KIX 도메인

KIX domain
KIX(CBP)
KIX and TAD in complex, structure by Lecoq 2017, PDB 5U4K.jpg
CBP의 KIX 도메인(노란색, 녹색 및 시안)과 p65/RELA의 C 터미널 트랜스액티베이션 도메인(빨간색)[1] 사이의 복합체
식별자
기호.KIX
팜PF02172
빠맘 클랜CL0589
인터프로IPR003101
캐스1/0
SCOP21sb0 / SCOPe / SUPFAM
KIX(MED15)
식별자
기호.KIX_2
팜PF16987
인터프로IPR036546

생화학에서 KIX 도메인(키나아제 유도 도메인(KID) 상호작용 도메인) 또는 CREB 결합 도메인은 진핵생물 전사 공동활성화제 CBP 및 P300의 단백질 도메인이다.이것은 공활성제와 특정 전사 인자 사이에 헤테로디미터를 형성하기 위한 도킹 사이트 역할을 합니다.구조적으로 KIX 도메인은 3개의 α-헬리스크와 2개의 짧은 3-헬리스크로10 이루어진 구상 도메인이다.

KIX 도메인은 1996년 CBP에서 [2]전사를 활성화하기 위해 인산화 CREB와 결합하고 상호작용하는 특이적이고 최소적인 영역으로 처음 발견되었다.따라서 이것은 처음에 CREB 결합 도메인으로 불렸다.그러나 나중에 그것이 다른 많은 단백질도 결합한다는 것이 밝혀졌을 때, KIX 도메인은 더 일반적인 이름이 되었다.KIX 도메인은 두 개의 개별 결합 부위, 즉 온단백질 c-Myb의 이름을 딴 "c-Myb 사이트"와 MLL(혼합계 백혈병, KMT2A)[3]의 이름을 딴 "ML 사이트"를 포함한다.

전사를 활성화하기 위해 DNA 결합 전사 인자에 병렬 공활성제 CBP(CREBBP) 및 P300(EP300)을 모집한다.공활성제는 전사인자와의 단백질-단백질 접촉을 통해서만 DNA의 촉진제 및 강화제와 간접적으로 결합할 수 있다.CBP와 P300은 두 가지 방법으로 상승적으로 전사를 활성화한다: 첫째, 내재 히스톤 아세틸전달효소 활성을 통해 염색질을 재모델링 및 완화시키고, 둘째, RNA 중합효소 [4]II와 같은 기초 전사 기구를 모집함으로써.

KIX 도메인은 제안된 GACKIX 도메인 슈퍼 패밀리에 속합니다.GACKIX는 관련된 단백질에서 구조 및 기능적으로 매우 상동적인 도메인을 포함한다.GAL11 / ARC105(MED15), 식물단백질 CBP 유사, CBP 및 [5]P300의 KIX 도메인 이름을 따서 명명되었다.추가 예로는 RECQL5와 관련된 식물단백질이 [6][7]있다.이들 모두 KIX 도메인 또는 KIX 관련 도메인을 포함하고 있으며, 다양한 전사 인자의 트랜스활성화 도메인과 상호작용합니다.KIX 도메인, KIX 관련 도메인 및 GACKIX 도메인의 구별은 현재 진행 중인 논의의 대상이며 명확하게 정의되어 있지 않다.

완전한 CBP/P300 단백질

CBP 구조 도메인의 개요

KIX 도메인 외에 CBP와 P300에는 혼동하지 말아야 할 단백질 결합 도메인이 다수 포함되어 있습니다(숫자는 aa 번호).

  • CH1/TAZ1 도메인, CBP[347-433], P300[323-423][8]
  • KIX 도메인, CBP[587–666], P300[566–645][8]
  • 브로모도메인, CBP[1103–1175], P300[1067–1139][8]
  • CH2 도메인(IPR010303), CBP [1191–1317], P300 [1155-1280][9]
  • HAT 도메인, CBP[1323–1700], P300[1287–1663][8]
  • CH3/ZZ 도메인, CBP[1701-1744], P300[1664-1707][8]
  • CH3/TAZ2 도메인, CBP[1765–1846], P300[1728-1809][8]
  • IRF-3 결합(i-BiD),[10] 핵수용체 공동활성화자 결합(NCBD)[11] 또는 SRC1 상호작용 도메인(SID; IPR014744),[12] CBP[2020-213], P300[1992-2098].

3개의 CH(시스테인/히스티딘이 풍부한) 도메인은 모두 아연 [9]핑거입니다.

상호 작용

9aaTAD-KIX 도메인 복합체

인간과 동물의 단백질:

효모단백질:

바이러스 단백질:

레퍼런스

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외부 링크