SATB1

SATB1
SATB1
사용가능 구조물
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭SATB1, SATB 홈박스1, DEFDA, KTZSL
외부 IDOMIM : 602075 MGI : 105084 호몰로진 : 2232 유전자 카드 : SATB1
오솔로지스
종.인간을마우스
엔트레즈

6304

20230

앙상블

ENSG00000182568

ENSMUSG00000023927

유니프로트

Q01826

Q60611

RefSeq(mRNA)
RefSeq (단백질)
위치(UCSC)Chr 3: 18.35 – 18.45 MbChr 17: 52.04 – 52.14 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
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SATB1(특수 AT-rich 서열 결합 단백질-1)은 인간에서 SATB1 [5]유전자에 의해 암호화되는 단백질입니다.다수의 DNA 결합 도메인(CUT1, CUT2 및 호메오박스 도메인)을 갖는 이량체/사량체 전사 인자[6].SATB1은 매트릭스 부착 영역(MAR)[8][9][10][11]을 포함하는 BUR(base unpairing region)라고 불리는 높은 풀림 성향을[7] 가진 AT-풍부한 DNA 서열에 특이적으로 결합합니다.

기능.

SATB1은 공간 유전체 조직을 조절하고 이후 고차 크로마틴 구조를 유전자 [12]조절과 통합하기 위한 핵심 요소입니다.SATB1은 MARs에 결합하고 이것들을 핵 매트릭스에 연결함으로써 크로마틴 [13][14][15]루프를 생성합니다.크로마틴 루프 구조를 변경함으로써 SATB1은 유전자 [16]전사를 변경할 수 있습니다.DNA에서 SATB1 결합 부위의 대부분은 또 다른 중요한 염색질 조직체인 CTCF에 의해서도 [17]차지됩니다.

면역계

SATB1은 T세포의 발달에 많은 역할을 합니다.

SATB1은 ThPOK, Runx3, CD4, CD8, Treg factor Foxp3 등 T세포 발달 과정에서 계통별 인자의 발현을 조절하는 역할을 합니다.SATB1 결핍 흉선세포는 부적절한 T 계통에 진입하여 NKT 및 Treg 하위 [18]집합을 생성하지 못합니다.Treg 결핍은 이후 Satb1 결핍 마우스 [19]모델에서 자가면역 표현형을 야기합니다.자가면역 표현형은 TCRα 인핸서 및 TCR 로커스의 SATB1 의존적 공간 재배열의 손실과 관련이 있으며, Rag1 및 Rag2 [21]유전자의 하향 조절을 통해 TCR 재조합을[20] 제어합니다.

또한, SATB1은 NuRD 크로마틴 리모델링 복합체의 일부로서 IL-2Ralpha 및 IL-2 로커스의 [22][23]SATB1 결합 부위로 HDAC1을 모집하여 IL-2Ralpha 및 IL-2 발현을 억제하여 T 세포 사이토카인 발현을 조절합니다.

기타조직

SATB1은 표피 분화,[24] 뇌 발달,[25] X-염색체 비활성화,[26] 배아줄기세포 [27]분화 등 다양한 세포학적 과정에서 역할을 하는 것으로 기술되어 왔습니다.

구조.

SATB1은 ULD, CUTL, CUT1-CUT2 탠덤 및 홈박스 도메인을 포함합니다.

N 말단의 ULD 및 CUTL 도메인은 SATB1의 [28]사중합체화 및 후속 DNA 결합에 중요합니다.이 N 말단 부위는 세포 사멸 동안 caspase-6[29][30] 및 caspase-3에[31] 의해 분리되어 염색질로부터 해리될 수 있습니다.

CUT1 도메인은 세 번째 나선이 DNA의 주요 홈으로 깊게 들어가 [10]염기와 직접 접촉하는 SATB1이 MAR에 결합하는 데 필수적인 5개 나선 구조를 포함합니다.CUT1은 MAR 부위에 결합하는 데 필수적이지만 CUT2 도메인은 조제할 [9]수 있습니다.

SATB1 홈오박스 도메인은 그 자체로 낮은 DNA 결합 능력을 부여하지만, CUT 도메인과 [11][9]결합하여 SATB1의 DNA 결합 친화도와 특이성을 증가시키는 것으로 밝혀졌습니다.

임상적 의의

희귀 신경발달장애

SATB1의 희귀한 고관통 이형 접합체는 신경 발달 [32]장애에서 확인되었습니다.

DNA 결합 도메인(CUT1 및 CUT2) 중 하나의 미스센스 돌연변이는 글로벌 발달 지연, 중간에서 심각한 지적 장애, 이형 특징, 치아 이상 및 조기 발병 뇌전증(den Hoed-de Boer-Voisin syndrome; DHDBV)[33]을 특징으로 하는 신경 발달 증후군을 유발합니다.

넌센스 및 프레임 시프트 돌연변이는 가변적으로 손상된 지적 발달과 함께 가벼운 글로벌 발달 지연으로 특징지어지는 별개의 신경 발달 상태와 관련이 있습니다(이형성 안면부 및 치과 이상 징후가 있는 개발 지연; DEFDA).[34]

암

SATB1의 더 높은 발현 수준은 유방암,[35] 교종,[36] 전립선암,[37][39] 간암[38] 및 난소암에서 종양 성장을 촉진하는 것으로 설명되었으며, SATB1 수준은 이러한 형태의 암 중 일부에서 예후에 중요성을 갖습니다.실제로 SATB1 수치를 낮추는 것은 골육종과[40] 폐선암 [41]세포의 증식을 억제하는 것으로 나타났습니다.

한편, Satb1은 CD8+ 및 CD4+ T 세포에서 PD-1 [42]발현을 조절함으로써 항종양 면역에 중요한 역할을 하는 것으로 입증되었습니다.Satb1을 발현하지 않는 T세포는 항종양 [42]활성이 감소하는 것으로 나타났으며, CD4+ T세포에서 Satb1 발현이 부족한 마우스는 종양 내 3차 림프구조가 [43]발달합니다.

상호작용

SATB1은 다음과 상호작용하는 것으로 나타났습니다.

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