메타카스파제

Metacaspase

메타카스파스는 C14 등급의 사이스틴 프로테아제 멤버로, 따라서 캐스파스, 직교, 파라카스파스와 관련이 있다.[1]메타캐시스는 아스파테이트 특유의 캐스파시스와 대조적으로 아르기닌/리신 특유의 것이다.[2]

구조 및 계통발생 분포

원핵생물

원형과 박테리아에는 광범위한 도메인 조직을 가진 여러 메타캐시스가 있다.[3]프로카리오테 메타카스파아제 다양성에 기초해 직교종은 메타카스파아제 하위등급으로 볼 수 있다.메타캐스파스 및 직교스파스파스 클래스 모두에 공통적으로 P1 위치의 기본 잔류물(arginine 또는 리신)에 대한 특수성이 있다.이 순간 기질 특이성이 실제 캐스파이스처럼 산성 잔류물(아스파르트산)으로 변하는 구조적 변형은 보고되지 않았다.

에우카리오테스

메타카스파아제는 식물, 곰팡이, "양생자"에서 발견되지만 슬라임 곰팡이나 동물에서는 발견되지 않는다.

바이러스

감염을 강화하기 위해 숙주 신진대사를 다시 하는 데 영향을 줄 수 있는 바이러스성 메타카스파스가 바다에 널리 퍼져 있다.[4]

제1종

제1형 메타카스파아제는 아미노-단자 프롤라인 또는 글루타민이 풍부한 LSD 아연 아연 손가락 유사 도메인으로 특징지어진다.[5]이 유형은 동물 이외의 원핵생물이나 진핵생물에서 찾을 수 있다.

타입 II

제2형은 특정 녹조류와 육지식물에서만 발견되는데, 최근 한 가지 예외로 모노시가 브레비콜리스(Choanoflagellate)의 게놈에서 제1형과 제2형 메타카스파아시스가 모두 발견된 경우는 두 진핵생물 사이의 비정상적인 수평 유전자 전달의 결과일 가능성이 있다.[6]이 그룹은 긴 링커 영역과 아미노-단자 친 도메인이 없는 것이 특징이다.


알려진 함수

메타캐스파스는 캐스파스와 유사하게 식물과 곰팡이 모두에서 프로그램된 세포사멸을 유도한다.[7][8][9]

참조

  1. ^ Uren AG, O'Rourke K, Aravind LA, et al. (Oct 2000). "Identification of paracaspases and metacaspases: two ancient families of caspase-like proteins, one of which plays a key role in MALT lymphoma". Molecular Cell. 6 (4): 961–7. doi:10.1016/S1097-2765(05)00086-9. PMID 11090634.
  2. ^ Vercammen D, van de Cotte B, De Jaeger G, et al. (Oct 2004). "Type II metacaspases Atmc4 and Atmc9 of Arabidopsis thaliana cleave substrates after arginine and lysine". J Biol Chem. 279 (44): 45329–36. doi:10.1074/jbc.M406329200. PMID 15326173.
  3. ^ Asplund-Samuelsson J, Bergman B, Larsson J (Nov 2012). "Prokaryotic caspase homologs: phylogenetic patterns and functional characteristics reveal considerable diversity". PLOS ONE. 7 (11): e49888. Bibcode:2012PLoSO...749888A. doi:10.1371/journal.pone.0049888. PMC 3501461. PMID 23185476.
  4. ^ Wilson W, et al. (2017). "Genomic exploration of individual giant ocean viruses". The ISME Journal. 11 (8): 1736–1745. doi:10.1038/ismej.2017.61. PMC 5520044. PMID 28498373.
  5. ^ Vercammen D, van de Cotte B, De Jaeger G, et al. (Oct 2004). "Type II metacaspases Atmc4 and Atmc9 of Arabidopsis thaliana cleave substrates after arginine and lysine". J Biol Chem. 279 (44): 45329–36. doi:10.1074/jbc.M406329200. PMID 15326173.
  6. ^ Nedelcu AM, Miles IH, Fagir AM, Karol K (Aug 2008). "Adaptive eukaryote-to-eukaryote lateral gene transfer: stress-related genes of algal origin in the closest unicellular relatives of animals". J Evol Biol. 21 (6): 1852–60. doi:10.1111/j.1420-9101.2008.01605.x. PMID 18717747.
  7. ^ Madeo F, Herker E, Maldener C, et al. (Apr 2002). "A caspase-related protease regulates apoptosis in yeast". Molecular Cell. 9 (4): 911–7. doi:10.1016/S1097-2765(02)00501-4. PMID 11983181.
  8. ^ Bozhkov PV, Suarez MF, Filonova LH, et al. (Oct 2005). "Cysteine protease mcII-Pa executes programmed cell death during plant embryogenesis". Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (40): 14463–8. Bibcode:2005PNAS..10214463B. doi:10.1073/pnas.0506948102. PMC 1242326. PMID 16183741.
  9. ^ Khan MA, Chock PB, Stadtman ER (Nov 2005). "Knockout of caspase-like gene, YCA1, abrogates apoptosis and elevates oxidized proteins in Saccharomyces cerevisiae". Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (48): 17326–31. Bibcode:2005PNAS..10217326K. doi:10.1073/pnas.0508120102. PMC 1287485. PMID 16301538.

참고 항목