NOD2

NOD2
NOD2
사용가능한 구조물
PDBOrtholog 검색: PDBer RCSB
식별자
별칭NOD2, ACUG, BLAU, CARD15, CD, CLR16.3, IBD1, NLRC2, NOD2B, PSORA1, 2, BLAUS, YAOS를 포함하는 뉴클레오티드 결합 올리고머화 도메인
외부 IDOMIM : 605956 MGI : 2429397 호몰로진 : 11156 유전자카드 : NOD2
오르토로그
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq (mRNA)

NM_001293557
NM_022162
NM_001370466

NM_145857

RefSeq (단백질)

NP_001280486
NP_071445
NP_001357395

NP_665856

위치(UCSC)Chr 16: 50.69 – 50.73MbChr 8: 89.37 – 89.42Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
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카스파제 모집 도메인 함유 단백질 15(CARD15) 또는 염증성 장질환 단백질 1(IBD1)이라고도 하는 뉴클레오티드 결합 올리고머화 도메인 함유 단백질 2(NOD2)는 인간에서 16번 염색체에 위치한 NOD2 유전자에 의해 암호화되는 단백질입니다.[5][6] NOD2는 면역계에서 중요한 역할을 합니다. 박테리아 분자(펩티도글리칸)를 인식하고 면역 반응을 자극합니다.[7]

NOD2는 세포 내 패턴 인식 수용체로 식물의 저항성 단백질과 구조가 유사하고 특정 박테리아에서 발견되는 무라밀 디펩타이드(MDP)라는 특정 구조를 포함하는 분자를 인식합니다.[8]

구조.

중심 NOD 도메인(녹색)을 갖는 나선형 링커(파란색)를 통해 연결된 2개의 N-말단 CARD 도메인(빨간색)을 포함하는 NOD2 단백질 모델. C-말단에서 LRR 도메인(cyan)이[9] 위치합니다.

단백질의 C-말단 부분은 단백질과 단백질의 상호작용에 역할을 하는 것으로 알려진 류신이 풍부한 반복 도메인을 포함합니다. 단백질의 중간 부분은 단백질 자가 올리고머화에 관여하는 NOD 도메인을 특징으로 합니다. N-말단 부분은 세포자멸사NF- κB 활성화 경로에서 역할을 하는 것으로 알려진 2개의 CARD 도메인을 포함합니다.

기능.

이 유전자는 NOD1/Apaf-1 계열(NOD-like receptor family라고도 함)의 구성원이며, 2개의 카스파제 모집 도메인(CARD)과 11개의 류신이 풍부한 반복(LRR)을 갖는 단백질을 암호화합니다. 단백질은 주로 말초 혈액 백혈구에서 발현됩니다. 무라밀 디펩타이드(MDP) 부분을 가지고 있는 박테리아 분자를 인식하고 NF- κB 단백질을 활성화함으로써 면역 반응에 역할을 합니다.

임상적 의의

이 유전자의 돌연변이는 크론병,[9] 블라우 증후군, 중증 폐육종증[12]이식편대숙주병과 관련이 있습니다.[13]

NOD2 유전자는 염증성 장질환/크론병, 야오 증후군 및 블라우 증후군과 같은 염증성 질환과 연관되어 있습니다.[14][15]

상호작용

NOD2는 NLRC4상호작용하는 것으로 나타났습니다.[16][17]

NOD2는 또한 ssRNA 또는 바이러스 RNA 치료에 반응하여 MAVS에 결합하고 IFN 반응을 활성화하는 것으로 나타났습니다. NOD2가 바이러스의 패턴 인식 수용체 역할을 한다는 첫 보고입니다.[18]

참고 항목

참고문헌

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000167207 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG00000055994 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Gilberts EC, Greenstein AJ, Katsel P, Harpaz N, Greenstein RJ (Dec 1994). "Molecular evidence for two forms of Crohn disease". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91 (26): 12721–4. Bibcode:1994PNAS...9112721G. doi:10.1073/pnas.91.26.12721. PMC 45511. PMID 7809109.
  6. ^ Hugot JP, Laurent-Puig P, Gower-Rousseau C, Olson JM, Lee JC, Beaugerie L, Naom I, Dupas JL, Van Gossum A, Orholm M, Bonaiti-Pellie C, Weissenbach J, Mathew CG, Lennard-Jones JE, Cortot A, Colombel JF, Thomas G (Feb 1996). "Mapping of a susceptibility locus for Crohn's disease on chromosome 16". Nature. 379 (6568): 821–3. Bibcode:1996Natur.379..821H. doi:10.1038/379821a0. PMID 8587604. S2CID 4311407.
  7. ^ Mahla RS, Reddy MC, Prasad DV, Kumar H (September 2013). "Sweeten PAMPs: Role of Sugar Complexed PAMPs in Innate Immunity and Vaccine Biology". Frontiers in Immunology. 4: 248. doi:10.3389/fimmu.2013.00248. PMC 3759294. PMID 24032031.
  8. ^ Kufer TA, Banks DJ, Philpott DJ (Aug 2006). "Innate immune sensing of microbes by Nod proteins". Annals of the New York Academy of Sciences. 1072 (1): 19–27. Bibcode:2006NYASA1072...19K. doi:10.1196/annals.1326.020. PMID 17057187. S2CID 20217610.
  9. ^ a b Nakagome S, Mano S, Kozlowski L, Bujnicki JM, Shibata H, Fukumaki Y, Kidd JR, Kidd KK, Kawamura S, Oota H (Jun 2012). "Crohn's disease risk alleles on the NOD2 locus have been maintained by natural selection on standing variation". Molecular Biology and Evolution. 29 (6): 1569–85. doi:10.1093/molbev/mss006. PMC 3697811. PMID 22319155.
  10. ^ Ogura Y, Inohara N, Benito A, Chen FF, Yamaoka S, Nunez G (Feb 2001). "Nod2, a Nod1/Apaf-1 family member that is restricted to monocytes and activates NF-kappaB". The Journal of Biological Chemistry. 276 (7): 4812–8. doi:10.1074/jbc.M008072200. PMID 11087742.
  11. ^ "Entrez Gene: NOD2 nucleotide-binding oligomerization domain containing 2".
  12. ^ Sato H, Williams HR, Spagnolo P, Abdallah A, Ahmad T, Orchard TR, Copley SJ, Desai SR, Wells AU, du Bois RM, Welsh KI (Feb 2010). "CARD15/NOD2 polymorphisms are associated with severe pulmonary sarcoidosis". Eur Respir J. 35 (2): 324–30. doi:10.1183/09031936.00010209. PMID 19679608.
  13. ^ Zhao H, Jia M, Wang Z, Cheng Y, Luo Z, Chen Y, Xu X, Yang S, Tang Y (Jun 2015). "Association between NOD2 single nucleotide polymorphisms and Grade III-IV acute graft-versus-host disease: A meta-analysis". Hematology. 20 (5): 254–62. doi:10.1179/1607845414Y.0000000202. PMID 25248089. S2CID 206850232.
  14. ^ Radford-Smith G, Pandeya N (Nov 2006). "Associations between NOD2/CARD15 genotype and phenotype in Crohn's disease--Are we there yet?". World Journal of Gastroenterology. 12 (44): 7097–103. doi:10.3748/wjg.v12.i44.7097. PMC 4087769. PMID 17131470.
  15. ^ Kim TH, Payne U, Zhang X, Iwanaga Y, Davey MP, Rosenbaum JT, Inman RD (Jan 2007). "Altered host:pathogen interactions conferred by the Blau syndrome mutation of NOD2". Rheumatology International. 27 (3): 257–62. doi:10.1007/s00296-006-0250-0. PMID 17096091. S2CID 23739992.
  16. ^ Damiano JS, Oliveira V, Welsh K, Reed JC (Jul 2004). "Heterotypic interactions among NACHT domains: implications for regulation of innate immune responses". The Biochemical Journal. 381 (Pt 1): 213–9. doi:10.1042/BJ20031506. PMC 1133779. PMID 15107016.
  17. ^ Damiano JS, Stehlik C, Pio F, Godzik A, Reed JC (Jul 2001). "CLAN, a novel human CED-4-like gene". Genomics. 75 (1–3): 77–83. doi:10.1006/geno.2001.6579. PMID 11472070.
  18. ^ Sabbah A, Chang TH, Harnack R, Frohlich V, Tominaga K, Dube PH, Xiang Y, Bose S (Oct 2009). "Activation of innate immune antiviral responses by Nod2". Nature Immunology. 10 (10): 1073–80. doi:10.1038/ni.1782. PMC 2752345. PMID 19701189.

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