미모토페

Mimotope

미모토프는 종종 펩타이드이며 에피토프의 구조를 모방한다.이러한 특성 때문에 그것은 에피토프에 의해 유도된 것과 유사한 항체 반응을 일으킨다.주어진 에피토프 항원에 대한 항체는 그 에피토프를 모방하는 미모토프를 인식할 것이다.미모토프는 일반적으로 바이오패닝을 통해 파지 디스플레이 라이브러리에서 얻을 수 있습니다.미모토프를 이용한 백신이 개발되고 있다.미모토프는 펩타이드 압타머의 일종이다.

1986년 [1]마리오 가이센에 의해 미모토페라는 용어가 처음 만들어졌을 때, 그것은 에피토프를 모방하는 펩타이드를 설명하기 위해 사용되었다.그러나 이 개념은 모든 유형의 결합 부위의 펩타이드 모방체를 참조하도록 확장되었다.결합 부위의 모방으로서, 미모토프 분석은 에피토프 [2]매핑, 약물 표적 식별 및 단백질 상호작용 네트워크 [3][4]유추에 널리 사용되어 왔다.게다가, 미모토프는 또한 새로운 [5]진단, 치료제[6],[7] 백신 개발에서도 가능성을 보여왔다.또한, 다양한 반도체 및 기타 물질에 대한 모토프에 의해 매개되는 특별한 친화성은 새로운 물질 및 새로운 [8]에너지 연구에서 매우 고무적인 가능성을 보여주었다.따라서 mimotope에 대한 정보를 특별한 데이터베이스로 수집하는 것이 좋습니다.2010년에는 MimoDB 데이터베이스 버전 1.0이 [9]출시되었습니다.10716개의 펩타이드를 1229세트로 묶었다.이러한 펩타이드는 571편의 논문에 보고된 파지 표시 랜덤 펩타이드 라이브러리의 바이오패닝 결과에서 추출되었다.MimoDB 데이터베이스가 최신 버전 2.0으로 업데이트되었습니다.[10]버전 2.0에서는 849개의 논문으로부터 수집된 15633개의 펩타이드가 있으며 1818세트로 분류되었다.패닝 실험과 그 결과에 대한 핵심 데이터 외에도 대상, 템플릿, 라이브러리 및 구조에 대한 광범위한 배경 정보가 포함됩니다.바이오 인포메이션이 새로운 모델, 알고리즘 및 프로그램을 개발하고 평가하기 위한 벤치마크도 함께 작성되었다.또한 MimoDB 데이터베이스는 단순하고 고급 검색, 구조 시각화, BLAST 및 정렬 보기를 위한 도구를 제공합니다.실험 생물학자들은 데이터베이스를 가상 대조군으로 쉽게 사용하여 가능한 표적 관련 펩타이드를 제외할 수 있습니다.MimoDB 데이터베이스는[11] 자유롭게 사용할 수 있습니다.

레퍼런스

  1. ^ Geysen, HM; Rodda, SJ; Mason, TJ (July 1986). "A priori delineation of a peptide which mimics a discontinuous antigenic determinant". Molecular Immunology. 23 (7): 709–15. doi:10.1016/0161-5890(86)90081-7. PMID 2432410.
  2. ^ Smith, GP; Petrenko, VA (1997-04-01). "Phage Display". Chemical Reviews. 97 (2): 391–410. doi:10.1021/cr960065d. PMID 11848876.
  3. ^ Tong, AH; Drees, B; Nardelli, G; Bader, GD; Brannetti, B; Castagnoli, L; Evangelista, M; Ferracuti, S; Nelson, B; Paoluzi, S; Quondam, M; Zucconi, A; Hogue, CW; Fields, S; Boone, C; Cesareni, G (2002-01-11). "A combined experimental and computational strategy to define protein interaction networks for peptide recognition modules". Science. 295 (5553): 321–4. doi:10.1126/science.1064987. PMID 11743162. S2CID 17604414.
  4. ^ Thom, G; Cockroft, AC; Buchanan, AG; Candotti, CJ; Cohen, ES; Lowne, D; Monk, P; Shorrock-Hart, CP; Jermutus, L; Minter, RR (2006-05-16). "Probing a protein-protein interaction by in vitro evolution". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103 (20): 7619–24. Bibcode:2006PNAS..103.7619T. doi:10.1073/pnas.0602341103. PMC 1458619. PMID 16684878.
  5. ^ Hsiung, PL; Hardy, J; Friedland, S; Soetikno, R; Du, CB; Wu, AP; Sahbaie, P; Crawford, JM; Lowe, AW; Contag, CH; Wang, TD (April 2008). "Detection of colonic dysplasia in vivo using a targeted heptapeptide and confocal microendoscopy". Nature Medicine. 14 (4): 454–8. doi:10.1038/nm1692. PMC 3324975. PMID 18345013.
  6. ^ Macdougall, IC; Rossert, J; Casadevall, N; Stead, RB; Duliege, AM; Froissart, M; Eckardt, KU (2009-11-05). "A peptide-based erythropoietin-receptor agonist for pure red-cell aplasia". The New England Journal of Medicine. 361 (19): 1848–55. doi:10.1056/NEJMoa074037. PMID 19890127.
  7. ^ Knittelfelder, R; Riemer, AB; Jensen-Jarolim, E (April 2009). "Mimotope vaccination--from allergy to cancer". Expert Opinion on Biological Therapy. 9 (4): 493–506. doi:10.1517/14712590902870386. PMC 3049225. PMID 19344285.
  8. ^ Lee, YJ; Yi, H; Kim, WJ; Kang, K; Yun, DS; Strano, MS; Ceder, G; Belcher, AM (2009-05-22). "Fabricating genetically engineered high-power lithium-ion batteries using multiple virus genes". Science. 324 (5930): 1051–5. Bibcode:2009Sci...324.1051L. doi:10.1126/science.1171541. PMID 19342549. S2CID 32017913.
  9. ^ Ru, B; Huang, J; Dai, P; Li, S; Xia, Z; Ding, H; Lin, H; Guo, F; Wang, X (2010-11-15). "MimoDB: a new repository for mimotope data derived from phage display technology". Molecules (Basel, Switzerland). 15 (11): 8279–88. doi:10.3390/molecules15118279. PMC 6259156. PMID 21079566.
  10. ^ Huang, J; Ru, B; Zhu, P; Nie, F; Yang, J; Wang, X; Dai, P; Lin, H; Guo, FB; Rao, N (2011-11-03). "MimoDB 2.0: a mimotope database and beyond". Nucleic Acids Research. 40 (1): D271–7. doi:10.1093/nar/gkr922. PMC 3245166. PMID 22053087.
  11. ^ "The MimoDB database". Archived from the original on 2012-11-16. Retrieved 2011-11-07.


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