몰카스

MOLCAS
몰카스
Molcas logo300.jpg
개발자Lund University에서 관리하는 Molcas 개발자 커뮤니티
안정적 해제
8.4 / 2019년 6월
운영 체제리눅스, 유닉스, 마이크로소프트 윈도우즈, Mac OS X
유형컴퓨터 화학
면허증학문의
웹사이트www.molcas.org

MOLCAS는 초기 연산 화학 프로그램으로 다수의 국제 기관이 공동 프로젝트로 개발한 프로그램이다.MOLCAS는 과학자들에 의해 개발되어 과학자들에 의해 이용된다.주로 상업적인 상품이 아니며, 주인(런드 대학)에게 재산을 생산하기 위해 팔리지 않는다.

프로그램의 초점은 지상 및 흥분 상태의 일반 전자 구조 계산 방법에 맞춰져 있다.MOLCAS는 CASCF(Complete Active Space) 수준에서 일반적이고 효과적인 다중 형상 SCF 계산에 대한 코드를 포함하지만, 또한 더 제한된 MCSCF 파형 함수(RASSCF)를 채택한다.또한 이 이론 수준에서 구배 기법을 사용하여 평형 및 전환 상태에 대한 기하학적 구조를 최적화하고 힘 장과 진동 에너지를 계산하는 것도 가능하다.MOLCAS에는 2차 섭동 이론 코드 CASPT2와 RASPT2도 포함되어 있다.

역사

MOLCAS 코드는 1980년대 후반 교수 그룹에 의해 만들어졌다.비외른 O. 룬드 대학의 루스.프로그램의 명칭은 분자(Jan Almlöf의 통합코드)와 CAS(Björn O가 개발한 완전한 활성공간 프로그램)의 조합이다.루스.

MOLCAS 2는 1992년에 발매되었다.IBM VM/XA용 테이프에 배포되었다.새로운 구성 상호작용 코드(제페 올센 작성), 새로운 일체형 코드(롤랜드 린드 작성), 커플링 클러스터 코드(코메니우스 대학교 작성)가 수록되어 있다.MOLCAS 4(1999)는 유닉스 또는 리눅스 운영 체제에서 실행되는 첫 번째 릴리스였다.2001년에는 코드 개발을 위한 분산형 모델을 특징으로 하는 MOLCAS 5가 출시되었다.[1]

2017년 9월에는 MOLCAS 코드의 대부분을 오픈 소스(LGPL 2.1 라이선스)로 브랜딩하여 OpenMolcas라는 이름을 붙였다.[2]

주요 특징

MOLCAS의 주요 기능은 Molcas 매뉴얼, Collection of Molcas 튜토리얼 및 MOLCAS: MOLCAS 6, MOLCAS 7, MOLCAS 8의 다른 버전에 대한 간행물에서 찾을 수 있다. MOLCAS 7.2는 JACS 컴퓨터 소프트웨어 리뷰에서 독립적으로 검토되었다.[3]

  • 아비니시오 하트리-Fock(HF), 밀도 기능 이론(DFT), 2차 뫼르-플레셋 섭동 이론, MSCF, MRCI, CC, 다중 형상 참조 2차 섭동 이론 CASPT2(MS 및 XMS 포함), RASPT2 파동 및 에너지[4]
  • HF, DFT, CASCF, RASSCF 파동특성에 기반한 분석 그라데이션 기하학적 최적화
  • HF, DFT, CASCF, CC, MBPT2 및 CASPT2에 대한 숄스키 분해(CD) 및 ID(RI) 분해능.
  • 해석 구배 및 비부정 결합 벡터.
  • 즉시 사용 가능한 보조 기본 함수 기법, 원자 CD 및 원자 컴팩트 CD.
  • DFT 기능의 CD/RI 그라데이션.
  • CASPT2 파형 기능을 기반으로 한 수치 구배 지오메트리 최적화.
  • 모든 파형 기능에 대한 흥분 상태 에너지 및 상태 평균 CASCF 파형 기능에서 흥분된 최적화된 기하학적 특성.
  • 고유한 RASSCF 상태 상호 작용 방법을 사용하여 CASCF/RASSCF 수준에서 계산된 흥분 상태의 전환 속성.
  • 용제 효과는 Onsager 구형 캐비티 모델 또는 PCM(Polarable continuum model)으로 치료할 수 있다.
  • 단백질과 분자 군집과 같은 시스템에 대한 QM과 분자역학 계산의 결합.
  • MC/MD 시뮬레이션을 위한 분자간 힘 장을 생성하기 위한 NEMO 절차. 이러한 힘 장에는 전기학, 유도, 분산 및 교환-억제 용어가 포함되며 개별 분자에 대한 계산에 기초한다.
  • 툴리 표면 호핑 분자 역학
  • 원뿔형 교차로 및 심의 국산화 및 특성화 방법
  • MOLCAS는 DMRG 코드(QCMaquis, Block, CheM2PS), MRCI 코드 Columbus, 분자역학 코드 SARC를 포함한 여러 계산 코드와 인터페이스가 있다.
  • MOLCAS에는 LUSCUS, GV, MolGUI 등 몇 가지 그래픽 사용자 인터페이스 코드가 있다.

참조

  1. ^ Veryazov, Valera; Widmark, Per-Olof; Serrano-Andrés, Luis; Lindh, Roland; Roos, Björn O. (2004). "2MOLCAS as a development platform for quantum chemistry software". International Journal of Quantum Chemistry. 100 (4): 626–635. doi:10.1002/qua.20166.
  2. ^ "OpenMolcas / Announcements / Molcas Forum".
  3. ^ Duncan, James A. (2009). "MOLCAS 7.2". JACS. 131 (6): 2416. doi:10.1021/ja900300h. PMID 19173643.
  4. ^ Aquilante, Francesco; Autschbach, Jochen; Carlson, Rebecca K.; Chibotaru, Liviu F.; Delcey, Mickaël G.; De Vico, Luca; Fdez. Galván, Ignacio; Ferré, Nicolas; Frutos, Luis Manuel; Gagliardi, Laura; Garavelli, Marco; Giussani, Angelo; Hoyer, Chad E.; Li Manni, Giovanni; Lischka, Hans; Ma, Dongxia; Malmqvist, Per Åke; Müller, Thomas; Nenov, Artur; Olivucci, Massimo; Pedersen, Thomas Bondo; Peng, Daoling; Plasser, Felix; Pritchard, Ben; Reiher, Markus; Rivalta, Ivan; Schapiro, Igor; Segarra-Martí, Javier; Stenrup, Michael; et al. (2016), "Molcas 8: New capabilities for multiconfigurational quantum chemical calculations across the periodic table" (PDF), Journal of Computational Chemistry, 37 (5): 506–541, doi:10.1002/jcc.24221, PMID 26561362

외부 링크