앨릭스 베이트먼

Alex Bateman
앨릭스 베이트먼
Alex Bateman ISMBECCB 2013.jpg
2013년 베를린에서 열린 지능형 분자생물학(ISMB) 회의에서 알렉스 베이트먼이 연설하고 있다.
태어난
알렉산더 조지 베이트먼

(1972-10-09) 1972년 10월 9일 (49세)[1]
모교
로 알려져 있다.
수상
과학 경력
필드
기관
논문면역글로불린 슈퍼패밀리의 구조와 기능의 진화 (1997)
박사학위 자문위원키루스 초티아
기타학술고문리처드 M.더빈[10]
웹사이트www.ebi.ac.uk/about/people/alex-bateman

알렉산더 조지 베이트먼은 계산 생물학자 겸 영국 케임브리지에 있는 유럽 분자생물연구소(EMBL)의 일부인 유럽생물정보연구소(EBI)의 단백질 시퀀스 자원 책임자다.[9][11]그는 Pfam 생물학적 데이터베이스[12] 개발을 주도했고 RNA 계열의 Rfam 데이터베이스를 도입했다.그는 또한 생물학적 데이터베이스의 커뮤니티 기반 주석을 위한 위키백과의 사용에 관여해왔다.[13][14][15][16][17]

교육

베이트만은 1994년 뉴캐슬 대학에서 생화학 학사 학위를 받았다.그는 1997년 케임브리지 대학교에서 면역글로불린 단백질 슈퍼패밀리의 진화에 대한 키루스 초티아에[18][19] 의해 감독된 연구로 박사학위를 받았다.[20][21]이 기간 동안, 그는 HMER 소프트웨어를 사용하여 새로운 단백질 도메인을 발견하기 위해 숀 에디와 함께 일하기도 했다.[22]

직업 및 연구

1997년 베이트만은 웰컴 트러스트 생거 연구소에 가입해 Pfam 생물 데이터베이스 개발을 주도했다.2003년에는 RNA 계열의 Rfam 데이터베이스를 도입했다.[6][22]인간 게놈 출판을 위한 단백질 분석 제공에도 관여했다.[22][23]

2012년 현재, 그는 EMBL-EBI의 단백질 시퀀스 자원 책임자로 재직하고 있다.[24]

베이트만은 과학계[25] 내에서 위키백과의 활용을 촉진하고, 특히 위키백과를 통한 생물학적 데이터베이스의 커뮤니티 기반 주석, 예를 들어 위키프로젝트 RNA를 통한 Rfam 데이터베이스 주석 등에 관여해 왔다.[26]

베이트먼은 2004년부터 2012년까지 생물정보학 저널의 편집장을 지냈고, 생물정보학에서 핵산 연구, 게놈 생물학 및 현재 프로토콜의 편집장을 역임하기도 했다.[2][3]2014년, 그는 최초의 생물정보학 명예 편집자 중 한 명으로 임명되었다.[27]2015년 현재 베이트만은 ISCB 이사회에서도 활동하고 있다.[28]

수상 및 명예

베이트만은 2010 벤자민 프랭클린 생물정보학상을 수상했다.[29][30]그는 션 에디와 이완 비르니에 이어 리처드 더빈의 연구소에서 세 번째로 상을 받았다.[29][10]베이트먼은 2017년 국제계산생물학회에 의해 ISCB 펠로우로 선출되었다.[8][31]

2015년 더블린에서 열린 ISMB 콘퍼런스에서 알렉스 베이트먼(왼쪽)과 사이러스 초티아(오른쪽)가 함께했다.

참조

  1. ^ 의회 도서관의 알렉스 베이트먼
  2. ^ a b "Alex Bateman: Senior Team Leader Protein Sequence Resources and Group Leader Bateman Research Group". Uniprot.org. Archived from the original on 2015-03-16.
  3. ^ a b "Alex Bateman Publons". Publons.com. Archived from the original on 2015-03-16.
  4. ^ Bateman, A.; Coin, L.; Durbin, R.; Finn, R. D.; Hollich, V.; Griffiths-Jones, S.; Khanna, A.; Marshall, M.; Moxon, S.; Sonnhammer, E. L.; Studholme, D. J.; Yeats, C.; Eddy, S. R. (2004). "The Pfam protein families database". Nucleic Acids Research. 32 (Database issue): 138D–1141. doi:10.1093/nar/gkh121. ISSN 0305-1048. PMC 308855. PMID 14681378. open access
  5. ^ Sammut, S. J.; Finn, R. D.; Bateman, A (2008). "Pfam 10 years on: 10,000 families and still growing". Briefings in Bioinformatics. 9 (3): 210–9. doi:10.1093/bib/bbn010. PMID 18344544.
  6. ^ a b Griffiths-Jones, S; Bateman, A; Marshall, M; Khanna, A; Eddy, S. R. (2003). "Rfam: An RNA family database". Nucleic Acids Research. 31 (1): 439–41. doi:10.1093/nar/gkg006. PMC 165453. PMID 12520045.
  7. ^ Griffiths-Jones, S; Grocock, R. J.; Van Dongen, S; Bateman, A; Enright, A. J. (2006). "MiRBase: MicroRNA sequences, targets and gene nomenclature". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D140-4. doi:10.1093/nar/gkj112. PMC 1347474. PMID 16381832.
  8. ^ a b Anon (2017). "ISCB Fellows". iscb.org. International Society for Computational Biology. Archived from the original on 2017-03-20.
  9. ^ a b 구글 스콜라에서 색인화한 알렉스 베이트먼 출판물
  10. ^ a b Chakradhar, Shraddha (2012). "Heng Li Credits Durbin Pedigree in Accepting Franklin Award". bio-itworld.com. Archived from the original on 2013-03-30.
  11. ^ DBLP 서지학 서버의 알렉스 베이트먼
  12. ^ Finn, R. D.; Mistry, J.; Schuster-Böckler, B.; Griffiths-Jones, S.; Hollich, V.; Lassmann, T.; Moxon, S.; Marshall, M.; Khanna, A.; Durbin, R.; Eddy, S. R.; Sonnhammer, E. L.; Bateman, A. (Jan 2006). "Pfam: clans, web tools and services" (Free full text). Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D247–D251. doi:10.1093/nar/gkj149. ISSN 0305-1048. PMC 1347511. PMID 16381856.
  13. ^ Logan, D. W.; Sandal, M.; Gardner, P. P.; Manske, M.; Bateman, A. (2010). "Ten Simple Rules for Editing Wikipedia". PLOS Computational Biology. 6 (9): e1000941. doi:10.1371/journal.pcbi.1000941. PMC 2947980. PMID 20941386. open access
  14. ^ "Bateman group < Research < EMBL-EBI". European Bioinformatics Institute. Archived from the original on 2013-10-01.
  15. ^ 유럽 퍼브메드 센트럴의 알렉스 베이트먼 출판물
  16. ^ 스코푸스 도서목록 데이터베이스에 의해 색인된 알렉스 베이트만의 출판물들.(필요한 경우)
  17. ^ Burge, S.; Attwood, T. K.; Bateman, A.; Berardini, T. Z.; Cherry, M.; O'Donovan, C.; Xenarios, L.; Gaudet, P. (2012). "Biocurators and Biocuration: Surveying the 21st century challenges". Database. 2012: bar059. doi:10.1093/database/bar059. PMC 3308150. PMID 22434828.
  18. ^ Bateman, A; Eddy, S. R.; Chothia, C (1996). "Members of the immunoglobulin superfamily in bacteria". Protein Science. 5 (9): 1939–41. doi:10.1002/pro.5560050923. PMC 2143528. PMID 8880921.
  19. ^ Bateman, A; Jouet, M; MacFarlane, J; Du, J. S.; Kenwrick, S; Chothia, C (1996). "Outline structure of the human L1 cell adhesion molecule and the sites where mutations cause neurological disorders". The EMBO Journal. 15 (22): 6050–9. doi:10.1002/j.1460-2075.1996.tb00993.x. PMC 452426. PMID 8947027.
  20. ^ Bateman, Alexander George (1997). Evolution of the structure and function of the immunoglobulin superfamily. ethos.bl.uk (PhD thesis). University of Cambridge. OCLC 879391333.
  21. ^ Bateman, A; Murzin, A. G.; Teichmann, S. A. (1998). "Structure and distribution of pentapeptide repeats in bacteria". Protein Science. 7 (6): 1477–80. doi:10.1002/pro.5560070625. PMC 2144021. PMID 9655353.
  22. ^ a b c "Archive page: Dr Alex Bateman - Wellcome Trust Sanger Institute". Wellcome Trust Sanger Institute. Archived from the original on 2014-10-13.
  23. ^ Lander, Eric S.; et al. (15 February 2001). "Initial sequencing and analysis of the human genome". Nature. 409 (6822): 860–921. doi:10.1038/35057062. PMID 11237011.
  24. ^ "Alex Bateman < People & Groups < About us < EMBL-EBI". EBI. Archived from the original on 2013-10-01.
  25. ^ Bateman, Alex (2012). "Why scientists should be publishing on Wikipedia". Wired UK. Archived from the original on 2012-07-09.
  26. ^ Daub, J.; Gardner, P. P.; Tate, J.; Ramsköld, D.; Manske, M.; Scott, W. G.; Weinberg, Z.; Griffiths-Jones, S.; Bateman, A. (2008). "The RNA WikiProject: Community annotation of RNA families". RNA. 14 (12): 2462–2464. doi:10.1261/rna.1200508. PMC 2590952. PMID 18945806.
  27. ^ Anon (2014). "15 years of "Bioinformatics"". Bioinformatics. 30 (6): 747. doi:10.1093/bioinformatics/btu076. PMID 24642573.
  28. ^ "Officers and board of Directors ISCB". International Society for Computational Biology. Archived from the original on 2014-07-24.
  29. ^ a b "Alex Bateman Wins 2010 Benjamin Franklin Award - Bio-IT World". www.bio-itworld.com. Archived from the original on 2012-08-14.
  30. ^ "Alex wins the Benjamin Franklin award!". Xfam Blog. April 2010. Archived from the original on 2010-04-28.
  31. ^ "February 13, 2017: The International Society for Computational Biology Names Seven Members as the ISCB Fellows Class of 2017". www.iscb.org. Retrieved 13 February 2017.