미미바이러스과

Mimiviridae
미미바이러스과
Tupanvirus.jpeg
투판바이러스
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 바리드나비리아속
왕국: 밤포드비라과
문: 뉴클레오티토빌리코타
클래스: 메가바이러스 세트
주문: 이미테르비랄레스
패밀리: 미미바이러스과
아과 및 속

미미바이러스과(Mimiviridae)는 바이러스 이다.아메바와 다른 시위자들은 자연 숙주 역할을 한다.패밀리는 최대 4개의 하위 [1][2][3][4]패밀리로 나뉩니다.이 계열의 바이러스는 거대 바이러스라고도 불리는세포질 대형 DNA 바이러스 분지(NCLDV)에 속합니다.

미미바이러스과(Mimiviridae)는 이미테르비랄레스목의 유일한 종이다.알가비랄레스피코드나바이러스과판도라바이러스과는 많은 계통발생학적 [5]분석에서 미미바이러스과의 자매군이다.

역사

[6]가족의 첫 번째 멤버인 미미바이러스는 2003년에 발견되었고,[7] 최초의 완전한 게놈 배열은 2004년에 발표되었습니다.그러나 1995년 [9]당시 숙주가 잘못 식별돼 BV-PW1로 명명됐지만 미미바이러스 카페테리아 [8]로엔버그시스 바이러스[8] 분리돼 부분적으로 특징지어졌다.

분류법

그룹: dsDNA

주문: 이미터비랄레스

미미바이러스과(Mimiviridae)는 현재 3개의 [2][3][10]아과로 나뉜다.

  • 1개의 서브 패밀리(Mimivirus 속, 제안된 이름:메가바이러스아과(Megavirinae) 또는 메가미바이러스아과(Megamimivirinae)는 세 개의 "계통"으로 나뉜다.
대부분의 미미바이러스과(Mimivirus)는 이 아과(Mimivirus)[10]에 속하는 것으로 보인다.
이것은 때때로 미미바이러스과 [17]1군이라고도 불린다.

또한 미미바이러스과(Mesomimivirinae)를 추가 잠정군 III(Mesomimivirinae)로 확장하거나 [19]기존 OLPG(Organic Lake Phycodna Group)를 포함하는 자매군 메소미바이러스과(Mesomimiviridae)로 분류하는 것이 제안되었다.이 확장자(또는 자매 패밀리)는 다음과 같이 구성됩니다.

이 그룹은 Phycodnaviridae보다는 Mimiviridae와 밀접한 관련이 있는 것으로 보여서, 때로는 추가 아과 후보 Mesomimivirinae로 언급되기도 한다.ICTV에 의해 인식되지 않았지만 확장과 미미바이러스과를 메가바이러스과라고 [3][23][24][25][26][17]부르기도 한다.또한 확장군을 미미바이러스과라고 부르기도 한다.

2020년 3월 ICTV에 의해 이미테르비랄레스가 새로운 목으로 인정됨에 따라 관찰된 고다양성 바이러스의 그룹을 구성하기 위해 더 이상 미미바이러스군을 확장할 필요가 없다.대신, 확장(또는 적어도 그 주된 분지)은 자매과(Mesomimiviridae)[19]로 언급될 수 있다.

이 순서의 몇 가지 멤버만이 상세하게 기술되어 있지만[27][28] 더 많은 미지정 멤버는 Aureoccus anophageferens 바이러스(AaV), CpV-BQ2 및 Terra2를 포함합니다.

구조.

Bodo saltans 바이러스 입자 및 그 복제의 초미세 구조

[18] 미미바이러스과의 바이러스는 T=972와 T=1141 사이 또는 T=114 사이의 20면체와 둥근 형상을 가지고 있다.직경은 약 400nm, 길이는 125nm입니다.게놈은 선형으로 분할되지 않으며 길이는 약 1200kb입니다.게놈에는 911의 열린 [1]판독 프레임이 있어


구조. 대칭 게놈 배열 게놈 세그멘테이션
미미바이러스 이십면체 T=972-1141 또는 T=140 (H=19 +/- 1, K=19 +/- 1) 선형 일편단심
클로즈네비루스 이십면체
카페테리아바이러스 이십면체 T=499 선형 일편단심
투판바이러스 테일드

라이프 사이클

복제는 DNA 가닥 치환 모델을 따릅니다.DNA 템플릿 전사는 전사 방법이다.아메바는 자연 [1]숙주 역할을 한다.

호스트 상세 조직 대류성 입력내역 릴리스 상세 레플리케이션 사이트 조립장소 전송
미미바이러스 아메바 없음. 알 수 없는 알 수 없는 알 수 없는 알 수 없는 수동 확산
클로즈네비루스 마이크로조플랭크톤 없음. 알 수 없는 알 수 없는 알 수 없는 세포질 수동 확산
카페테리아바이러스 마이크로조플랭크톤 없음. 알 수 없는 알 수 없는 알 수 없는 세포질 수동 확산

분자생물학

렌틸 바이러스의 게놈 내에서 바이로파지(Sputnik 2)와 이동 유전 요소인 트랜스포브론의 통합 게놈이 보고되었다.트랜스포바이론은 약 7킬로베이스의 선형 DNA 요소로 6개에서 8개의 단백질을 코드하는 유전자를 포함하고 있으며 이중 2개는 바이로파지 유전자와 상동한다.광범위한 미미바이러스과의 비로파지는 미미바이러스 [15]리포터를 사용하여 분리할 수 있다.

임상

미미바이러스는 폐렴과 관련이 있지만 그 의미는 현재 [29]알려져 있지 않다.지금까지 사람에게서 분리된 이 패밀리의 유일한 바이러스는 LBA [30]111이다.이란 파스퇴르 연구소(테란)에서는 실시간 PCR(2018)을 이용해 소아 환자의 기관지 폐포 세척(BAL)과 가래 샘플에서 미미바이러스 DNA를 확인했다.분석 결과 LBA111, 메가바이러스 칠렌시스[31]계보 C의 99% 상동성이 보고되었다.이 발견이 있기 전에 보고된 몇 가지 사례들 때문에, 미미바이러스의 인간 감염성 질병으로서의 합법성은 여전히 [32][33]논란이 되고 있다.

미미바이러스류마티스 [34]관절염에도 관여하고 있다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  2. ^ a b ICTV. "Virus Taxonomy: 2014 Release". Retrieved 15 June 2015.
  3. ^ a b c d e 슐츠, 프레데리크, Yutin,;Ivanova, 나탈리아 N;오르테가, Davi R., 대통령, 태양 권 Vierheilig, 줄리아, Daims, 올게르 루이스, 호른, 마티아스, 바그너, 마이클(4월 7일 2017년)."번역 시스템 요소들을 확장하여 정원을 가지는 거대한 바이러스"(PDF).과학.356(6333):82–85.Bibcode:2017Sci...356...82S.doi:10.1126/science.aal4657.ISSN 0036-8075.PMID 28386012.S2CID 206655792., UCPMS ID:1889607, PDF.
  4. ^ a b Abrahão, Jônatas; Silva, Lorena; Silva, Ludmila Santos; Khalil, Jacques Yaacoub Bou; Rodrigues, Rodrigo; Arantes, Thalita; Assis, Felipe; Boratto, Paulo; Andrade, Miguel; Kroon, Erna Geessien; Ribeiro, Bergmann; Bergier, Ivan; Seligmann, Herve; Ghigo, Eric; Colson, Philippe; Levasseur, Anthony; Kroemer, Guido; Raoult, Didier; Scola, Bernard La (27 2018년 2월)."Tailed 거대한 Tupanvirus는 알고 있는 virosphere의 가장 완전한 병진 장치를 보유하고 있고".자연 통신. 9(1):749.Bibcode:2018NatCo...9..749A. doi:10.1038/s41467-018-03168-1. 1.5829246.PMID 29487281.그림 4, §Discussion:"그 tupanviruses 자매 그룹으로 구성되어 있amoebal mimiviruses… 된".
  5. ^ Bäckström D, Yutin N, Jørgensen SL, Dharamshi J, Homa F, Zaremba-Niedwiedzka K, Spang A, Wolf YI, Koonin EV, Ettema TJ (2019). "Virus genomes from deep sea sediments expand the ocean megavirome and support independent origins of viral gigantism". mBio. 10 (2): e02497-18. doi:10.1128/mBio.02497-18. PMC 6401483. PMID 30837339.PDF
  6. ^ Suzan-Monti, M; La Scola, B; Raoult, D (2006). "Genomic and evolutionary aspects of Mimivirus". Virus Res. 117 (1): 145–155. doi:10.1016/j.virusres.2005.07.011. PMID 16181700.
  7. ^ Raoult, D.; Audic, S; Robert, C; Abergel, C; Renesto, P; Ogata, H; La Scola, B; Suzan, M; Claverie, JM (2004). "The 1.2-Megabase Genome Sequence of Mimivirus". Science. 306 (5700): 1344–50. Bibcode:2004Sci...306.1344R. doi:10.1126/science.1101485. PMID 15486256. S2CID 84298461.
  8. ^ a b c Matthias G. Fischer; Michael J. Allen; William H. Wilson; Curtis A. Suttle (2010). "Giant virus with a remarkable complement of genes infects marine zooplankton". Proceedings of the National Academy of Sciences. 107 (45): 19508–13. Bibcode:2010PNAS..10719508F. doi:10.1073/pnas.1007615107. PMC 2984142. PMID 20974979.
  9. ^ D.R. Garza; C.A. Suttle (1995). "Large double-stranded DNA viruses which cause the lysis of a marine heterotrophic nanoflagellate (Bodo sp.) occur in natural marine viral communities". Aquatic Microbial Ecology. 9 (3): 203–210. doi:10.3354/ame009203.
  10. ^ a b Colson P, Fournous G, Diene SM, Raoult D (2013). "Codon usage, amino acid usage, transfer RNA and amino-acyl-tRNA synthetases in Mimiviruses". Intervirology. 56 (6): 364–75. doi:10.1159/000354557. PMID 24157883.
  11. ^ a b c Gaia M, Benamar S, Boughalmi M, Pagnier I, Croce O, Colson P, Raoult D, La Scola B (2014). "Zamilon, a novel virophage with Mimiviridae host specificity". PLOS ONE. 9 (4): e94923. Bibcode:2014PLoSO...994923G. doi:10.1371/journal.pone.0094923. PMC 3991649. PMID 24747414.
  12. ^ a b c Abraho & et al. 2018, 그림 4(5페이지)를 참조하십시오.
  13. ^ Desnues C, La Scola B, Yutin N, Fournous G, Robert C, Azza S, Jardot P, Monteil S, Campocasso A, Koonin EV, Raoult D (October 2012). "Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109 (44): 18078–83. Bibcode:2012PNAS..10918078D. doi:10.1073/pnas.1208835109. PMC 3497776. PMID 23071316.
  14. ^ Yutin N, Wolf YI, Koonin EV (October 2014). "Origin of giant viruses from smaller DNA viruses not from a fourth domain of cellular life". Virology. 466–467: 38–52. doi:10.1016/j.virol.2014.06.032. PMC 4325995. PMID 25042053.
  15. ^ a b Gaia M, Pagnier I, Campocasso A, Fournous G, Raoult D, La Scola B (2013). "Broad spectrum of mimiviridae virophage allows its isolation using a mimivirus reporter". PLOS ONE. 8 (4): e61912. Bibcode:2013PLoSO...861912G. doi:10.1371/journal.pone.0061912. PMC 3626643. PMID 23596530.
  16. ^ LBA111 및 Powai 호수 메가바이러스에 대해서는 Abraho & et al. 2018, 5페이지의 그림 4를 참조한다.
  17. ^ a b Zhang W, Zhou J, Liu T, Yu Y, Pan Y, Yan S, Wang Y (October 2015). "Four novel algal virus genomes discovered from Yellowstone Lake metagenomes". Sci Rep. 5: 15131. Bibcode:2015NatSR...515131Z. doi:10.1038/srep15131. PMC 4602308. PMID 26459929.
  18. ^ a b Deeg, C.M.; Chow, E.C.T.; Suttle, C.A. (2018). "The kinetoplastid-infecting Bodo saltans virus (BsV), a window into the most abundant giant viruses in the sea". eLife. 7: e33014. doi:10.7554/eLife.33014. PMC 5871332. PMID 29582753.
  19. ^ a b Jonathan Filé: 거대 바이러스와 그 이동 유전 요소: 분자 공생 가설, in: 바이러스학에 대한 현재 의견, Volue 33, 2018년 12월, 페이지 81-88; bioRxiv 2018/04/11/299784
  20. ^ NCBI 완전 게놈: 바이러스, '옐로스톤 호수'를 찾아봐
  21. ^ Moniruzzaman, Mohammad; LeCleir, Gary R.; Brown, Christopher M.; Gobler, Christopher J.; Bidle, Kay D.; Wilson, William H.; Wilhelm, Steven W. (2014). "Genome of brown tide virus (AaV), the little giant of the Megaviridae, elucidates NCLDV genome expansion and host–virus coevolution". Virology. 466–467: 60–70. doi:10.1016/j.virol.2014.06.031. PMID 25035289.
  22. ^ Schvarcz CR, Steward GF (May 2018). "A giant virus infecting green algae encodes key fermentation genes". Virology. 518: 423–433. doi:10.1016/j.virol.2018.03.010. PMID 29649682.
  23. ^ Koonin EV, Krupovic M, Yutin N (April 2015). "Evolution of double-stranded DNA viruses of eukaryotes: from bacteriophages to transposons to giant viruses". Ann. N. Y. Acad. Sci. 1341 (1): 10–24, see Figure 3. Bibcode:2015NYASA1341...10K. doi:10.1111/nyas.12728. PMC 4405056. PMID 25727355.
  24. ^ Yutin N, Colson P, Raoult D, Koonin EV (April 2013). "Mimiviridae: clusters of orthologous genes, reconstruction of gene repertoire evolution and proposed expansion of the giant virus family". Virol. J. 10: 106. doi:10.1186/1743-422X-10-106. PMC 3620924. PMID 23557328.
  25. ^ Carolina Reyes 블로그, Kenneth Stedman:Phaeocystis Globosa 바이러스(OLPG)와 Organic Lake Phycodnavirus는 Phycodnaviridae 또는 Miniviridae의 일부입니까?ResearchGate, 2016년 1월 8일
  26. ^ Maruyama F, Ueki S (2016). "Evolution and Phylogeny of Large DNA Viruses, Mimiviridae and Phycodnaviridae Including Newly Characterized Heterosigma akashiwo Virus". Front Microbiol. 7: 1942. doi:10.3389/fmicb.2016.01942. PMC 5127864. PMID 27965659.
  27. ^ Ghedin E, Claverie JM (August 2005). "Mimivirus relatives in the Sargasso sea". Virol. J. 2: 62. arXiv:q-bio/0504014. Bibcode:2005q.bio.....4014G. doi:10.1186/1743-422X-2-62. PMC 1215527. PMID 16105173.
  28. ^ Monier A, Claverie JM, Ogata H (2008). "Taxonomic distribution of large DNA viruses in the sea". Genome Biol. 9 (7): R106. doi:10.1186/gb-2008-9-7-r106. PMC 2530865. PMID 18598358.
  29. ^ Saadi H, Pagnier I, Colson P, Cherif JK, Beji M, Boughalmi M, Azza S, Armstrong N, Robert C, Fournous G, La Scola B, Raoult D (August 2013). "First isolation of Mimivirus in a patient with pneumonia". Clin. Infect. Dis. 57 (4): e127–34. doi:10.1093/cid/cit354. PMID 23709652.
  30. ^ Yoosuf N, Pagnier I, Fournous G, Robert C, La Scola B, Raoult D, Colson P (April 2014). "Complete genome sequence of Courdo11 virus, a member of the family Mimiviridae". Virus Genes. 48 (2): 218–23. doi:10.1007/s11262-013-1016-x. PMID 24293219. S2CID 12038772.
  31. ^ Sakhaee, Fatemeh; Vaziri, Farzam; Bahramali, Golnaz; Davar Siadat, Seyed; Fateh, Abolfazl (October 2020). "Pulmonary Infection Related to Mimivirus in Patient with Primary Ciliary Dyskinesia". Emerging Infectious Diseases. 26 (10): 2524–2526. doi:10.3201/eid2610.191613. PMC 7510730. PMID 32946733.
  32. ^ La Scola, Bernard; Marrie, Thomas J.; Auffray, Jean-Pierre; Raoult, Didier (March 2005). "Mimivirus in pneumonia patients". Emerging Infectious Diseases. 11 (3): 449–452. doi:10.3201/eid1103.040538. PMC 3298252. PMID 15757563.
  33. ^ Saadi, Hanene; Pagnier, Isabelle; Colson, Philippe; Kanoun Cherif, Jouda; Beji, Majed; Boughalmi, Mondher; Azza, Saïd; Armstrong, Nicholas; Robert, Catherine; Fournous, Ghislain; La Scola, Bernard (24 May 2013). "First isolation of Mimivirus in a patient with pneumonia". Clinical Infectious Diseases. 57 (4): e127–e134. doi:10.1093/cid/cit354. PMID 23709652 – via Oxford Academic.
  34. ^ Shah, N.; Hulsmeier, A. J.; Hochhold, N.; Neidhart, M.; Gay, S.; Hennet, T. (2013). "Exposure to Mimivirus Collagen Promotes Arthritis". Journal of Virology. 88 (2): 838–45. doi:10.1128/JVI.03141-13. PMC 3911627. PMID 24173233.

외부 링크