데이노코쿠스

Deinococcus
데이노코쿠스
Deinococcus radiodurans.jpg
D. 라디오두란스 테트라드
과학적 분류 e
도메인: 박테리아
망울: 디노코코타
클래스: 데이노코치
순서: 디노코칼리스
패밀리: 데이노코쿠스과
브룩스와 머레이, 1981년
지누스: 데이노코쿠스
레이니 외 1997년
동의어 해설
  • 데이노박터 오야이즈 외 1987년

Deinococcus (from the Greek: δεινός, deinos, "dreadful, strange" and κόκκος, kókkos, "granule"[1]) is in the monotypic family Deinococcaceae, and one genus[2] of three in the order Deinococcales[3][4] of the bacterial phylum Deinococcota highly resistant to environmental hazards.이 박테리아들은 그램 양성 얼룩을 주는 두꺼운 세포벽을 가지고 있지만, 두 번째 막을 포함하고 있어서 그램 음성 박테리아에 더 가까운 구조다.디노코커스는 그들의 DNA가 높은 선량의 감마선과 UV 방사선에 노출되었을 때 살아남는다.다른 박테리아들은 내포체를 형성함으로써 방사선이 존재하는 곳에서 구조를 변화시키는 반면, 데이노코쿠스는 세포 형태를 바꾸지 않고 그것을 견디며 굳어진 구조로 후퇴하지 않는다.그들은 또한 그들에게 분홍색을 주는 카로티노이드 색소 디노산틴이 있는 것이 특징이다.그들은 보통 이 두 가지 기준에 따라 격리된다.2020년 8월 과학자들은 국제우주정거장에서 행해진 연구를 바탕으로 지구 박테리아, 특히 데이노코커스 박테리아가 우주 공간에서 3년간 생존하는 것으로 밝혀졌다고 보고했다.이 발견들은 우주 전체에 생명체가 존재한다는 가설인 팬스퍼미아의 개념을 뒷받침한다. 이 가설은 우주 먼지, 유성체, 소행성, 혜성, 행성체 또는 오염된 우주선을 포함한 다양한 방법으로 분포한다.[5][6]

분자 서명

다이노코쿠스의 구성원들은 CSI와 단백질로 알려진 분자 서명을 통해 다른 모든 박테리아와 구별될 수 있다.이전의 데이노코커스에 대한 연구는 이 속 구성원들에 의해 독점적으로 공유된 9개의 CSI와 58개의 CSP를 확인했다.[7]DNA 손상 수리 단백질 PprA와 단일 가닥의 DNA 결합 단백질 DdrB와 같은 확인된 CSP 중 일부는 디노코쿠스의 DNA 수리 메커니즘과 방사선 내성 표현형에서 기능적 역할을 하는 것으로 생각된다.[7]

DNA 수리 단백질에 초점을 맞춘 최근의 연구에서 22개의 CSI가 추가로 이 속에만 특유한 것으로 확인되었으며, 여기에는 방사선 및 산화 손상에 대한 디노코커스 종의 저항 능력에 역할을 한다고 제안된 UvrA1 단백질에 30개의 아미노산 삽입물이 포함된다.[8]

디노코커스(Deinococcus)의 uvrA1 유전자는 dCSP-1(Deinococcus 종에서만 발견되는 transmbrane 단백질), dsbA, dsB의 유전자와 새로운 유전적 연계를 형성하는 것으로 밝혀졌다.후자의 두 단백질은 시스테인이 풍부한 모티브(CXXC)의 산화저감을 통해 단백질에서 이황화 결합을 형성하는 데 중심적인 역할을 한다.[9]위의 유전자 군집은 디노코쿠스 종 특유의 새로운 피연산자를 형성하고 인코딩된 단백질은 방사선으로 인한 반응성 산화종에 의한 DNA 손상과 싸우기 위해 함께 기능할 것으로 예측된다.[8]

UvrA1에 존재하는 30a CSI와 DsbA에 존재하는 또 다른 5-7a CSI는 단백질의 표면 루프에 위치한다.이러한 CSI에 의해 형성된 표면 노출 루프/패치는 단백질-단백질 상호작용을 매개하는 것으로 생각되며, 따라서 궁극적으로 산화 손상을 개선시키는 일련의 전자 전달을 촉진한다.[8]

종

2011년[update] 8월 현재, 국립 생명공학 정보 센터(NCBI)에 따르면 47종의 데이노코쿠스가 있다.

Phylogeny

참고 항목: 세균 분류법

현재 승인된 분류법은 명목상 입석(LPSN)과 NCBI를[42] 기준으로 하며, 계통생성은 '전종 살아있는 나무' 프로젝트에서 16S rRNA 기반 LTP 릴리즈 132를 기준으로 한다.[43]

D. 요법 레이니와 다 코스타 2005

D. 과리딜리토리스 레이니 외 2007년

D. 파파고넨시스 레이니와 다 코스타 2005

D. 야바파이엔시스 레이니와 다 코스타 2005

D. 미사센시스 아케르 외 2008년

D. 셀룰로실리틱스 Weon et al. 2007

D. 로제우스 아케르 외 2008년

마리코펜시스 레이니와 다 코스타 2005

소노렌시스 레이니와 다 코스타 2005

D. 방사성동위원소 칼레건 외 2008년

D. 고도 칼레건 외 2008년

D. 아키라디오콜라 아스카르 외2009

클라우디오니스 칼레건 외 2008년

D. 알피니툰드라 칼레건 외 2008년

D. 방사성동위원소 (Lewis 1973년 제외) 책과 머레이 1981

디피시스 샤시다르와 반데카르 2009

D. 프로테롤리틱스 브룩스와 머레이, 1981년

D. 신장염 펑 외2009

D. 남극점 동 외 2015

D. 카리 Kim et al. 2015

디 아쿠아틸리스 캄페르 외 2008년

D. concensis 소라트 외 2015년

디 피쿠스 라이 외 2006년 에멘드.캄페르 2009

D. 페니키스 Vaishampayan, Venkateswaran & Schwendner 2014

D. 망막염 첸 외 2012년

D. 시트리 아흐메드 외 2014년

D. 고바이엔시스 위안 외2009

D. 인디쿠스 수레쉬 외2004

D. 래디오두란스(Raj et al. 1960 제외) 브룩스와 머레이 1981(타입 sp)

D. wumluqiensis 왕 외 2010년

D. 래디오톨레란스 차 외 2015년

D. 데데르티 드 그루트 외 2005년

D. 호호카멘시스 레이니와 다 코스타 2005

D. 나바조넨시스 레이니와 다 코스타 2005

D. 케니 Im et al. 2008

D. 아쿠아투스 Im et al. 2008

D. 탈고민 아케르 외 2011

D. 대전시 신리바산 외 2012년

D. 액티노스클레루스 Joo et al. 2016

D. 그란디스 (오야이즈 외. 1987년) 레이니 외. 1997년

D. 메탈리 펑 외 2015년

D.윤웨이엔시스 장 외 2007년

D. 호피엔시스 레이니와 다 코스타 2005

D. 머레이이 페레이라 외 1997년

D. 메탈라투스 Kim et al. 2015

D. 지열 페레이라 외 1997년

D. apachensis 레이니와 다 코스타 2005

D. 에리어스 양 외2009

D. 아메트리우스 양 외 2010년

D. 에어로필루스 유 외 2010

D. 후미 신리바산 외 2012년

D. 에어로라투스 유 외 2010

D. swuensis Lee et al. 2015

D. 방사광 브룩스와 머레이, 1981년

D. 마모리스 허쉬 외 2006년

D. 색시콜라 허쉬 외 2006년

D. 프리겐스 허쉬 외 2006년

메모들

  1. ^ a b 국립생명공학정보센터(NCBI)에서 발견된 변형률이지만 LPSN(Listing in Nomenclature, LPSN)이 있는 프로카리오틱스 이름 목록에는 나열되지 않았다.

참조

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