan NA (Nov 2002). "Role of three isoforms of phospholipase A2 in capacitative calcium influx in human T-cells". European Journal of Biochemistry. 269 (22): 5557–63. doi:10.1046/j.1432-1033.2002.03261.x. PMID 12423354.
- Cummings BS, McHowat J, Schnellmann RG (Mar 2004). "Role of an endoplasmic reticulum Ca2+-independent phospholipase A2 in cisplatin-induced renal cell apoptosis". The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics. 308 (3): 921–8. doi:10.1124/jpet.103.060541. PMID 14634037.
- Bao S, Jin C, Zhang S, Turk J, Ma Z, Ramanadham S (Feb 2004). "Beta-cell calcium-independent group VIA phospholipase A(2) (iPLA(2)beta): tracking iPLA(2)beta movements in response to stimulation with insulin secretagogues in INS-1 cells". Diabetes. 53 Suppl 1 (90001): S186–9. doi:10.2337/diabetes.53.2007.S186. PMC 3761941. PMID 14749286.
- Tay HK, Melendez AJ (May 2004). "Fcgamma RI-triggered generation of arachidonic acid and eicosanoids requires iPLA2 but not cPLA2 in human monocytic cells". The Journal of Biological Chemistry. 279 (21): 22505–13. doi:10.1074/jbc.M308788200. PMID 15007079.
- Tanaka H, Minakami R, Kanaya H, Sumimoto H (Aug 2004). "Catalytic residues of group VIB calcium-independent phospholipase A2 (iPLA2gamma)". Biochemical and Biophysical Research Communications. 320 (4): 1284–90. doi:10.1016/j.bbrc.2004.05.225. PMID 15249229.
