PCDHA9

PCDHA9
식별자
에일리어스	PCDHA9, PCDH-ALPA9, 프로토카데린 알파9
외부 ID	OMIM: 606315 MGI: 2681879 HomoloGene: 129614 GeneCard: PCDHA9
유전자 위치(인간)
크르.	5번 염색체(인간)
끝.	141,012,347 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	18번 염색체(쥐)
끝.	37,320,710 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	시신경; ; 정자; ; 브로드만 영역 46; ; 후중심회; ; 소뇌충; ; 상전두회; ; 폐하엽; ; 신경절 융기; ; 장피질; ; 핀;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	칼슘 이온 결합;
셀룰러 컴포넌트	막의 적분 성분; 혈장막; 막; 혈장막의 적분 성분;
생물학적 과정	혈장막 접착 분자에 의한 호모세포 접착; 세포 접착; 세포신호; 신경계의 발달;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	9752
	353235
	ENSG00000204961
	ENSMUSG00000103800
	Q9Y5H5
	Q91Y12
	NM_031857; NM_014005
	NM_201243
	NP_054724; NP_114063
	NP_957695
	위키데이터
인간 보기/편집	마우스 표시/편집

프로토카데린 알파-9은 인간의 PCDHA9 ^[5]^[6]유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.

이 유전자는 B세포 및 T세포 수용체 유전자 클러스터와 유사한 특이한 게놈 구조를 나타내는 염색체 5번 염색체에 탠덤으로 연결된 3개의 관련 유전자 클러스터 중 하나인 프로토카데린 알파 유전자 클러스터의 구성원이다.알파 유전자 클러스터는 마우스 CNR 유전자와 관련된 15개의 카드헤린 슈퍼패밀리 유전자로 구성되며 13개의 매우 유사한 유전자와 2개의 원거리 관련 코드 배열로 구성됩니다.15개의 N 말단 엑손 또는 가변 엑손의 탠덤 배열은 클러스터 내의 모든 유전자에 의해 공유되는 다운스트림 C 말단 엑손 또는 상수 엑손에 이어 이어집니다.큰 N 말단 엑손은 각각 6개의 카드헤린 엑토도메인을 부호화하며, C 말단 엑손은 세포질 도메인을 부호화한다.이러한 신경 카드헤린 유사 세포 접착 단백질은 뇌에서 특정 세포-세포 연결의 확립과 기능에 가장 중요한 역할을 하는 일체형 혈장막 단백질입니다.대체 스플라이싱이 관찰되고 추가 변형이 제안되었지만 전체 길이의 특성은 아직 ^[6]결정되지 않았습니다.

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000204961 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG00000103800 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Wu Q, Maniatis T (Jul 1999). "A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes". Cell. 97 (6): 779–90. doi:10.1016/S0092-8674(00)80789-8. PMID 10380929. S2CID 6014717.
^ ^a ^b "Entrez Gene: PCDHA9 protocadherin alpha 9".

추가 정보

Yagi T, Takeichi M (2000). "Cadherin superfamily genes: functions, genomic organization, and neurologic diversity". Genes Dev. 14 (10): 1169–80. doi:10.1101/gad.14.10.1169. PMID 10817752. S2CID 44844497.
Nollet F, Kools P, van Roy F (2000). "Phylogenetic analysis of the cadherin superfamily allows identification of six major subfamilies besides several solitary members". J. Mol. Biol. 299 (3): 551–72. doi:10.1006/jmbi.2000.3777. PMID 10835267.
Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, et al. (1997). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. VII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro". DNA Res. 4 (2): 141–50. doi:10.1093/dnares/4.2.141. PMID 9205841.
Sugino H, Hamada S, Yasuda R, et al. (2000). "Genomic organization of the family of CNR cadherin genes in mice and humans". Genomics. 63 (1): 75–87. doi:10.1006/geno.1999.6066. PMID 10662547.
Wu Q, Maniatis T (2000). "Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (7): 3124–9. doi:10.1073/pnas.060027397. PMC 16203. PMID 10716726.
Wu Q, Zhang T, Cheng JF, et al. (2001). "Comparative DNA sequence analysis of mouse and human protocadherin gene clusters". Genome Res. 11 (3): 389–404. doi:10.1101/gr.167301. PMC 311048. PMID 11230163.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Schmutz J, Martin J, Terry A, et al. (2004). "The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 5" (PDF). Nature. 431 (7006): 268–74. Bibcode:2004Natur.431..268S. doi:10.1038/nature02919. PMID 15372022. S2CID 4373053.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000204961 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG00000103800 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid10380929-5] Wu Q, Maniatis T (Jul 1999). "A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes". Cell. 97 (6): 779–90. doi:10.1016/S0092-8674(00)80789-8. PMID 10380929. S2CID 6014717.

[entrez-6] "Entrez Gene: PCDHA9 protocadherin alpha 9".

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