더미시딘

DCD
사용 가능한 구조
PDB	휴먼 유니프로트 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	2 YMK, 2 KSG
식별자
에일리어스	DCD, AIDD, DCD-1, DSEP, HCAP, PIF, 더미시딘
외부 ID	OMIM: 606634 HomoloGene: 89039 GeneCard: DCD
유전자 위치(인간)
크르.	12번 염색체(인간)
끝.	54,648,493 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	복부 피부; ; 위근; ; 니플; ; 상부 신경; ; 피하 지방 조직; ; 슬와 동맥; ; 오른쪽 폐; ; 좌심실; ; 간우엽; ; 상행 대동맥;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	펩티드가수분해효소활성; GO:0001948 단백질 결합; 가수분해효소활성; RNA결합;
셀룰러 컴포넌트	세포외 엑소좀; GO:0005578 세포외 매트릭스; 세포외 영역; 세포외 공간;
생물학적 과정	세균에 대한 방어 반응; 단백질 분해; 항균성 체액 반응; 항균펩타이드에 의해 매개되는 항균성 체액 면역 반응; 다른 유기체의 세포 사멸; 곰팡이에 대한 방어 반응;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	117159
	없음
	ENSG000001634
	없음
	P81605
	없음
	NM_053283; NM_001300854
	없음
	NP_001287783; NP_444513
	없음
	위키데이터
인간 보기/편집

더미시딘은 110개의 아미노산을 가진 단백질로 인간의 경우 DCD ^[3]^[4]유전자에 의해 암호화된다.전장 단백질은 단백질 분해 유도인자(PIF) 및 기타 항균성 ^[4]펩타이드로서 유도된 펩타이드를 생성하며, 면역체계의 선천적인 숙주 방어체의 일부로서 인간의 에크린 땀샘에 의해 피부로 분비된다.PIF는 근육단백질 ^[4]분해에 관여한다.

기능.

더미시딘은 분비된 단백질로, 이후 뚜렷한 생물학적 활동을 하는 성숙한 펩타이드로 처리된다.C-말단펩타이드는 땀으로 발현되며 항균 및 항진균 활성을 가진다.확산성 서바이벌 회피 펩타이드라고도 알려진 N-말단 펩타이드는 심각한 산화 스트레스 조건에서 신경 세포 생존을 촉진합니다.N 말단 펩타이드의 글리코실화 형태는 ^[4]암환자의 캐시샤(근육낭비)와 관련될 수 있다.

      서바이벌 회피펩타이드                           항균펩타이드  YDPEAASAPGS GNPEAQKENAGLARQAPKPRKQRSSLLEKGKKAVGGGKDavedleVGGKGAVHDVKDVL

C-말단 전구체 DCD-1L은 NMR 및 CD-spectroscopy에 의한 용액구조 측정에서 입증되었듯이 용액 중 부분 헬리시성을 보이는 48잔기펩타이드이다.전장 전구체는 인간의 땀에 존재하는 미결정 단백질 분해 효소에 의해 처리되어 가변적인 항균 활성을 보이는 몇 가지 짧은 펩타이드를 형성하며, 아미노산의 C 말단 삼중항과 잔류 길이에 따라 이름이 붙여진다.그러한 활성 펩타이드 중 하나가 SSL25로,^[5] DCD-1L에 비해 대장균에 대한 활성도가 2배 증가하였다.

DCD-1L SSLLDGKKKKDVDL VGGAVL DCD-1 SSLLDGKGKKKKKKLGKDVDL

메커니즘

더미시딘의 결정구조는 Zn이온결합에 ^[6]의해 매개되는 육중미나선다발(hexameric helix-bundle)을 밝히기 위해 용액에서 해결되었다.이는 분자역학 시뮬레이션에 의한 계산 검사 중 막에서 기울어진 채널을 형성하는 것으로 관찰되며, 이러한 관찰로부터 추론된 항균 작용의 한 가지 제안된 메커니즘은 생물학적 막 간의 이온 경사 디커플링이다.이는 지질 이중층의 전압 의존성 탈분극에 대한 실험 연구에서의 동시 관찰에 의해 뒷받침된다.

레퍼런스

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^ PDB: 2 YMKSong, Chen; Weichbrodt, Conrad; Salnikov, Evgeniy S; Dynowski, Marek; Forsberg, Björn O; Bechinger, Burkhard; Steinem, Claudia; de Groot, Bert L; Zachariae, Ulrich; Zeth, Kornelius (Feb 2013). "Crystal structure and functional mechanism of a human antimicrobial membrane channel". PNAS. 110 (12): 4586–91. Bibcode:2013PNAS..110.4586S. doi:10.1073/pnas.1214739110. PMC 3607029. PMID 23426625.

추가 정보

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외부 링크

미국 국립 의학 도서관 의학 과목 표제(MeSH)의 진피시딘

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000161634 - 앙상블, 2017년 5월

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid11694882-3] Schittek B, Hipfel R, Sauer B, Bauer J, Kalbacher H, Stevanovic S, Schirle M, Schroeder K, Blin N, Meier F, Rassner G, Garbe C (Nov 2001). "Dermicidin: a novel human antibiotic peptide secreted by sweat glands". Nat Immunol. 2 (12): 1133–7. doi:10.1038/ni732. PMID 11694882. S2CID 26126901.

[entrez-4] "Entrez Gene: DCD dermicidin".

[pmid-5] Baechle D, Flad T, Cansier A, et al. (2006). "Cathepsin D is present in human eccrine sweat and involved in the postsecretory processing of the antimicrobial peptide DCD-1L". J. Biol. Chem. 281 (9): 5406–15. doi:10.1074/jbc.M504670200. PMID 16354654.

[pmid23426625-6] PDB: 2 YMKSong, Chen; Weichbrodt, Conrad; Salnikov, Evgeniy S; Dynowski, Marek; Forsberg, Björn O; Bechinger, Burkhard; Steinem, Claudia; de Groot, Bert L; Zachariae, Ulrich; Zeth, Kornelius (Feb 2013). "Crystal structure and functional mechanism of a human antimicrobial membrane channel". PNAS. 110 (12): 4586–91. Bibcode:2013PNAS..110.4586S. doi:10.1073/pnas.1214739110. PMC 3607029. PMID 23426625.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

v t 모공형성독소(TC 1C)
항균성 양이온성 펩타이드	카테리시딘 데펜신 더미시딘 히스타틴(HTN1, HTN3)
기타, 인간	천공
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