LDB3

LDB3
LDB3
Protein LDB3 PDB 1rgw.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭LDB3, CMD1C, CMPD3, CYPER, LDB3Z1, LDB3Z1, LDB3Z4, LVNC3, MFM4, 오라클, PDLIM6, ZASP, CMH24, LIM 도메인 바인딩 3
외부 IDOMIM: 605906 MGI: 1344412 HomoloGene: 134626 GeneCard: LDB3
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)
RefSeq(단백질)
위치(UCSC)Chr 10: 86.67 – 86.74MbChr 14: 34.25 – 34.31Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

LIM 도메인 바인딩 3(LDB3)은 인간에서 LDB3 유전자의해 인코딩되는 단백질이다.[5][6]ZASP는 단백질의 에니그마 하위군에 속하며 심장 및 골격근에서 액틴과의 상호작용을 통해 수축 중에 사르케르(근육의 기본 단위)를 안정화시킨다.ZASP 유전자의 돌연변이는 여러 근육 질환과 연관되어 있다.

구조

ZASP는 PDZ 도메인 함유 단백질이다.PDZ 모티브는 80-120개의 아미노산 잔류물로 구성된 모듈식 단백질-단백질 상호작용 영역이다.PDZ 도메인 함유 단백질은 세포골격계 조립체 또는 막 단백질의 표적화 및 군집화에 관련된 다른 단백질과 상호작용을 한다.ZASP는 N-단자 PDZ 도메인을 통해 알파-액틴-2와 상호작용하고 C-단자 LIM 도메인을 통해 단백질 키나아제 C와 상호작용한다.LIM 도메인은 아연 결합 모듈 2개를 포함하는 50-60개의 아미노산에 의해 정의되는 시스테인이 풍부한 모티브다.이 단백질은 또한 미오제닌과의 세 구성원 모두와 상호작용을 한다.[5]

인간 ZASP는 16 exon의 대체 스플라이싱에 기초하여 6개의 뚜렷한 등소 형태로 심장과 골격 세포에 존재할 수 있다.[7]거기에는 2ZASP 짧은 형태(Uniprot ID:O75112-6, 31.0kDa, 283아미노산,[8]과 Uniprot ID:O75112-5,35.6 kDa, 330아미노산) 있다.;[9], 4ZASP 긴 형태(Uniprot ID:O75112-4,42.8 kDa, 398아미노산,[10]Uniprot ID:O75112-3,50.6 kDa, 470종의 아미노산,[11]Uniprot ID:O75112-2,66.6 kDa, 617아미노산,[12]과 Uniprot ID:O75112,77.1 kDa, 727아미노산 교류.ids). 모든 ZASP isoforms는 N-단자 PDZ 도메인을 가지고 있으며, ZASP 유사 모티브(ZM)로 알려진 내부 보존 시퀀스, 그리고 4개의 긴 이소폼은 3개의 C-단자 LIM 도메인을 가지고 있다.[13][14][7]

함수

ZASP는 수축 중 사물의 구조적 무결성을 유지하기 위한 기능으로 단백질 키나제 A 신호에 관여하는 것으로 나타났다.[15]ZASP는 또한 TLN1 단백질과 함께 α5β1 통합체를 공동 활성화하는 것으로 나타났다.[16]

임상적 유의성

ZASP의 돌연변이는 근세동증,[17] 확장 심근병증,[18][19] 부정맥 유발 우심실 심근병증,[20] 비압축성 심근병증,[18][21] 근위축증과 관련이 있다.[17]

상호작용

ZASP의 PDZ 도메인알파 액티닌-2[6][22] C-단자를, ZM은 알파 액티닌-2의 로드 도메인을 바인딩한다.[23]LIM 도메인단백질 키나아제 C와 상호작용하는 것으로 나타났다.[22][24]exon 4에 의해 인코딩된 ZASP의 심장 특정 부위는 ZP 모티브를 포함하고 단백질 키나제 A의 규제 하위 단위를 결합한다.[15]

참고 항목

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000122367 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000021798 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: LDB3 LIM domain binding 3".
  6. ^ a b Faulkner G, Pallavicini A, Formentin E, Comelli A, Ievolella C, Trevisan S, et al. (July 1999). "ZASP: a new Z-band alternatively spliced PDZ-motif protein". J Cell Biol. 146 (2): 465–75. doi:10.1083/jcb.146.2.465. PMC 3206570. PMID 10427098.
  7. ^ a b Sheikh F, Bang ML, Lange S, Chen J (Nov 2007). ""Z"eroing in on the role of Cypher in striated muscle function, signaling, and human disease". Trends in Cardiovascular Medicine. 17 (8): 258–62. doi:10.1016/j.tcm.2007.09.002. PMC 2134983. PMID 18021935.
  8. ^ "O75112-6".
  9. ^ "O75112-5".
  10. ^ "O75112-4".
  11. ^ "O75112-3".
  12. ^ "O75112-2".
  13. ^ "O75112".
  14. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, et al. (Oct 2013). "Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase". Circulation Research. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
  15. ^ a b Lin C, Guo X, Lange S, Liu J, Ouyang K, Yin X, et al. (Oct 2013). "Cypher/ZASP is a novel A-kinase anchoring protein". The Journal of Biological Chemistry. 288 (41): 29403–13. doi:10.1074/jbc.M113.470708. PMC 3795241. PMID 23996002.
  16. ^ Bouaouina M, Jani K, Long JY, Czerniecki S, Morse EM, Ellis SJ, et al. (Dec 2012). "Zasp regulates integrin activation". Journal of Cell Science. 125 (Pt 23): 5647–57. doi:10.1242/jcs.103291. PMC 3575701. PMID 22992465.
  17. ^ a b Selcen D, Engel AG (Feb 2005). "Mutations in ZASP define a novel form of muscular dystrophy in humans". Annals of Neurology. 57 (2): 269–76. doi:10.1002/ana.20376. PMID 15668942. S2CID 25733755.
  18. ^ a b Vatta M, Mohapatra B, Jimenez S, Sanchez X, Faulkner G, Perles Z, et al. (Dec 2003). "Mutations in Cypher/ZASP in patients with dilated cardiomyopathy and left ventricular non-compaction". Journal of the American College of Cardiology. 42 (11): 2014–27. doi:10.1016/j.jacc.2003.10.021. PMID 14662268.
  19. ^ Arimura T, Hayashi T, Terada H, Lee SY, Zhou Q, Takahashi M, Ueda K, Nouchi T, Hohda S, Shibutani M, Hirose M, Chen J, Park JE, Yasunami M, Hayashi H, Kimura A (Feb 2004). "A Cypher/ZASP mutation associated with dilated cardiomyopathy alters the binding affinity to protein kinase C". The Journal of Biological Chemistry. 279 (8): 6746–52. doi:10.1074/jbc.M311849200. PMID 14660611.
  20. ^ Lopez-Ayala JM, Ortiz-Genga M, Gomez-Milanes I, Lopez-Cuenca D, Ruiz-Espejo F, Sanchez-Munoz JJ, et al. (Jul 2014). "A mutation in the Z-line Cypher/ZASP protein is associated with arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy". Clinical Genetics. 88 (2): 172–6. doi:10.1111/cge.12458. PMID 25041374. S2CID 21822009.
  21. ^ Xi Y, Ai T, De Lange E, Li Z, Wu G, Brunelli L, et al. (Oct 2012). "Loss of function of hNav1.5 by a ZASP1 mutation associated with intraventricular conduction disturbances in left ventricular noncompaction". Circulation: Arrhythmia and Electrophysiology. 5 (5): 1017–26. doi:10.1161/CIRCEP.111.969220. PMC 4331025. PMID 22929165.
  22. ^ a b Zhou Q, Ruiz-Lozano P, Martone ME, Chen J (Jul 1999). "Cypher, a striated muscle-restricted PDZ and LIM domain-containing protein, binds to alpha-actinin-2 and protein kinase C". The Journal of Biological Chemistry. 274 (28): 19807–13. doi:10.1074/jbc.274.28.19807. PMID 10391924.
  23. ^ Klaavuniemi T, Ylänne J (May 2006). "Zasp/Cypher internal ZM-motif containing fragments are sufficient to co-localize with alpha-actinin--analysis of patient mutations". Experimental Cell Research. 312 (8): 1299–311. doi:10.1016/j.yexcr.2005.12.036. PMID 16476425.
  24. ^ Kuroda S, Tokunaga C, Kiyohara Y, Higuchi O, Konishi H, Mizuno K, et al. (Dec 1996). "Protein-protein interaction of zinc finger LIM domains with protein kinase C". The Journal of Biological Chemistry. 271 (49): 31029–32. doi:10.1074/jbc.271.49.31029. PMID 8940095.

추가 읽기

외부 링크

기사는 공공영역에 있는 미국 국립 의학 도서관의 텍스트를 통합하고 있다.