무척추동물 미토콘드리아 코드
Invertebrate mitochondrial code무척추동물 미토콘드리아 코드(번역표 5)는 무척추동물의 미토콘드리아 게놈에서 사용하는 유전자 코드다.
코드
AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSSSVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M----------------------------MMMM---------------M------------
Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
베이스: 아데닌(A), 시토신(C), 구아닌(G), 티민(T) 또는 우라실(U)
아미노산:Alanine (Ala, A), Arginine (Arg, R), Asparagine (Asn, N), Aspartic acid (Asp, D), Cysteine (Cys, C), Glutamic acid (Glu, E), Glutamine (Gln, Q), Glycine (Gly, G), Histidine (His, H), Isoleucine (Ile, I), Leucine (Leu, L), Lysine (Lys, K), Methionine (Met, M), Phenylalanine (Phe, F), Proline (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonine (Thr, T), Tryptophan(Trp, W), Tyrosine(Tyr, Y), Valine(Valine, V)
표준 코드와의 차이
DNA 코돈 | RNA 코돈 | 이 코드(5) | 표준코드(1) | |
---|---|---|---|---|
AGA | AGA | 세르 (S) | 아그 (R) | |
AG | AG | 세르 (S) | 아그 (R) | |
ATA | AUA | 만났다 (M) | 일레 (I) | |
TGA | UGA | 트렙 (W) | {{{1}}} (*) |
대체 개시 코돈
체계적 범위
- 네마토다:아스카리스, 케노르합디트 ;
- 몰루스카: 비발비아);[4]폴리플라코포라;[3]
- 절지동물/요강:아르테미아;[5]
- 절지동물/곤충류:드로소필라 [로쿠스타 미그레이터리아(이주 메뚜기), 아피스 멜리페라(꿀벌)]
기타변동
- 여러 절지동물은 코돈 AGG를 세린(Pterobranchia Mitochondrial Code)이나 아르기닌(표준 유전자 코드와 같이) 대신 리신(Lysine)으로 번역한다.[6]
- GUG는 드로소필라에서 이니시에이터 역할을 할 수 있다.[7][8]AUU는 미틸러스에서[4] 이니시에이터로 사용되지 않음
- "[10]그유일한그럴듯한 개시 코돈인 AUA가 나머지 유전자와 틀에서 벗어나 있기 때문에 D멜라노가스터와[9]D.야쿠바 양쪽 모두에서 시토크롬 산화효소 서브단위 나는번역을 시작하기 mRNA의 위해 예외적인메커니즘이 작동해야 한다.개시는 AUAA 쿼드러플트의 "읽기"를 요구하는 것으로 보이며, 이는 AUA에서의 개시에 해당하며, 이는 특정 리보솜 프레임시프트가 바로 뒤따른다.또 다른 가능한 메커니즘은 mRNA가 AUA의 시작을 프레임에 넣기 위해 "편집"되어 있다는 것이다.[11]
참고 항목
참조
이 기사는 공공영역에 있는 미국 국립 의학 도서관의 텍스트를 통합하고 있다. [12]
- ^ Sengupta S, Yang X, Higgs PG (June 2007). "The mechanisms of codon reassignments in mitochondrial genetic codes". Journal of Molecular Evolution. 64 (6): 662–88. arXiv:q-bio/0703066. Bibcode:2007JMolE..64..662S. doi:10.1007/s00239-006-0284-7. PMC 1894752. PMID 17541678.
- ^ Crozier RH, Crozier YC (January 1993). "The mitochondrial genome of the honeybee Apis mellifera: complete sequence and genome organization". Genetics. 133 (1): 97–117. doi:10.1093/genetics/133.1.97. PMC 1205303. PMID 8417993.
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- ^ Clary DO, Wolstenholme DR (1985). "The mitochondrial DNA molecular of Drosophila yakuba: nucleotide sequence, gene organization, and genetic code". Journal of Molecular Evolution. 22 (3): 252–71. Bibcode:1985JMolE..22..252C. doi:10.1007/BF02099755. PMID 3001325. S2CID 12384495.
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- ^ Clary DO, Wolstenholme DR (June 1983). "Nucleotide sequence of a segment of Drosophila mitochondrial DNA that contains the genes for cytochrome c oxidase subunits II and III and ATPase subunit 6". Nucleic Acids Research. 11 (12): 4211–27. doi:10.1093/nar/11.12.4211. PMC 326036. PMID 6306579.
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- ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "The Genetic Codes". Taxonomy browser. National Center for Biotechnology Information (NCBI), U.S. National Library of Medicine. Retrieved 26 August 2015.