포티바이러스

포티바이러스
전자 마이크로그래프를 이용한 매실 수두 바이러스 게놈과 처녀자리 모델
바이러스 분류
(랭킹되지 않음):	바이러스
영역:	리보비리아
킹덤:	오르토나비라과
망울:	피수비리코타
클래스:	스텔파비리케테스속
순서:	파타타비루스목
패밀리:	포티비루스과
속:	포티바이러스
종
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포티바이러스(Potyvirus)는 포티비루스과에 속하는 양스트랜드 RNA 바이러스의 속이다.식물은 천연 숙주 역할을 한다.이 속은 멤버 바이러스 감자 바이러스 Y의 이름을 따서 명명되었다.포티바이러스는 현재 알려진 식물 바이러스의 약 30%를 차지한다.베고모비루스와 마찬가지로, 이 종의 구성원은 농업, 목회, 원예, 장식용 작물에 상당한 손실을 초래할 수 있다.200종 이상의 진딧물이 포티비루스를 퍼뜨리고 있으며, 대부분은 아족인 아프디나에(제너나 매크로시폼과 마이주스) 출신이다.그 속은 190종을 포함하고 있다.^[1][2]

바이러스학

구조

처녀막은 굴곡성 및 필라멘트성 핵캡시드로 개발되지 않으며, 길이는 680~900나노미터(nm)이며 지름은 11~20nm이다.^[1]핵캡시드는 캡시드 단백질의 약 2000부를 함유하고 있다.핵캡시드의 대칭은 3.4 nm의 피치로 나선형이다.

게놈

게놈은 뉴클레오티드 염기 9,000–12,000개에 이르는 크기의, 양의 감각의 단일 가닥 RNA이다.비록 많은 종들이 초당적인 것이긴 하지만,^[1] 대부분의 포티바이러스는 분할되지 않은 게놈을 가지고 있다.기본 구성은: 21–23.51–26% G, 23–30.15–44% A, 14.9–22.41–28% C, 15.6–24.41–30.9% U.^{[citation needed]}

단일 게놈을 가진 종에서 5의 끝에서 단백질이 공칭적으로 연결되어 있다(VPG 단백질).350kDa 다단백질 전구체로 표현된 단일 개방형 판독 프레임(ORF)을 인코딩한다.이는 단백질 1 단백질 분해효소(P1-Pro), 도우미 성분 단백질 분해효소(HC-Pro), 단백질 3(P3), 원통형포착(CI), 바이러스성 단백질 게놈 연계(VPG), 핵포함 A(NIA), 핵포함 B(NIB), 캡시드 단백질(CP), 6K1과 6K2로 알려진 2개의 작은 투입 단백질로 처리된다.P3 cistron은 또한 +2 프레임시프트에 의해 생성되는 두 번째 단백질인 P3N-PIPO를 인코딩한다.^[3]

단백질

바이러스성 단백질의 특성:

P1-Pro(분자량으로 약 33킬로달톤(kDa))은 세린 프로테아제다.

HC-Pro(약 52KDa)는 진딧물 전달에도 관여하는 프로테아제다.프로테아제로서 그것은 자신의 C-terminus에서 글리신-글리신 디펩타이드(glycine dipptide)를 분해한다.또한 진핵 시작 인자 4(eIF4)와도 상호작용한다.그것은 바이러스성 RNA 음소거 억제기의 역할을 한다.

P3(약 41 kDa) 함수를 알 수 없다.리불로스-1,5-비스인산염 카르복실라아제/산소성효소의 큰 서브유닛과 상호작용한다.

CI(~71kDa)는 ATPase 활성이 있는 RNA 헬리코아제다.막 부착에도 관여한다.

NIa (~50 kDa)는 NIa-Pro a protease (~27 kDa)와 VPG (~22 kDa) 단백질로 분해된다.

NIb(약 59 kDa)는 RNA 의존성 RNA 중합효소다.

6K1(~6kDa)의 기능을 알 수 없다. 단일 트랜스 멤브레인 도메인을 가진 6K2(~6kDa) 단백질이 숙주 세포막에 축적되고 있어 바이러스의 복제 vesicle을 형성하는 역할을 하고 있는 것으로 생각된다.

P3N-PIPO(~25kDa) 기능은 알려져 있지 않지만 필수적인 것으로 보인다.그것은 리불로스-1,5-비스포스포산염 카르복실라제/산소화효소의 크고 작은 서브유닛과 모두 상호작용한다.

CP 캡시드 단백질은 무게는 30-35kDa이다.

꽤 흥미로운 고구마 포티바이러스 ORF(PISPO), 알키플레이션 B(AlkB), 이노신 삼인산염 화인산효소(ITPase 또는 HAM1)는 비정형 포티바이러스에서 식별되는 단백질 영역이다.^[4]

VPG 단백질은 진핵 시작 인자 4E(eIF4E)와 상호작용한다.^[5]이 상호작용은 바이러스 감염에 필수적인 것으로 보인다.두 개의 프로테아제인 P1과 도우미 성분 프로테아제(HC)는 각각의 C 터미네이션에서 자동 프로테아제 반응만 촉매로 한다.나머지 갈라진 반응은 소량의 핵포함 단백질(NIA-Pro)에 의한 전단백질 또는 자가합성 메커니즘에 의해 촉매된다.이 후자의 단백질은 피코나바이러스 3C 단백질효소의 진화적 호몰로지 입니다.^[6]

라이프 사이클

복제는 세포질,^[1] 핵, 엽록체, 골지 기구, 세포 바구아 또는 비정상적인 장소에서 더 드물게 발생할 수 있다.

포티바이러스는 감염된 식물 세포에 단백질을 포함시킨다.이것들은 세포질이나 핵에 있는 결정체들 중 하나일 수도 있는데, 비정형 X-형체, 막체, 바이로플라즘 또는 바람개비처럼 말이다.포함 물질은 (종류에 따라) 처녀성을 포함할 수도 있고 포함할 수도 있다.이러한 포함 물질은 오렌지-그린(단백질 얼룩)으로 얼룩진 감염된 식물 조직의 잎사귀에서 가벼운 현미경으로 볼 수 있지만 아즈레 A(핵산 얼룩)는 볼 수 없다.^[7][8][9]포티바이러스 포함에는 네 가지 다른 종류가 있다.^[10]

복제는 양의 변형 RNA 바이러스 복제 모델을 따른다.양성긴장 RNA 바이러스 전사는 전사의 방법이다.번역은 -1 리보솜 프레임 쉬핑으로 이루어진다.그 바이러스는 튜불 유도 바이러스 이동에 의해 숙주 세포에서 나온다.식물은 천연 숙주 역할을 한다.그 바이러스는 벡터를 통해 전염된다전송 경로는 벡터(vector)와 기계적이다.^[1]

진화

포티비루스는 6,600년에서 7,250년 사이에 진화했다.^[11][12]그들은 유라시아 남서쪽이나 북아프리카에서 진화한 것으로 보인다.추정 돌연변이 비율은 약 1.15×10⁻⁴ 뉴클레오티드 대체/부위/연이다.^{[citation needed]}

지리적 확산

농업은 18세기에 호주에 도입되었다.이 소개에는 또한 식물 병원균이 포함되었다.38종의 포티바이러스 종들이 호주에서 격리되었다.18개의 항아리콩은 호주에서만 발견되었으며, 호주에서 서식하는 것으로 추정된다.나머지 20명은 농업과 함께 소개된 것으로 보인다.^{[citation needed]}

분류학

포티바이러스는 다음과 같은 종을 포함한다.^[2]

추가로 4개의 바이러스가 이전에 이 속에서는 종으로 분류되었지만 유전적 순서 정보가 부족하여 폐지되었다.^[13]

• 카우피 그린 정맥 밴딩 바이러스
• 땅콩아이팟바이러스
• 헬레늄바이러스 Y
• 트로페올룸 모자이크바이러스

종군

포티바이러스는 1992년에 PVY, SCMV, BYMV, BCMV 종으로 더욱 나뉘었다.깁스와 오시마 2010은 같은 4개의 그룹을 가진 보다 광범위한 분자 계통생성을 생산했지만, 또한 BtMV, ChVMV, DaMV, OYDV, PRSV, TEV, TuMV 등 몇 개의 새로운 그룹을 생산했다.^[12]

PVY

속(감자 바이러스 Y)의 종류종류를 포함한 16종이 포함되어 있다.주요 숙주는 나인솔라나과, 아마란투스, 아스테라과, 라일륨, 아마릴리스 3종이다.^[12]

참조

참고 문헌 목록

• Ward, CW; Shukla, DD (1991). "Taxonomy of potyviruses: current problems and some solutions". Intervirology. 32 (5): 269–96. doi:10.1159/000150211. PMID 1657820.
• King, Andrew M. Q.; et al., eds. (2012). "Potyvirus". Virus taxonomy : classification and nomenclature of viruses : ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London: Academic Press. pp. 926–1072. ISBN 978-0123846846. Retrieved 9 December 2014.

외부 링크

• 유니프로트 분류법:포티바이러스
• 바이러스 영역:포티바이러스
• ICTV