마티외 블랑쉐(컴퓨터 생물학자)

Mathieu Blanchette (computational biologist)
마티외 블랑쉐
태어난
마티외 다니엘 블랑셰
모교
어워드
과학 경력
필드
기관
논문계통발자국 알고리즘 (2002)
박사 어드바이저마틴[2] 톰파
기타 학술 어드바이저
웹 사이트www.cs.mcgill.ca/~http://httpschem/

Mathieu Daniel Blanchette는 컴퓨터 생물학자로 McGill 대학의 컴퓨터 과학 대학의 부교수입니다.그의 연구는 DNA [1][3][4][5][6][7][8][9][10]배열에서 기능 영역을 검출하기 위한 새로운 알고리즘을 개발하는 데 초점을 맞추고 있다.

교육

Blanchette는 수학과 컴퓨터 공학을 학사(1997년) 레벨에서 공부한 후 Master of Science(1998년) 레벨에서 컴퓨터 공학을 공부했으며, 두 대학 모두 Montréal에서 컴퓨터 공학을 공부했습니다.그는 2002년 마틴 톰파의 지도 [2][11]아래 워싱턴 대학에서 박사학위를 취득했다.계통발자국을 [2]위한 알고리즘이라는 제목의 그의 논문은 유전자 순서 계통발자학을 위한 최초의 합리적인 알고리즘을 제시했고 [12]계통발자국을 정교하게 다루었다.그 후, 그는 데이비드 하우슬러와 [11][12]함께 캘리포니아 대학의 생체 분자 과학 및 공학 센터에서 박사 후 연구원으로 일했다.

조사.

Blanchette는 2002년에 McGill University Computer Science의 부교수가 되었습니다.그의[1][4][5] 연구는 DNA 염기서열에서 기능 영역을 검출하기 위한 계산 방법을 개발하는 데 초점을 맞추고 있다.그의 박사 후 연구는 조상 포유류의 게놈을 재구성하기 위한 알고리즘을 개발했다.그의 최근 연구는 특히 유전자 [3][12][13][14][15]조절을 추론하기 위한 알고리즘을 개발하는 것과 관련하여 이 경로를 계속하고 있다.

상과 명예

Blanchette는 2006년에 ISCB Overton Prize를 수상했습니다.이는 "생물정보학의 여러 분야에 대한 근본적이고 높은 인용을 한 공헌"[12]을 인정받았습니다.그는 2007년에 [16]Sloan Research Fellowship을 받았다.

Blanchette는 Genome Research 저널의 편집 위원회에서 근무하고 있으며, 2014년에는 Algorithms for Molecular [11][17]Biology 저널의 편집 위원회에서 근무하고 있습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c Google Scholar에 의해 색인화된 Mathieu Blanchett 출판물
  2. ^ a b c Blanchette, Mathieu Daniel (2002). Algorithms for Phylogenetic Footprinting (PhD thesis). University of Washington. ProQuest 305515226.
  3. ^ a b "Mathieu Blanchette - Assistant Professor, School of Computer Science, McGill University". Retrieved 2 March 2014.
  4. ^ a b DBLP Bibliography Server의 Mathieu Blanchette 씨
  5. ^ a b 블랑쉐트, 스코퍼스 서지 데이터베이스에 의해 색인화된 매튜의 출판물.(설명 필요)
  6. ^ Blanchette, M.; Kent, W. J.; Riemer, C.; Elnitski, L.; Smit, A. F.; Roskin, K. M.; Baertsch, R.; Rosenbloom, K.; Clawson, H.; Green, E. D.; Haussler, D.; Miller, W. (2004). "Aligning Multiple Genomic Sequences with the Threaded Blockset Aligner". Genome Research. 14 (4): 708–715. doi:10.1101/gr.1933104. PMC 383317. PMID 15060014.
  7. ^ Thomas, J. W.; Touchman, J. W.; Blakesley, R. W.; Bouffard, G. G.; Beckstrom-Sternberg, S. M.; Margulies, E. H.; Blanchette, M; Siepel, A. C.; Thomas, P. J.; McDowell, J. C.; Maskeri, B; Hansen, N. F.; Schwartz, M. S.; Weber, R. J.; Kent, W. J.; Karolchik, D; Bruen, T. C.; Bevan, R; Cutler, D. J.; Schwartz, S; Elnitski, L; Idol, J. R.; Prasad, A. B.; Lee-Lin, S. Q.; Maduro, V. V.; Summers, T. J.; Portnoy, M. E.; Dietrich, N. L.; Akhter, N; et al. (2003). "Comparative analyses of multi-species sequences from targeted genomic regions". Nature. 424 (6950): 788–93. Bibcode:2003Natur.424..788T. doi:10.1038/nature01858. PMID 12917688. S2CID 2419233.
  8. ^ Blanchette, M; Tompa, M (2002). "Discovery of regulatory elements by a computational method for phylogenetic footprinting". Genome Research. 12 (5): 739–48. doi:10.1101/gr.6902. PMC 186562. PMID 11997340.
  9. ^ Guillemette, B; Bataille, A. R.; Gévry, N; Adam, M; Blanchette, M; Robert, F; Gaudreau, L (2005). "Variant histone H2A.Z is globally localized to the promoters of inactive yeast genes and regulates nucleosome positioning". PLOS Biology. 3 (12): e384. doi:10.1371/journal.pbio.0030384. PMC 1275524. PMID 16248679. open access
  10. ^ Margulies, E. H.; Blanchette, M; NISC Comparative Sequencing Program; Haussler, D; Green, E. D. (2003). "Identification and characterization of multi-species conserved sequences". Genome Research. 13 (12): 2507–18. doi:10.1101/gr.1602203. PMC 403793. PMID 14656959.
  11. ^ a b c "CompleteCV-2015" (PDF). Retrieved 26 April 2021.
  12. ^ a b c d Maisel, M. (2006). "ISCB Honors Michael S. Waterman and Mathieu Blanchette". PLOS Computational Biology. 2 (8): e105. Bibcode:2006PLSCB...2..105M. doi:10.1371/journal.pcbi.0020105. PMC 1526462. open access
  13. ^ Blanchette, M; Green, E. D.; Miller, W; Haussler, D (2004). "Reconstructing large regions of an ancestral mammalian genome in silico". Genome Research. 14 (12): 2412–23. doi:10.1101/gr.2800104. PMC 534665. PMID 15574820.
  14. ^ Blanchette, M (2012). "Exploiting ancestral mammalian genomes for the prediction of human transcription factor binding sites". BMC Bioinformatics. 13 Suppl 19: S2. doi:10.1186/1471-2105-13-S19-S2. PMC 3526440. PMID 23281809. open access
  15. ^ Chen, X; Blanchette, M (2007). "Prediction of tissue-specific cis-regulatory modules using Bayesian networks and regression trees". BMC Bioinformatics. 8 Suppl 10: S2. doi:10.1186/1471-2105-8-S10-S2. PMC 2230503. PMID 18269696. open access
  16. ^ "McGill gets four Sloans". www.mcgill.ca. Retrieved 2 March 2014.
  17. ^ "Algorithms for Molecular Biology - Editorial Board". www.almob.org. Retrieved 2 March 2014.