이완 비르니

Ewan Birney
이완 비르니

CBE FRS FMedSci
Dr Ewan Birney FRS.jpg
2014년 7월 런던 로열 소사이어티 입학식 에완 버니
태어난
존 프레더릭 윌리엄 버니[1][2][3]

(1972-12-06) 1972년 12월 6일 (49세)[4][5][6][7]
런던[6] 패딩턴
기타 이름이완 비르니
존 버니[8]
교육이튼 칼리지
모교
로 알려져 있다.
배우자
보리 레이콕
(m. 2003)
[6][12]
아이들.두[6] 개
수상
과학 경력
필드
기관
논문생물정보학에서의 시퀀스 정렬 (2000)
박사학위 자문위원리처드 더빈[18]
영향
웹사이트ewanbirney.com

존 프레드릭 윌리엄 버니 CBE FMedSci[21][22](1972년 12월 6일 출생)[23][4][6][7][27]는 EMBL 유럽생물정보연구소(EMBL-EBI)[24][25][26]의 롤프 압바일러와 캠브리지셔 힌스턴에서 공동 이사 겸 유럽분자생물연구소(EMBL)의 부소장이다. 그는 또한 Genomics England의 비상임이사,[28] Genomics and Health(GA4)의 회장을 맡고 있다.GH)[29][30]와 케임브리지 대학의 생물정보학 명예교수.[31] 버니는 혁신적인 생물정보학 및 계산생물학 도구의 개발을 통해 유전체학에 상당한 기여를 했다.[13] 그는 이전에 웰컴 트러스트 생거 연구소에서 부교수를 지냈다.[32]

교육

버니는 이튼 대학에서 오피단 학자로 교육받았다.[6][33] 버니는 대학에 가기 전에 제임스 왓슨과[7][20] 애드리안 크레이너가 감독하는 콜드 스프링 하버 연구소에서 갭이어 인턴십을 마쳤다.[20][34][35]

버니는 1996년 옥스퍼드대에서 생화학 학사 학위를 취득했고, 그곳에서 옥스퍼드 발리올 칼리지의 학부생이었다.[6][7][36] 그는 케임브리지 세인트존스 칼리지의 대학원생으로 있을 때 리처드[18] 더빈의 감독을 받아 생어 학원에서 박사학위를 마쳤다.[37] 그의 박사학위 연구는 시퀀스 정렬을 위해 동적 프로그래밍,[38] 유한 상태 기계, 확률론적 자동자를 사용했다.[18]

그는 학생이었을 때 볼티모어 시장 사무실에서 인턴십을 마쳤고 스위스 은행 주식회사의 옵션 가치 평가에 관한 금융 서비스에서도 일했다.[33][20][when?]

연구 및 경력

2000년부터 2003년까지 버니는 인간 게놈의 총 유전자 수(및 부호화되지[40] 않은 DNA) 추정치에 내기를 걸면서 게놈학계를 위해 진스위프라고 알려진 과학적인 내기 및 스위프 스테이크를 조직했다.[39][9][20][41][42]

버니는 앙상블 게놈 브라우저와 기타 데이터베이스의 창시자 중 한 명으로, 2000년 인간 게놈의 염기서열화와 엔코드 프로젝트의 게놈 함수 분석에서 역할을 해 왔다.[42][43] 그는 인간,[44] 쥐,[45] 닭 그리고[46] 다른 유기체의 게놈 서열을 주석으로 붙이는 역할을 해왔다. 그의 연구 그룹은 인간과 다른 동물들의 계산 유전체학과 개인간 차이에 초점을 맞추고 있다.[12][24][26][40][47][48][49][50][51][52]

버니는 엔코드 컨소시엄에서의 역할로 유명하다.[17][42][53][54][55][56][57] 이에 앞서ENCODE 프로젝트에, Birney 널리 사용되는 생물 정보학과 컴퓨터 생명 공학. 많은 도구들을 직접(PairWise,[58]GeneWise,[59]GenomeWise,[60])또는 학생들과 postdocs, 예와 공동으로의 생성에서. Exonerate[61](가이 슬레이터와 함께), Enredo(하비에르 Herrero[62]), 피칸(베네딕트 Paten[63]), th등 관련되어 왔다.e벨벳 어셈블러(댄Iel Zerbino[64] )와 CRAM(Markus Hsi-Yang Fritz,[65] Rasko Leinonen[66], Vadim Zalunin). 버니는 또한 Pfam[67] 데이터베이스, InterPro,[68] BioPerl,[69][70] HMER[71] 및 Ensangel 게놈 데이터베이스 프로젝트를 포함한 몇 가지 다른 프로젝트에도 기여했다.[72]

2015년 현재, 버니의 연구 그룹은 인간과 다른 종 모두에서 유전 알고리즘과 개인 간의 차이점을 연구하는데 초점을 맞추고 있다. 그는 자신의 실험실에서 일했던 박사과정[73] 학생들과 박사후 연구원 몇 명을 감독했다.[74][75][76][77][65][78][79][63][80][81][82][83][84] 그의 연구는 생명공학 생물과학 연구 위원회, 의학 연구 위원회,[85] 국립 인간 게놈 연구소, [3]웰컴 트러스트, 유럽연합으로부터 자금을 지원받았다.[86]

버니는 옥스퍼드 나노포어 테크놀로지스의[87] 컨설턴트와 노리치 소재 얼햄 연구소(구 TGAC)의 과학 자문 위원회에서 활동하고 있다.[88][89]

수상 및 명예

2002년 버니는 35세 이하 세계 100대 혁신가 중 한 명으로 MIT 기술 리뷰 TR100에 이름을 올렸다.[90] 2003년, 그는 영국 왕립학회(Royal Society)에서 제1회 프랜시스 크릭 강연을 했다.[13] 2005년에는 오픈 소스 생물정보학 옹호, 바이오펄 커뮤니티에 대한 기여, 엔상블 게놈 주석 프로젝트 리더십으로 국제계산생물학회(ISCB)로부터 오버턴상을 받았다.[14] 2005년 버니는 생물정보학 분야에서 벤자민 프랭클린 상을 받았다.[91]

그의 지명자들에 의해 표현된 바와 같이, 버니는 생물정보학 및 과학 분야의 오픈소스 분야에서 중요한 영향력을 행사해 왔다. 그는 게놈 정보를 모든 사람이 자유롭게 이용할 수 있도록 하는 강력한 옹호자였다. 앙상블 프로젝트를 공동 주도하고 있는 그의 연구는 웹을 통해 고품질의 게놈 주석을 자유롭게 이용할 수 있게 함으로써 독점 데이터에 구독료를 지불할 수 있고 지불할 여유가 없는 실험실 등급 시스템을 막았다. 이 프로젝트는 다양한 방법으로 데이터를 이용할 수 있도록 하여 데이터에 접근하고 채굴에 쉽게 사용할 수 있도록 하기 위해 많은 노력을 해왔다. 앙상블 프로젝트는 처음부터 오픈소스여서 연구자와 기업 모두가 소프트웨어 시스템을 재사용하고 확장할 수 있다. 버니는 또한 열린 과학의 옹호자였다. 그는 숀 에디와 함께 게놈 서열 데이터를 동시에 발표하지 않고 논문 발간을 허용한 저널 결정을 비판했다. 그는 또한 게놈 주석 파이프라인의 중요한 부분인 Wise 도구 패키지의 저자다. 그는 오픈소스 생물정보 도구 키트 바이오펠의 공동대표를 맡고 있으며, 공동 설립자 겸 현재 여러 생물정보 도구 키트의 개발을 지원하는 기관인 오픈 바이오정보학 재단 이사장을 맡고 있다.

버니는 2012년[16] 유럽분자생물기구(EMBO)[15] 회원권을 받았고 2014년 영국 왕립학회(FRS) 회원으로 선출됐다.[2][13] 그의 당선 증명서와 솔직담백한 내용은 다음과 같다.[21]

이완은 알고리즘 분석과 통합 분석 모두 게놈 분석의 혁신으로 유전체학의 세력으로 성장했다. 그는 인간 게놈 분석과 그 이후의 게놈 분석에 사용되는 첫 번째 오류 내성, 이중 인식 단백질 정렬 프로그램을 작성했다. 그는 처음이자 가장 널리 사용되는 짧은 읽기 조립자 중 한 명을 공동 집필했다. 데이터 통합 측면에서 Ewan은 많은 게놈 컨소시엄, 특히 ENCODE에서 분석을 주도하여 많은 게놈 분석의 통합을 주도했다. 예를 들어, Enhancer, 촉진자, 질병 관련 지역과의 통합에 대한 강력한 예측을 한다. 그는 또한 널리 사용되는 많은 생물정보학 자원을 공동 개발했다.

버니는 2014년 브루넬 대학교 런던[92], 2021년 에스토니아 [93]타르투 대학교에서 명예 과학 박사학위를 받았다. 2015년, 버니는 의학 아카데미(FMedSci)의 펠로우로 선출되었다.[22] 버니는 2019년 새해 영예의 대영제국 훈장(CBE)에 임명되었다.[94][8]

사생활

버니는 2003년에[12] 결혼하여 두 명의 자녀를 두고 있다.[6]

참조

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학무실
선행자 유럽생물정보연구소장
2015-현재 		현직