페닐알라닌:tRNA리가아제
Phenylalanine—t| 페닐알라닌tRNA리가수분해효소 | |||||||||
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| 식별자 | |||||||||
| EC 번호 | 6.1.1.20 | ||||||||
| CAS 번호 | 9055-66-7 | ||||||||
| 데이터베이스 | |||||||||
| 인텐츠 | IntEnz 뷰 | ||||||||
| 브렌다 | 브렌다 엔트리 | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme 뷰 | ||||||||
| 케그 | KEGG 엔트리 | ||||||||
| 메타사이크 | 대사 경로 | ||||||||
| 프라이머리 | 프로필 | ||||||||
| PDB 구조 | RCSB PDB PDBe PDBum | ||||||||
| 진 온톨로지 | AmiGO / QuickGO | ||||||||
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| 페레독신배양항코돈결합도메인 | |||||||||
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 테르무스 서모필러스에서 유래한 페닐알라닐 tRNA 합성효소의 결정 구조 | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| 기호. | FDX-ACB | ||||||||
| 팜 | PF03147 | ||||||||
| 인터프로 | IPR005121 | ||||||||
| SCOP2 | 1피스/SCOPe/SUPFAM | ||||||||
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효소학에서 페닐알라닌-tRNA 연결효소(EC 6.1.1.20)는 화학 반응을 촉매하는 효소이다.
- ATP + L-페닐알라닌 + tRNA { \ AMP + 2인산 + L-페닐알라닐-tRNA
이 효소의 3가지 기질은 ATP, L-페닐알라닌, tRNA이며,Phe 3가지 생성물은 AMP, 2인산, L-페닐알라닐-tRNA이다.Phe
이 효소는 아미노아실-tRNA 및 관련 화합물에서 탄소-산소 결합을 형성하는 결합효소군에 속합니다.이 효소 클래스의 계통명은 L-페닐알라닌:tRNAPhe 연결효소(AMP-forming)이다.일반적으로 사용되는 다른 명칭으로는 페닐알라닐-tRNA 합성효소, 페닐알라닐-tRNA 합성효소, 페닐알라닐-tRNA 합성효소, 페닐알라닐-tRNA 연결효소, 페닐알라닐-tRNA 연결효소, L-페닐알라닐-T 합성효소 및 페닐알라닐-T 합성효소 등이 있다.이 효소는 페닐알라닌, 티로신 및 트립토판 생합성 및 아미노아실-tRNA 생합성에 관여합니다.
페닐알라닌-tRNA 합성효소(PheRS)는 aaRS(아미노아실-tRNA 합성효소) 계열의 가장 복잡한 효소 중 하나로 알려져 있다.세균 및 미토콘드리아 PeRS는 삽입이 없는 표준 이중 분할 알파+베타 모티브를 나타내는 페레독신 접힘 안티코돈 결합(FDX-ACB) 도메인을 공유한다.FDX-ACB 도메인은 4가닥 반평행 베타 시트에 의해 형성된 전형적인 RNA 인식 폴드(RRM)를 나타내며,[1][2][3][4][5] 그에 대해 2개의 나선형이 채워져 있습니다.
구조 연구
2007년 말 현재 이 종류의 효소에 대해 10개의 구조가 해결되었으며 PDB 가입 코드 1B70, 1B7Y, 1EIY, 1JC, 1PYS, 2AKW, 2ALY, 2AMC, 2CXI 및 2IY5가 있다.
레퍼런스
- ^ Mosyak L, Reshetnikova L, Goldgur Y, Delarue M, Safro MG (July 1995). "Structure of phenylalanyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus". Nat. Struct. Biol. 2 (7): 537–47. doi:10.1038/nsb0795-537. PMID 7664121. S2CID 13042127.
- ^ Goldgur Y, Mosyak L, Reshetnikova L, Ankilova V, Lavrik O, Khodyreva S, Safro M (January 1997). "The crystal structure of phenylalanyl-tRNA synthetase from thermus thermophilus complexed with cognate tRNAPhe". Structure. 5 (1): 59–68. doi:10.1016/s0969-2126(97)00166-4. PMID 9016717.
- ^ Rodova M, Ankilova V, Safro MG (February 1999). "Human phenylalanyl-tRNA synthetase: cloning, characterization of the deduced amino acid sequences in terms of the structural domains and coordinately regulated expression of the alpha and beta subunits in chronic myeloid leukemia cells". Biochem. Biophys. Res. Commun. 255 (3): 765–73. doi:10.1006/bbrc.1999.0141. PMID 10049785.
- ^ Moor N, Lavrik O, Favre A, Safro M (September 2003). "Prokaryotic and eukaryotic tetrameric phenylalanyl-tRNA synthetases display conservation of the binding mode of the tRNA(Phe) CCA end". Biochemistry. 42 (36): 10697–708. doi:10.1021/bi034732q. PMID 12962494.
- ^ Klipcan L, Levin I, Kessler N, Moor N, Finarov I, Safro M (July 2008). "The tRNA-induced conformational activation of human mitochondrial phenylalanyl-tRNA synthetase". Structure. 16 (7): 1095–104. doi:10.1016/j.str.2008.03.020. PMID 18611382.
추가 정보
- Stulberg MP (1967). "The isolation and properties of phenylalanyl ribonucleic acid synthetase from Escherichia coli B". J. Biol. Chem. 242 (5): 1060–4. PMID 5335910.
