아포벡3C

APOBEC3C
아포벡3C
사용 가능한 구조
PDB휴먼 유니프로트 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스APOBC3C, A3C, APOBC1L, ARDC2, ARDC4, ARP5, PBI, bK150C2.3, 아폴리포단백질BmRNA편집효소부단위 3C
외부 IDOMIM : 607750 HomoloGene : 129856 GenCard : APOBCEC3C
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_014508

없음

RefSeq(단백질)

NP_055323

없음

장소(UCSC)Chr 22: 39.01 ~39.02 Mb없음
PubMed 검색[2]없음
위키데이터
인간 보기/편집

DNA dC->dU 편집효소 APOBEC-3C는 사람에게서 APOBEC3C [3][4]유전자에 의해 코드되는 단백질이다.

A3C는 다양한 레트로바이러스에 대한 제한 인자로 작용하는 A3 계열의 시티딘 탈아미나아제에 속한다.A3C는 바이러스 감염인자 Vif가 [5]없는 경우 HIV-1보다는 Simian 면역결핍 바이러스를 효과적으로 억제하는 것으로 보고되었다.A3C의 촉매 활성을 증강하는 것은 HIV-1 복제에 미미한 영향(Vif가 없는 경우)을 미쳤을 뿐이며, 반응성 바이러스 메커니즘은 [6]불분명하다.A3C는 다른 [7][8][9][10][11]바이러스도 억제하는 것으로 나타났다.

기능.

이 유전자는 시티딘탈아미나아제 유전자의 일원이다.그것은 22번 염색체의 유전자 복제로 인해 발생하는 것으로 생각되는 클러스터에서 발견된 7개의 관련 유전자 또는 유사 유전자 중 하나이다.클러스터 구성원은 C to U RNA 편집 시티딘 탈아미나아제 APOBEC1과 구조적으로 기능적으로 관련된 단백질을 부호화한다.반대로 A3 단백질은 단일 가닥 DNA에 존재하는 [12][13][14][15][16]시티딘을 효소적으로 우리딘으로 변환한다.HIV-1에 대한 A3C의 항바이러스 활성을 결정하기 위해 A3C의 루프 1에 [17]있는 2개의 잔류물이 입증되었다.

구조.

A3C의 결정 구조는 추정 HIV-1 vif 결합 [18][19]영역을 나타냅니다.A3C는 탈아미나아제 비의존적 방식으로 [20]ORF1p 단백질과 직접 상호작용하여 LINE-1 요소를 억제하는 것으로 확인되었다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000244509 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (March 2002). "An anthropoid-specific locus of orphan C to U RNA-editing enzymes on chromosome 22". Genomics. 79 (3): 285–96. doi:10.1006/geno.2002.6718. PMID 11863358.
  4. ^ "Entrez Gene: APOBEC3C apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3C".
  5. ^ Yu Q, Chen D, König R, Mariani R, Unutmaz D, Landau NR (December 2004). "APOBEC3B and APOBEC3C are potent inhibitors of simian immunodeficiency virus replication". The Journal of Biological Chemistry. 279 (51): 53379–86. doi:10.1074/jbc.M408802200. PMID 15466872.
  6. ^ Jaguva Vasudevan AA, Hofmann H, Willbold D, Häussinger D, Koenig BW, Münk C (April 2017). "Enhancing the Catalytic Deamination Activity of APOBEC3C Is Insufficient to Inhibit Vif-Deficient HIV-1". Journal of Molecular Biology. 429 (8): 1171–1191. doi:10.1016/j.jmb.2017.03.015. PMID 28315663.
  7. ^ Baumert TF, Rösler C, Malim MH, von Weizsäcker F (September 2007). "Hepatitis B virus DNA is subject to extensive editing by the human deaminase APOBEC3C". Hepatology. 46 (3): 682–9. doi:10.1002/hep.21733. PMID 17625792.
  8. ^ Suspène R, Aynaud MM, Koch S, Pasdeloup D, Labetoulle M, Gaertner B, Vartanian JP, Meyerhans A, Wain-Hobson S (August 2011). "Genetic editing of herpes simplex virus 1 and Epstein-Barr herpesvirus genomes by human APOBEC3 cytidine deaminases in culture and in vivo". Journal of Virology. 85 (15): 7594–602. doi:10.1128/JVI.00290-11. PMC 3147940. PMID 21632763.
  9. ^ Köck J, Blum HE (May 2008). "Hypermutation of hepatitis B virus genomes by APOBEC3G, APOBEC3C and APOBEC3H". The Journal of General Virology. 89 (Pt 5): 1184–91. doi:10.1099/vir.0.83507-0. PMID 18420796.
  10. ^ Li D, Liu J, Kang F, Guan W, Gao X, Wang Y, Sun D (October 2011). "Core-APOBEC3C chimerical protein inhibits hepatitis B virus replication". Journal of Biochemistry. 150 (4): 371–4. doi:10.1093/jb/mvr086. PMID 21746770.
  11. ^ Ahasan MM, Wakae K, Wang Z, Kitamura K, Liu G, Koura M, Imayasu M, Sakamoto N, Hanaoka K, Nakamura M, Kyo S, Kondo S, Fujiwara H, Yoshizaki T, Mori S, Kukimoto I, Muramatsu M (February 2015). "APOBEC3A and 3C decrease human papillomavirus 16 pseudovirion infectivity". Biochemical and Biophysical Research Communications. 457 (3): 295–9. doi:10.1016/j.bbrc.2014.12.103. hdl:2297/44628. PMID 25576866.
  12. ^ Yu Q, König R, Pillai S, Chiles K, Kearney M, Palmer S, Richman D, Coffin JM, Landau NR (May 2004). "Single-strand specificity of APOBEC3G accounts for minus-strand deamination of the HIV genome". Nature Structural & Molecular Biology. 11 (5): 435–42. doi:10.1038/nsmb758. PMID 15098018.
  13. ^ Harris RS, Petersen-Mahrt SK, Neuberger MS (November 2002). "RNA editing enzyme APOBEC1 and some of its homologs can act as DNA mutators". Molecular Cell. 10 (5): 1247–53. doi:10.1016/s1097-2765(02)00742-6. PMID 12453430.
  14. ^ Harris RS, Sheehy AM, Craig HM, Malim MH, Neuberger MS (July 2003). "DNA deamination: not just a trigger for antibody diversification but also a mechanism for defense against retroviruses". Nature Immunology. 4 (7): 641–3. doi:10.1038/ni0703-641. PMID 12830140.
  15. ^ Harris RS, Bishop KN, Sheehy AM, Craig HM, Petersen-Mahrt SK, Watt IN, Neuberger MS, Malim MH (June 2003). "DNA deamination mediates innate immunity to retroviral infection". Cell. 113 (6): 803–9. doi:10.1016/s0092-8674(03)00423-9. PMID 12809610.
  16. ^ Yu Q, Chen D, König R, Mariani R, Unutmaz D, Landau NR (December 2004). "APOBEC3B and APOBEC3C are potent inhibitors of simian immunodeficiency virus replication". The Journal of Biological Chemistry. 279 (51): 53379–86. doi:10.1074/jbc.M408802200. PMID 15466872.
  17. ^ Ayyappan Jaguva Vasudevan, Ananda; Balakrishnan, Kannan; G. W. Gertzen, Christoph; Borvető, Fanni; Zhang, Zeli; Sangwiman, Anucha; Held, Ulrike; Küstermann, Caroline; Banerjee, Sharmistha; Schumann, Gerald G.; Häussinger, Dieter (October 2020). "Loop 1 of APOBEC3C regulates its antiviral activity against HIV-1". Journal of Molecular Biology: S0022283620305891. doi:10.1016/j.jmb.2020.10.014.
  18. ^ Kitamura S, Ode H, Nakashima M, Imahashi M, Naganawa Y, Kurosawa T, Yokomaku Y, Yamane T, Watanabe N, Suzuki A, Sugiura W, Iwatani Y (October 2012). "The APOBEC3C crystal structure and the interface for HIV-1 Vif binding". Nature Structural & Molecular Biology. 19 (10): 1005–10. doi:10.1038/nsmb.2378. PMID 23001005.
  19. ^ Zhang Z, Gu Q, Jaguva Vasudevan AA, Jeyaraj M, Schmidt S, Zielonka J, Perković M, Heckel JO, Cichutek K, Häussinger D, Smits SH, Münk C (November 2016). "Vif Proteins from Diverse Human Immunodeficiency Virus/Simian Immunodeficiency Virus Lineages Have Distinct Binding Sites in A3C". Journal of Virology. 90 (22): 10193–10208. doi:10.1128/JVI.01497-16. PMC 5105656. PMID 27581978.
  20. ^ Horn AV, Klawitter S, Held U, Berger A, Vasudevan AA, Bock A, Hofmann H, Hanschmann KM, Trösemeier JH, Flory E, Jabulowsky RA, Han JS, Löwer J, Löwer R, Münk C, Schumann GG (January 2014). "Human LINE-1 restriction by APOBEC3C is deaminase independent and mediated by an ORF1p interaction that affects LINE reverse transcriptase activity". Nucleic Acids Research. 42 (1): 396–416. doi:10.1093/nar/gkt898. PMC 3874205. PMID 24101588.

추가 정보

외부 링크

  • UCSC Genome Browser의 Human APOBC3C 게놈 위치 및 APOBC3C 유전자 상세 페이지.
  • PDB for UniProt: Q9NRW3(DNA dC->dU 편집 효소 APOBEC-3C)에서 PDBe-KB에서 사용 가능한 모든 구조 정보의 개요.