NS5B(헤파키바이러스)

NS5B (Hepacivirus)
HCV 게놈

비구조 단백질 5B(NS5B)는 C형 간염 바이러스(HCV)에서 발견되는 바이러스 단백질이다.[1]RNA 의존 RNA 중합효소로, RNA 복제리보뉴클레오시드 3인산염(rNTP)의 중합성촉진하기 위한 템플릿으로 바이러스 양성 RNA 가닥을 이용해 HCV의 바이러스 RNA를 복제하는 핵심 기능을 갖고 있다.[2][3][4]몇 가지 결정 형태로 된 NS5B 중합효소의 여러 결정 구조는 동일한 합의 순서 BK(HCV-BK, 유전자형 1)에 기초하여 결정되었다.[5]그 구조는 손가락, 손바닥, 엄지손가락으로 오른손 모양으로 나타낼 수 있다.둘러싸인 활성 부위는 NS5B 고유의 것으로, 단백질의 손바닥 구조 내에 포함되어 있다.NS5B 단백질 유전자형 1b 변형 J4(HC-J4) 구조에 대한 최근 연구는 뉴클레오티드 결합의 가능한 제어와 디노보 RNA 합성의 개시 등이 발생하는 활성 부위의 존재를 나타낸다.디-노보는 RNA 복제 개시에 필요한 프라이머를 추가한다.[6]

NS5B 대상 약물

바이러스성 RNA 복제를 더 이상 방지하고 따라서 HCV를 치료하거나 치료하기 위한 수단으로 여러 가지 약물이 시판되거나 연구 대상 NS5B의 다양한 단계에 있다.그것들은 종종 NS5A 억제제와 함께 사용된다.[7]

참조

  1. ^ Gehring S, Gregory SH, Wintermeyer P, Aloman C, Wands JR (February 2009). "Generation of immune responses against hepatitis C virus by dendritic cells containing NS5 protein-coated microparticles". Clinical and Vaccine Immunology. 16 (2): 163–71. doi:10.1128/CVI.00287-08. PMC 2643538. PMID 19091993.
  2. ^ Jin Z, Leveque V, Ma H, Johnson KA, Klumpp K (March 2012). "Assembly, purification, and pre-steady-state kinetic analysis of active RNA-dependent RNA polymerase elongation complex". The Journal of Biological Chemistry. 287 (13): 10674–10683. doi:10.1074/jbc.M111.325530. PMC 3323022. PMID 22303022.
  3. ^ Moradpour D, Penin F, Rice CM (June 2007). "Replication of hepatitis C virus". Nature Reviews. Microbiology. 5 (6): 453–63. doi:10.1038/nrmicro1645. PMID 17487147.
  4. ^ Rigat K, Wang Y, Hudyma TW, Ding M, Zheng X, Gentles RG, et al. (November 2010). "Ligand-induced changes in hepatitis C virus NS5B polymerase structure". Antiviral Research. 88 (2): 197–206. doi:10.1016/j.antiviral.2010.08.014. PMID 20813137.
  5. ^ Biswal BK, Cherney MM, Wang M, Chan L, Yannopoulos CG, Bilimoria D, et al. (May 2005). "Crystal structures of the RNA-dependent RNA polymerase genotype 2a of hepatitis C virus reveal two conformations and suggest mechanisms of inhibition by non-nucleoside inhibitors". The Journal of Biological Chemistry. 280 (18): 18202–10. doi:10.1074/jbc.M413410200. PMID 15746101.
  6. ^ O'Farrell D, Trowbridge R, Rowlands D, Jäger J (February 2003). "Substrate complexes of hepatitis C virus RNA polymerase (HC-J4): structural evidence for nucleotide import and de-novo initiation". Journal of Molecular Biology. 326 (4): 1025–35. doi:10.1016/s0022-2836(02)01439-0. PMID 12589751.
  7. ^ Biswal BK, Wang M, Cherney MM, Chan L, Yannopoulos CG, Bilimoria D, et al. (August 2006). "Non-nucleoside inhibitors binding to hepatitis C virus NS5B polymerase reveal a novel mechanism of inhibition". Journal of Molecular Biology. 361 (1): 33–45. doi:10.1016/j.jmb.2006.05.074. PMID 16828488.