술폴로발레스
Sulfolobales| 술폴로발레스 | |
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| Sulfolobus 바이러스 STSV1에 감염된 Sulfolobus의 전자 현미경 사진. Bar = 1μm. | |
과학적 분류  | |
| 도메인: | 고세균 |
| 왕국: | 프로테오아르카이오타속 |
| 슈퍼문: | TACK 그룹 |
| 문: | 열단백질 |
| 클래스: | 열단백질 |
| 주문: | 술폴로발레스 Stetter, 1989년 |
| 가족 | |
| 동의어 | |
분류학에서 술폴로발레스는 열단백질목의 [1]한 목이다.
계통발생학
현재 승인된 분류법은 LPSN(Standing in Nomenclature)과 NCBI([1]National Center for Biotechnology Information)를 가진 원핵생물명목록에 기초하고 있다.
| 16S rRNA 기반 LTP_12_2021[3][4][5] | 53 마커단백질 베이스 GTDB 07-RS207[6][7][8] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DNA이식
Sulfolobus solfataricus의 DNA 손상제인 UV-Radiation, Bleomycin 또는 mitomycin C에 대한 피폭은 세포 [9]응집을 유도한다.pH 또는 온도 이동과 같은 다른 물리적 스트레스 인자는 응집을 유도하지 않으며, 응집 유도가 특히 DNA 손상에 의해 발생함을 시사한다.Ajon 등은 [10]UV 유도 세포 집적이 높은 빈도로 염색체 마커 교환을 매개한다는 것을 보여주었다.재조합률은 유도되지 않은 배양물의 재조합률을 최대 3배 이상 초과했다.프롤스 외,[9][11] 아죤 [10]외UV 유도 DNA 전달 과정과 후속 상동 재조합 수리가 염색체 무결성을 유지하기 위한 중요한 메커니즘을 나타낸다는 가설을 세웠다.이 반응은 성적인 상호작용의 원시적인 형태일 수 있는데, 이것은 DNA [citation needed]손상의 상동 재조합 수복으로 이어지는 세포 사이의 DNA 이동과 관련이 있는 더 잘 연구된 박테리아 변형과 유사합니다.또 다른 근연종인 술폴로부스산칼다리우스는 유전자 [12]교환에 의한 재조합 빈도를 높인다.
업 조작
 | 이 섹션에는 (UniProt ID가 있는) ups 구성 설명에 대한 정보가 누락되어 있습니다.(2020년 5월) |
Sulfolobus종의 ups(UV유도필러스) 오퍼론은 UV 조사에 의해 고도로 유도된다.이 오퍼론에 의해 코드된 필리는 세포 간 후속 DNA 교환에 필요한 세포 응집 촉진에 사용되며, 결과적으로 상동 [13]재조합을 일으킨다.
Sulfolobales acidocaldarius ups 오퍼론의 연구는 오퍼론의 하류 유전자 중 하나인 saci-1497이 UV 손상 DNA를 손상시키는 핵산내분해효소 III를 코드하고, 오퍼론의 다른 유전자인 saci-1500은 홀 재조합과 같은 상동할 수 있는 RecQ와 유사한 헬리카제를 코드하는 것을 보여주었습니다.Saci-1497과 Saci-1500은 전달된 DNA를 [13]템플릿으로 사용하는 상동 재조합 기반 DNA 복구 메커니즘에서 기능하는 것으로 제안되었다.따라서 업 시스템은 상동 재조합과 결합하여 술폴로발레스를 DNA 손상 [13]위협으로부터 구하는 DNA 손상 반응을 제공하는 것으로 생각된다.
레퍼런스
- ^ a b Sayers; et al. "Sulfolobales". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2021-06-05.
- ^ J.P. Euzéby. "Sulfolobales". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2021-11-17.
- ^ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
- ^ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
- ^ "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2021.
- ^ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
- ^ "ar53_r207.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
- ^ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
- ^ a b Fröls S, Ajon M, Wagner M, Teichmann D, Zolghadr B, Folea M, Boekema EJ, Driessen AJ, Schleper C, Albers SV (2008). "UV-inducible cellular aggregation of the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus is mediated by pili formation" (PDF). Mol. Microbiol. 70 (4): 938–52. doi:10.1111/j.1365-2958.2008.06459.x. PMID 18990182.
- ^ a b Ajon M, Fröls S, van Wolferen M, Stoecker K, Teichmann D, Driessen AJ, Grogan DW, Albers SV, Schleper C (2011). "UV-inducible DNA exchange in hyperthermophilic archaea mediated by type IV pili" (PDF). Mol. Microbiol. 82 (4): 807–17. doi:10.1111/j.1365-2958.2011.07861.x. PMID 21999488.
- ^ Fröls S, White MF, Schleper C (2009). "Reactions to UV damage in the model archaeon Sulfolobus solfataricus". Biochem. Soc. Trans. 37 (Pt 1): 36–41. doi:10.1042/BST0370036. PMID 19143598.
- ^ Wood ER, Ghané F, Grogan DW (1997). "Genetic responses of the thermophilic archaeon Sulfolobus acidocaldarius to short-wavelength UV light". J. Bacteriol. 179 (18): 5693–8. doi:10.1128/jb.179.18.5693-5698.1997. PMC 179455. PMID 9294423.
- ^ a b c d van Wolferen M, Ma X, Albers SV (2015). "DNA Processing Proteins Involved in the UV-Induced Stress Response of Sulfolobales". J. Bacteriol. 197 (18): 2941–51. doi:10.1128/JB.00344-15. PMC 4542170. PMID 26148716.
추가 정보
과학 저널
- Judicial Commission of the International Committee on Systematics of Prokaryotes (2005). "The nomenclatural types of the orders Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales and Verrucomicrobiales are the genera Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus, Thermococcus, Thermoproteus and Verrucomicrobium, respectively. Opinion 79". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 55 (Pt 1): 517–518. doi:10.1099/ijs.0.63548-0. PMID 15653928.
- Driessen, Arnold; Yang, Nuan (January 8, 2014). "Deletion of cdvB paralogous genes of Sulfolobus acidocaldarius impairs cell division". Extremophiles. 18 (2): 331–339. doi:10.1007/s00792-013-0618-5. PMID 24399085. S2CID 14445065.
- Euzeby JP; Tindall BJ (2001). "Nomenclatural type of orders: corrections necessary according to Rules 15 and 21a of the Bacteriological Code (1990 Revision), and designation of appropriate nomenclatural types of classes and subclasses. Request for an Opinion". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2): 725–727. doi:10.1099/00207713-51-2-725. PMID 11321122.
- Cavalier-Smith, T (2002). "The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 1): 7–76. doi:10.1099/00207713-52-1-7. PMID 11837318.
과학 서적
- Reysenbach, A-L (2001). "Class I. Thermoprotei class. nov.". In DR Boone; RW Castenholz (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria (2nd ed.). New York: Springer Verlag. p. 169. ISBN 978-0-387-98771-2.
- Stetter, KO (1989). "Order III. Sulfolobales ord. nov. Family Sulfolobaceae fam. nov.". In JT Staley; MP Bryant; N Pfennig; JG Holt (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 3 (1st ed.). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. p. 169.
