복잡한 시스템 생물학

Complex systems biology

복잡한 시스템 생물학(CSB)은 생물학적 유기체에서의 구조와 기능의 복잡성뿐만 아니라 생물과 종의 출현과 진화에 대해 로버트 로젠이 발명한 수학적, 이론적 생물학의 한 분야 또는 하위 분야로, 생물학적 네트워의 상호연계성과 그 내에서의 상호연계성에 중점을 두고 있다.추론, 그리고 삶에 내재된 근본적인 관계를 모델링.[1][2][3][4]

바이아누 외 연구진에 따르면. CSB는 복잡한 시스템 이론과 시스템 생물학의 더 전통적인 개념들과 부분적인 중복만을 가지고 있는 분야인데, CSB는 철학과 인간의 의식과 관련이 있기 때문이다. 더욱이 수학은 광범위한 복잡한 시스템을 모델링할 수 있지만, 이것은 관련이 없다고 주장한다.[5]

복합 적응형 시스템의 네트워크 표현

유기체와 생물권의 복잡성

생물학에는 복잡성에 대한 만족스러운 정의가 없다.[6][7]

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로젠에 따르면, 대부분의 복잡한 시스템 모델은 19세기 이후 생물학이 성공적으로 모델링되었지만 게놈이나 유기체와 같은 생물학적 주제에 관한 것이 아니다.[3][8][9][10]

정보이론과 네트워크 위상/그래프 이론에 근거한 두 가지 접근법이 결합되어 인간의 의식을 모형화하였다.[5][11]

온톨로지(현실의 철학적 형이상학)에 대해서는, 현실과 구별되는 조직의 복잡성 수준의 서열이 있다고 상정하고 있다.[5][12][13]

Baianu 외 연구진은 질서, 가족, 속, 종 등과 같은 분류학적 등급이 생물학에서 조직의 복잡성 수준의 계층을 반영한다고 주장한다.[5]

유기체의 가변성, 치유 능력, 자가 재생산 능력 등으로 인해 유기체는 CSB에서 보다 단순한 시스템의 '메타 시스템'으로 정의된다.[5][14] 메타 시스템은 시스템의 시스템이다.[14] 아우토피에시스는 또한 이러한 생물학적 시스템들을 모델링하지만,[15] 생물학에서 메타 시스템은 그러한 시스템 시스템과 동등하지 않다고 주장한다.[5] 그들은 또한 그것이 켄트 D가 블로그에 정의한 메타 시스템과 다르다고 주장한다. 유기체는 기계나 로봇과는 다르기 때문에 팔머다[16][17].[5] 만약, Hopcroft 외 연구진에 따르면, 로봇이나 오토마타가 상태, 시작 상태, 입력 및 출력 세트/알파벳, 전환 기능의 5가지 품질로 정의될 수 있다면,[18] 유기체는 다르다.[5]

복잡한 시스템 생물학의 주제

복잡한 신호 전달 경로

다음은 복잡한 시스템 생물학에서 다루는 주제 목록이다.

참고 항목

메모들

  1. ^ 도날드 스누크스, 그래미, "복잡한 생활 시스템의 일반 이론: 역동성의 수요 측면 탐구", 복잡성, 13권, 6권, 2008년 7월/8월.
  2. ^ Baianu, I. C. (2006). "Robert Rosen's Work and Complex Systems Biology". Axiomathes. 16 (1–2): 25–34. doi:10.1007/s10516-005-4204-z. S2CID 4673166.
  3. ^ a b Rosen, R. (1958b). "The Representation of Biological Systems from the Standpoint of the Theory of Categories". Bulletin of Mathematical Biophysics. 20 (4): 317–341. doi:10.1007/bf02477890.
  4. ^ a b Rosen, R. (1958a). "A Relational Theory of Biological Systems". Bulletin of Mathematical Biophysics. 20 (3): 245–260. doi:10.1007/bf02478302.
  5. ^ 보너, J. T. 1988 자연선택을 통한 복잡성의 진화. 프린스턴: 프린스턴 대학 출판부.
  6. ^ 헤이글리헨, 프란시스 (2008) "복잡성과 자기 조직화". Bates, Marcia J.; Maack, Mary Niles. 도서관과 정보과학의 백과사전. CRC. ISBN 978-0-8493-9712-7
  7. ^ ^ 헤이리겐, 프란시스(2008) "복잡성과 자기 조직화". Bates, Marcia J.; Maack, Mary Niles. 도서관과 정보과학의 백과사전. CRC. ISBN 978-0-8493-9712-7
  8. ^ 톰슨, 다시 W, 1992년 성장과 형태. 도버 재인쇄, 1942년 제2판 (제1판, 1917년) ISBN 0-486-67135-6
  9. ^ "추상적인 관계 생물학(ARB)" 행성물리학. 2010-03-17 검색됨
  10. ^ http://hdl.handle.net/10101/npre.2011.6115.1 월러스, 로드릭. 스판드렐이 아치가 되는 경우: 신경 크로스스토크와 의식의 진화. Nature 선행 조건(2011년)에서 이용 가능
  11. ^ Poli R (2001a). "The Basic Problem of the Theory of Levels of Reality". Axiomathes. 12 (3–4): 261–283. doi:10.1023/A:1015845217681. S2CID 55743057.
  12. ^ Poli R (1998). "Levels". Axiomathes. 9 (1–2): 197–211. doi:10.1007/bf02681712. PMID 8053082.
  13. ^ a b 메타시스템 전환이론, 발렌틴 터친, 클리프 조슬린, 1993-1997
  14. ^ 반사성 자가포피에틱 시스템 이론
  15. ^ 켄트 D 메타 시스템 엔지니어링 팔머, 1996년
  16. ^ 호프, M.A., 로기아, K.G., 메네제스, P.B.: (2004) 변환 구성: 동적 토폴로지를 갖는 시스템의 프레임워크. 국제 컴퓨팅 저널 예상 시스템 14:259–270
  17. ^ 존 E. 홉크로프트, 라지프 모트와니, 제프리 D. 울만.2000. 오토마타 이론, 언어 및 계산 소개(2판)피어슨 교육. ISBN 0-201-44124-1
  18. ^ Rosen, R. 1960. (1960). "A quantum-theoretic approach to genetic problems". Bulletin of Mathematical Biophysics. 22 (3): 227–255. doi:10.1007/BF02478347.
  19. ^ Baianu, I. C.: 2006 (2006). "Robert Rosen's Work and Complex Systems Biology". Axiomathes. 16 (1–2): 25–34. doi:10.1007/s10516-005-4204-z. S2CID 4673166.
  20. ^ Rosen, R.: 1958b (1958). "The Representation of Biological Systems from the Standpoint of the Theory of Categories". Bulletin of Mathematical Biophysics. 20 (4): 317–341. doi:10.1007/BF02477890.

인용된 참고자료

  • Baianu, I. C., 생물학과 의학에서의 컴퓨터 모델과 오토마타 이론, M의 모노그래프, 11장. 비튼(편집자), 의학 수학적 모델, 제7권, 제7권: 1513-1577 (1987), 페르가몬 프레스:뉴욕, (2004년 시아오 첸 린 업데이트 ISBN 0-08-036377-6
  • 렌쇼, E, 공간과 시간의 생물학적 개체군 모델링. C.U.P., 1991. ISBN 0-521-44855-7
  • Rosen, Robert.191, Life Iself: A 포괄적 조사, 생명의 기원 및 제작, Columbia University Press는 사후에 다음과 같이 출판되었다.
  • 로젠, 로버트 .1970. 생물학의 역동적인 시스템 이론. 뉴욕, 와일리-인터사이언스 ISBN 0-471-73550-7
  • 로젠, 로버트 2000년, 컬럼비아 대학 출판부의 인생 그 자체에 대한 에세이.
  • 로젠, 로버트 2003년 로젠 엔터프라이즈는 "예상적 시스템; 철학적, 수학적, 방법론적 재단"이라고 말했다.

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