NLRP1

NLRP1
NLRP1
PDB 1pn5 EBI.jpg
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭NLRP1, CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L/S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, NLR family, pyrin domain containing 1, NLR family pyrin domain containing 1, MSPC, AIADK, JRRP
외부 IDOMIM: 606636 MGI: 3582959 HomoloGene: 19080 GeneCard: NLRP1
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_033007
NM_001033053
NM_014922
NM_033004
NM_033006

NM_001039680
NM_001040696
NM_001162414

RefSeq(단백질)

NP_001028225
NP_055737
NP_127497
NP_127499
NP_127500

NP_001035786
NP_00115886

위치(UCSC)Cr 17: 5.5 – 5.62MbCr 11: 71.04 – 71.12Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

NLRP1은 인간에게 NACHT, LRR, FIIND, CARD 도메인PYD 도메인 함유 단백질 1을 암호화한다.[5][6][7]NLRP1은 인플람마솜을 형성한 최초의 단백질이었다.[8]NLRP1은 상피 또는 조혈이 지배적인 다양한 세포 유형에 의해 표현된다.이 표현은 또한 소장의 안감, , 기도 상피와 털이 없거나 윤기 나는 피부에서 볼 수 있다.[9]NLRP1 다형성은 CD의 피부 외피 발현과 연관되어 있다.[9]그것의 가장 높은 표현은 사람의 피부, 건선, 유리고에서 발견되었다.NLRP1의 다형성은 루푸스 에리테마토스와 당뇨병 타입 1에서 발견되었다.[10]쥐 NLRP1의 변형된 생쥐는 탄저균 치사율의 프로테아제에 의해 N단자 갈라짐 시 활성화되는 것으로 밝혀졌다.[8]

함수

이 유전자는 세포사멸 단백질 Ced-4 계열의 구성원을 암호로 한다.세드 패밀리는 캐스파이스 채용 도메인(CARD)을 포함하고 있으며, 프로그램된 세포 사망의 핵심 매개자로 알려져 있다.인코딩된 단백질단백질-단백질 상호작용에 관여할 가능성이 있는 N단자 피린 같은 독특한 모티브를 함유하고 있다.NLRP1 단백질은 카스파제 2와 강하게 상호작용하고 카스파제 9와 약하게 상호작용한다.유전자의 과다 압착은 세포에 화농증을 유발하는 것으로 입증되었다.이 유전자에 대해 구별되는 ISO형식을 인코딩하는 여러 가지 대안으로 분할된 대본변형이 발견되었지만, 일부 변종의 생물학적 타당성은 결정되지 않았다.[7]

활성화 메커니즘

NLRP1은 항균성 또는 항바이러스성 면역 반응을 활성화한다.항균 면역 반응MAP 키나제 반응의 상실을 보상한다.인간은 NLRP1을 생산하지만 인간 NLRP1은 치명적인 인자에 의해 활성화되지 않는다.[8]Caspase-1의 활성 형태에서 프로-카스파제-1의 모집과 활성화를 담당하는 자동침투성 PYD를 제거하고 CARD 도메인을 해제하는 단백질 분해능에 의해 NLRP1이 활성화될 수 있다.[8]인간 NLRP1 활성화는 장바이러스 3C 프로텍타아제를 포함한 몇 가지 방법으로 도출될 수 있다.[11]내성에서의 그것의 기능은 이제 막 이해되기 시작하고 있다.[8]

상호작용

NLRP1은 Caspase 9 [12][13] APAF1상호작용하는 것으로 나타났다.[12]FIIND 도메인을 통해 NLRP1은 NLRP1 활성화를 방지하는데 필요한 DPP9DPP8과 직접 상호작용한다.[14]

인간과 생쥐에서 DPP9가 상실되면 NLRP1이 활성화된다.[15]

인체 내 NLRP1 변형

Bruno Reverseade와 동료들에 의해 출판된 바와 같이 NLRP1 세균라인 돌연변이에 의해 야기된 몇 가지 멘델리아 질병이 설명되어 왔다.[16]여기에는 다발성 자가치유 팜플렉스 암종, 가족성 니캄병, 관절염과 이형성증을 동반한 자가인플레이션 등이 포함된다.지배적이든 열성적이든 NLRP1의 돌연변이는 IL1BIL18 릴리스로 인플람마솜 신호를 유발하는 기능 게인 알레르기가 되는 경향이 있다.

마우스의 NLRP1 변형

생쥐는 Nlrp1유전자(Nlrp1a, b, c)의 세 개의 파라로그를 가지고 있다.Nlrp1c는 유사 동종이다.[17]마우스 NLRP1B는 수용체-리간드형 메커니즘에 의해 활성화되지 않는다.특정 인브레드 마우스 변종인 BALB/c 및 129의 NLRP1B 변종은 치사율(LF) 프로테아제(Protease)에 의해 활성화될 수 있다.치명적인 요소 프로테아제탄저균의 작용제인 바실러스 안트라시스가 생산하고 분비한다.[18]LF는 보호항원(PA)과 함께 초당 독소인 치명 독소를 형성한다.PA의 역할은 LF를 숙주세포 사이토솔로 전달하는 번역채널을 형성하는 것으로, LF는 MAP키나제를 분해·비활성화함으로써 면역반응에서 역할을 한다.[19][20]또한 LF는 N-terminus에 근위부 NLRP1B를 직접 분할하며, NLRP1B 인플람마솜 형성과 CASP1 활성화에 필요하고 충분하다.[21]NLRP1B 의존성 팽창마솜 반응의 활성화는 IL-1β 및 중성미자와 같은 메커니즘을 가진 호스트 방어에 나타난다.[22][23]NLRP1B는 박테리아 보호제의 센서로서 기능할 수 있으며, 면역 반응은 특히 독성 인자에 의해 활성화된다.[24][25]

어떤 자극이 NLRP1A를 활성화시킬 수 있는지는 명확하지 않다. NLRP1의 또 다른 알려진 기능적 뮤린 NLRP1 파라로그.연구는 활성 인플람마솜 반응을 보이는 NLRP1A(Q593P)에서 오감 게인 기능 돌연변이를 가진 마우스를 확인했다.야생형 NLRP1A 활성화의 메커니즘은 불분명하다.[26]

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG000091592 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000070390 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Thorpe KL, Abdulla S, Kaufman J, Trowsdale J, Beck S (Oct 1996). "Phylogeny and structure of the RING3 gene". Immunogenetics. 44 (5): 391–6. doi:10.1007/BF02602785. PMID 8781126. S2CID 44613743.
  6. ^ Tschopp J, Martinon F, Burns K (February 2003). "NALPs: a novel protein family involved in inflammation". Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 4 (2): 95–104. doi:10.1038/nrm1019. PMID 12563287. S2CID 31417018.
  7. ^ a b "Entrez Gene: NLRP1 NLR family, pyrin domain containing 1".
  8. ^ a b c d e Chavarría-Smith J-미첼 PS, AM, Daugherty, 밴스 RE(12월 2016년)."그리고 진화 기능 분석에는 일반 메커니즘 NLRP1 Inflammasome 활성화를 위한로 단백질 분해 Identify".PLOS 병원. 12(12):e1006052.doi:10.1371/journal.ppat.1006052.PMC 5142783.PMID 27926929.재료는 창조적 공용 귀인 4.0국제 라이센스 하에 가능하다 이 원본에서 복사되었다.
  9. ^ a b Kummer JA, Broekhuizen R, Everett H, Agostini L, Kuijk L, Martinon F, et al. (May 2007). "Inflammasome components NALP 1 and 3 show distinct but separate expression profiles in human tissues suggesting a site-specific role in the inflammatory response". The Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 55 (5): 443–52. doi:10.1369/jhc.6A7101.2006. PMID 17164409.
  10. ^ Grandemange S, Sanchez E, Louis-Plence P, Tran Mau-Them F, Bessis D, Coubes C, et al. (July 2017). "NLRP1-associated autoinflammation with arthritis and dyskeratosis)". Annals of the Rheumatic Diseases. 76 (7): 1191–1198. doi:10.1136/annrheumdis-2016-210021. PMID 27965258. S2CID 206852426.
  11. ^ Robinson KS, Teo DE, Tan KS, Toh GA, Ong HH, Lim CK, et al. (December 2020). "Enteroviral 3C protease activates the human NLRP1 inflammasome in airway epithelia". Science. 370 (6521): eaay2002. doi:10.1126/science.aay2002. PMID 33093214. S2CID 225052810.
  12. ^ a b Chu ZL, Pio F, Xie Z, Welsh K, Krajewska M, Krajewski S, et al. (March 2001). "A novel enhancer of the Apaf1 apoptosome involved in cytochrome c-dependent caspase activation and apoptosis". The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 9239–45. doi:10.1074/jbc.M006309200. PMID 11113115.
  13. ^ Hlaing T, Guo RF, Dilley KA, Loussia JM, Morrish TA, Shi MM, et al. (March 2001). "Molecular cloning and characterization of DEFCAP-L and -S, two isoforms of a novel member of the mammalian Ced-4 family of apoptosis proteins". The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 9230–8. doi:10.1074/jbc.M009853200. PMID 11076957.
  14. ^ Zhong FL, Robinson K, Teo DE, Tan KY, Lim C, Harapas CR, et al. (December 2018). "Human DPP9 represses NLRP1 inflammasome and protects against autoinflammatory diseases via both peptidase activity and FIIND domain binding". The Journal of Biological Chemistry. 293 (49): 18864–18878. doi:10.1074/jbc.RA118.004350. PMC 6295727. PMID 30291141.
  15. ^ Harapas CR, Robinson KS, Lay K, Wong J, Moreno Traspas R, Nabavizadeh N, et al. (2021-02-03). "DPP9 deficiency: an Inflammasomopathy which can be rescued by lowering NLRP1/IL-1 signaling". medRxiv. doi:10.1101/2021.01.31.21250067. S2CID 231775569.
  16. ^ Zhong FL, Mamaï O, Sborgi L, Boussofara L, Hopkins R, Robinson K, et al. (September 2016). "Germline NLRP1 Mutations Cause Skin Inflammatory and Cancer Susceptibility Syndromes via Inflammasome Activation". Cell. 167 (1): 187–202.e17. doi:10.1016/j.cell.2016.09.001. PMID 27662089.
  17. ^ Sastalla I, Crown D, Masters SL, McKenzie A, Leppla SH, Moayeri M (March 2013). "Transcriptional analysis of the three Nlrp1 paralogs in mice". BMC Genomics. 14 (1): 188. doi:10.1186/1471-2164-14-188. PMC 3641005. PMID 23506131.
  18. ^ Boyden ED, Dietrich WF (February 2006). "Nalp1b controls mouse macrophage susceptibility to anthrax lethal toxin". Nature Genetics. 38 (2): 240–4. doi:10.1038/ng1724. PMID 16429160. S2CID 23316987.
  19. ^ Turk BE (March 2007). "Manipulation of host signalling pathways by anthrax toxins". The Biochemical Journal. 402 (3): 405–17. doi:10.1042/BJ20061891. PMID 17313374.
  20. ^ Moayeri M, Leppla SH (December 2009). "Cellular and systemic effects of anthrax lethal toxin and edema toxin". Molecular Aspects of Medicine. 30 (6): 439–55. doi:10.1016/j.mam.2009.07.003. PMC 2784088. PMID 19638283.
  21. ^ Chavarría-Smith J, Vance RE (2013). "Direct proteolytic cleavage of NLRP1B is necessary and sufficient for inflammasome activation by anthrax lethal factor". PLOS Pathogens. 9 (6): e1003452. doi:10.1371/journal.ppat.1003452. PMC 3688554. PMID 23818853.
  22. ^ Terra JK, Cote CK, France B, Jenkins AL, Bozue JA, Welkos SL, et al. (January 2010). "Cutting edge: resistance to Bacillus anthracis infection mediated by a lethal toxin sensitive allele of Nalp1b/Nlrp1b". Journal of Immunology. 184 (1): 17–20. doi:10.4049/jimmunol.0903114. PMC 2811128. PMID 19949100.
  23. ^ Moayeri M, Crown D, Newman ZL, Okugawa S, Eckhaus M, Cataisson C, et al. (December 2010). "Inflammasome sensor Nlrp1b-dependent resistance to anthrax is mediated by caspase-1, IL-1 signaling and neutrophil recruitment". PLOS Pathogens. 6 (12): e1001222. doi:10.1371/journal.ppat.1001222. PMC 3000361. PMID 21170303.
  24. ^ de Zoete MR, Bouwman LI, Keestra AM, van Putten JP (March 2011). "Cleavage and activation of a Toll-like receptor by microbial proteases". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (12): 4968–73. Bibcode:2011PNAS..108.4968D. doi:10.1073/pnas.1018135108. PMC 3064367. PMID 21383168.
  25. ^ Sarris PF, Duxbury Z, Huh SU, Ma Y, Segonzac C, Sklenar J, et al. (May 2015). "A Plant Immune Receptor Detects Pathogen Effectors that Target WRKY Transcription Factors". Cell. 161 (5): 1089–1100. doi:10.1016/j.cell.2015.04.024. PMID 26000484.
  26. ^ Masters SL, Gerlic M, Metcalf D, Preston S, Pellegrini M, O'Donnell JA, et al. (December 2012). "NLRP1 inflammasome activation induces pyroptosis of hematopoietic progenitor cells". Immunity. 37 (6): 1009–23. doi:10.1016/j.immuni.2012.08.027. PMC 4275304. PMID 23219391.

추가 읽기

외부 링크

  • UniProt: PDBe-KB에서 Q9C000(NACHT, LRR 및 PYD 도메인 포함 단백질 1)에 사용할 수 있는 모든 구조 정보의 개요.