GAMESS(미국)
GAMESS (US) | |
| 개발자 | 아이오와 주립 대학교 양자 화학 그룹 |
|---|---|
| 초기 릴리즈 | 1977년 10월 1일; 전 |
| 안정적 해제 | 2017년 4월 20일 / 2017년 4월 20일; 전 |
| 기록 위치 | 포트란 77, C |
| 운영 체제 | Windows; Unix, Unix 유사: Linux, FreeBSD, Mac OS X |
| 다음에서 사용 가능 | 영어 |
| 유형 | 계산화학 |
| 면허증 | 소유권 프리웨어 |
| 웹사이트 | www |
GAMSS(General Atomic and Molecular Electronic Structure System, 미국)는 컴퓨터 화학 프로그램용 소프트웨어다.[1][2][3][4][5]원래의 코드는 1977년 10월 1일 국립 화학 계산 자원 프로젝트에서 시작되었다.[6]1981년, 코드 베이스는 GAMESS(미국)와 GAMESS(영국) 변형으로 분할되어 현재는 크게 다르다.GAMESS(미국)는 아이오와 주립대학의 고든 리서치 그룹 회원들에 의해 유지된다.[7]GAMESS(미국) 소스 코드는 소스가 가능한 프리웨어로 제공되지만 라이센스 제한으로 인해 오픈 소스 소프트웨어는 아니다.
능력
| SCFTP= | RHF | ROHF | UHF | GVB | MCSCF |
|---|---|---|---|---|---|
| 에너지 | CDPF | CDPF | CDPF | CDP | CDPF |
| 분석 그라데이션 | CDPF | CDPF | CDPF | CDP | CDPF |
| 수치 헤시안 | CDPF | CDP | CDP | CDP | CDP |
| 헤시안 분석 | CDPF | CDPF | CDPF | CDP | DP |
| MP2 에너지 | CDPF | CDPF | CDP | 아니요. | CDP |
| MP2 그라데이션 | CDPF | DP | CDP | 아니요. | 아니요. |
| CI 에너지 | CDPF | CDP | 아니요. | CDP | CDP |
| CI 구배 | CD | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. |
| CC 에너지 | CDPF | CDF | 아니요. | 아니요. | 아니요. |
| UM 에너지 | CD | CD | 아니요. | 아니요. | 아니요. |
| DFT 에너지 | CDPF | CDP | CDPF | 아니요. | 아니요. |
| DFT 그라데이션 | CDPF | CDP | CDPF | 아니요. | 아니요. |
| TD-DFT 에너지 | CDPF | 아니요. | CDPF | 아니요. | 아니요. |
| TDDFT 그라데이션 | CDPF | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. |
| 모팩 에너지 | 네 | 네 | 네 | 네 | 아니요. |
| MOPAC 그라데이션 | 네 | 네 | 네 | 아니요. | 아니요. |
GAMESS (미국)는 Hartree를 포함한 몇 가지 일반적인 계산 화학 계산을 수행할 수 있다.Fock 방법, 밀도 기능 이론(DFT), 일반화된 발란스 결합(GVB), 다중 구성 자기 일치 필드(MCSCF).이러한 SCF 계산 후의 상관관계 보정은 구성 상호작용(CI), 두 번째 순서 뫼르-플레셋 섭동 이론(MP2) 및 결합 클러스터(CC) 이론으로 추정할 수 있다.용매 효과는 이산 유효 단편 전위 또는 연속체 모델(PCM 등)을 통해 양자역학과 분자역학을 사용하는 것을 고려할 수 있다. 3차 더글러스-크롤 스칼라 항을 포함하여 상대론적 보정을 계산할 수 있다.
GAMESS(미국) 프로그램은 ERI 텐서를 세 개의 중심 행렬로 투영함으로써 한 방법의 전체 비용을 절감하는 Identity(Identity) 근사 방법을 보유하고 있다.RI 근사치는 각각 MP2와 CCSD(T) 방법에 적용되었다.뛰어난 스케일링과 빠른 계산을 가능하게 하는 MPI/OpenMP 병렬화 모델의 RI-MP2와 RI-CC 코드는 이점이 있다.
GAMESS(미국)도 대형 분자를 더 작고 실현 가능한 조각으로 분할해 더 큰 분자계를 표적으로 할 수 있도록 하는 일련의 단편화 방법을 가지고 있다.그 예로는 분자 궤도(FMO)법, 유효 단편 전위법(EFP)법, 유효 단편 분자 궤도법(Effective Particle Obtraval Method, EFMO)법 등이 있다.
GAMESS(미국) 소프트웨어는 클라우스 루덴버그 교수가 제안한 준원자 궤도(QUAO) 분석에 기초한 종합적인 본딩 분석 기법도 제공한다.QUAO 분석은 분자 내 분자 궤도를 결합하는 준원자적 관점을 제공한다.이것들은 접착 방향을 보여주는 방향 궤도들이다.QAO는 채권의 강도를 측정하는 본드 오더(BO), 키네틱 본드 오더(KBO)와 그 점수로 특징지어진다.QUAO 분석을 통해 사용자는 분자 또는 중소규모의 결합 패턴을 높은 정확도로 연구할 수 있다.
프로그램은 분자역학을 직접 수행하지는 않지만, 효과적인 단편 전위나 팅커 코드와의 접점을 통해 혼합 양자역학과 분자역학 계산을 할 수 있다.분자궤도법은 큰 시스템을 조각으로 나누어 치료하는 데 사용할 수 있다.
또한 발란스 본드 VB2000 및 XMVB 프로그램 및 NBO(Natural Bond Obital) 인구 분석 프로그램과도 접속할 수 있다.
입력 파일은 키워드 기반 체계를 사용한다.예를 들어, $CONtrl SCFTP=ROHF MAXIT=30$END는 코드의 SCF 부분이 제한된 오픈 쉘 하트리(Open-Shell-Hartree-)를 수행해야 함을 명시한다.Fock(ROHF) 계산 후 결과가 30회 반복으로 수렴되지 않으면 종료한다.출력은 영어 텍스트 파일로 되어 있다.[8]
참고 항목
참조
- ^ Young, David C. (2001). "Appendix A. A.2.3 GAMESS". Computational Chemistry: A Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems. Wiley-Interscience. p. 335. doi:10.1002/0471220655. ISBN 978-0-471-33368-5.
- ^ 슈미트, 마이클 W.;Baldridge, 김 K;Boatz, 제리 A;당신, 스티븐 T., 고든, 마크 S., 옌젠, 1월 H.;Koseki, 시로, 마쓰나가, 니키타, 응우옌, Kiet A;.수, Shujun, Windus, 테레사는 L.;Dupuis, 미셸, 몽고메리 존 A.(1993년)."일반 원자 및 분자 전자 구조 시스템".필기장 전산 화학의. 14(11):1347–1363. doi:10.1002/jcc.540141112.S2CID 3358041..그 중에서 가장 인용 화학 기사의.
- ^ Gordon, Mark S.; Schmidt, Michael W. (2005). "Advances in electronic structure theory: GAMESS a decade later" (PDF). In Dykstra, C. E.; Frenking, G.; Lim, K. S.; Scusaria, G. E. (eds.). Theory and Applications of Computational Chemistry, the first 40 years. Amsterdam: Elsevier. pp. 1167–1189. doi:10.1016/B978-044451719-7/50084-6. ISBN 978-0-444-51719-7. Archived from the original (PDF) on 2018-04-13.
- ^ Schmidt, Michael W.; Baldridge, Kim K.; Boatz, Jerry A.; Jensen, Jan H.; Koseki, Shiro; Gordon, Mark S.; Nguyen, Kiet A.; Windus, Theresa L.; Elbert, Stephen T. (1990). "General Atomic and Molecular Electronic Structure System (GAMESS)". QCPE Bulletin. 10: 52–54. ISSN 0889-7514. OCLC 7963600.
- ^ 2014년 12월 현재 GAMESS 코드는 기여자를 마이클 W. 슈미트, 킴벌리 K. 발드리지, 제리 A로 나열하고 있다.보츠, 스티븐 T. 엘버트, 마크 고든, 얀 H. 젠슨, 시로 코세키, 니키타 마쓰나가, 키에트 A.응우옌, 슈준 J.수, 테레사 L.윈더스, 미셸 뒤푸이, 존 A.Montgomery, Ivana Adamovic, Christine Aikens, Yuri Alexeev, Pooja Arora, Andrey Asadchev, Rob Bell, Pradipta Bandyopadhyay, Jonathan Bentz, Brett Bode, Kurt Brorsen, Caleb Carlin, Galina Chaban, Wei Chen, Cheol Ho Choi, Paul Day, Albert Defusco, Nuwan Desilva, Tim Dudley, Dmitri Fedorov, Graham Fletcher, Mark Freitag, Kurt Glaesemann, Dan Kemp, Grant Merrill, Noriyuki Minezawa, Jonathan Mullin, Takeshi Nagata, Sean Nedd, Heather Netzloff, Bosiljka Njegic, Ryan Olson,Michael Pak, Spencer Pruitt, Luke Roskop, Jim Shoemaker, Lyudmila Slipchenko, Tony Smith, Sarom Sok, Jie Song, Tetsuya Taketsugu, Simon Webb, Peng Xu, Soohaeng Yoo, Federico Zahariev, Joe Ivanic, Aaron West, Laimutis Bytautas, Klaus Ruedenberg, Kimihiko Hirao, Takahito Nakajima, Takao Tsuneda, Muneaki Kamiya, Susumu Yanagisawa, Kiyoshi Yagi, Mahito Chiba, Seiken Tokura, Naoaki Kawakami, Frank Jensen, Visvaldas Kairys, Hui Li, Walt Stevens, David Garmer, Benedetta Mennucci, Jacopo Tomasi, Henry Kurtz, Prakashan Korambath, Toby Zeng, Mariusz Klobukowski, Mark Spackman, Hiroaki Umeda, Kazuo Kitaura, Karol Kowalski, Marta Wloch, Jeffrey Gour, Jesse Lutz, Wei Li, Piotr Piecuch, Monika Musial, Stanislaw Kucharski, Olivier Quinet, Benoit Champagne, Bernard Kirtman, Kazuya Ishimura, Michio Katouda, Shigeru Nagase, Anna Pomogaeva, Dan Chipman, Haruyuki Nakano, Feng Long Gu, Jacek Korchowiec, Marcin Makowski, Yuriko Aoki, Hirotoshi Mori, Eisaku Miyoshi, Tzvetelin Iordanov, Chet Swalina, Jonathan Skone, Sharon Hammes-Schiffer, Masato Kobayashi, Tomoko Akama, Tsuguki Touma, Takeshi Yoshikawam Yasuhiro Ikabata, Hiromi Nakai, Shuhua Li, Peifeng Su, Dejun Si, Nandun Thellamurege, Yali Wang, Hui Li, Roberto Peverati, Kim Baldridge, Maria Barysz, Casper Steinmann, Hiroya Nakata, 니시모토 요시오, 스테판 이루.
- ^ Gordon Research Group. "GAMESS Manual (Introduction)" (PDF).
- ^ "Gordon Group/GAMESS Homepage". www.msg.chem.iastate.edu.
- ^ Gordon Research Group. "GAMESS Manual (Input)" (PDF).
