본질적으로 무질서한 단백질

Intrinsically disordered proteins
SMO-1 단백질의 배향 유연성(PDB:1a5r).중앙부분은 비교적 질서정연한 구조를 보여줍니다.반대로, N 말단 및 C 말단 영역(각각 왼쪽 및 오른쪽)은 짧은 나선 영역이 N 말단 꼬리 부분에 지속되지만 '내막 장애'를 나타낸다.10개의 대체 NMR 모델이 모핑되었다.2차 구조 요소: α-헬리체(빨간색), β-스트랜드(파란색 화살표)[1]

또는 일반적으로 3차원 structure,[2][3][4]주문한 다른 단백질이나 RNA 같은 고분자의 상호 작용한 파트너의 부재에 고정이 부족한 본질적으로 어수선한 단백질(4월 1일까지 IDP)은 단백질이다. 완전히 조직화되지 않은 부분적으로 구조화까지의 IDP는 범위와 랜덤 코일, moltenglobule-like 골재 또는 연성을 포함한다.linkers큰 다도메인 단백질에서.그것들은 때때로 구상, 섬유질,[5] 막 단백질과 함께 단백질의 별개의 클래스로 간주된다.

IDP는 매우 크고 기능적으로 중요한 단백질의 종류이고 그들의 발견은 단백질의 3차원 구조가 그들의 생물학적 기능을 달성하기 위해 고정되어야 한다는 생각을 반증했다.예를 들어, IDP는 매우 협조적이고 역동적인 약한 다가 상호작용에 참여하는 것으로 확인되었으며, DNA 조절과 세포 신호 [6]전달에서 중요성을 부여합니다.[7] 많은 IDP는 또한 다른 고분자와 결합 후 고정된 3차원 구조를 채택할 수 있다.전반적으로, IDP는 많은 면에서 구조화된 단백질과 다르며 독특한 기능, 구조, 배열, 상호작용, 진화 및 [8]조절을 갖는 경향이 있다.

역사

크게 유연한 단백질 사슬을 나타내는 틸라코이드 수용성 인산단백질 TSP9의 NMR 구조의 앙상블.[9]

1930년대와 1950년대에, 최초의 단백질 구조는 단백질 결정학에 의해 해결되었다.이러한 초기 구조는 단백질의 생물학적 기능을 중재하기 위해 일반적으로 고정된 3차원 구조가 필요할 수 있음을 시사했다.이러한 출판물은 단백질의 아미노산 배열이 구조를 결정한다는 점에서 분자생물학의 중심 교리를 굳혔다.1950년에 Karush는 '구성적응성'에 대해 이 가정을 반박하는 글을 썼다.그는 단백질이 동일한 에너지 수준에서 둘 이상의 구성을 가지고 있으며 다른 기질에 결합할 때 하나를 선택할 수 있다고 확신했다.1960년대에, 레빈탈의 역설은 긴 폴리펩타이드의 체계적 입체구조 탐색이 생물학적으로 관련된 시간표에서 단일 접힌 단백질 구조를 산출할 가능성이 낮다는 것을 시사했다.특이하게도 많은 (작은) 단백질 또는 단백질 도메인의 경우 비교적 빠르고 효율적인 리폴딩이 체외에서 관찰될 수 있다.1973년 Anfinsen의 도그마에 기술된 바와 같이, 이러한 단백질의 고정 3D 구조는 1차 구조(아미노산 배열)에 독특하게 부호화되어 있으며, (근접한) 생리 조건 하에서 동태적으로 접근 가능하고 안정적이며, 따라서 이러한 "질서 있는"[10] 단백질의 고유 상태로 간주될 수 있다.

그러나 이후 수십 년 동안 많은 큰 단백질 영역을 X선 데이터 세트에 할당할 수 없었으며, 이는 전자 밀도 맵에서 평균적인 여러 위치를 차지하고 있음을 나타낸다.결정 격자에 대한 고정적이고 독특한 위치가 부족하다는 것은 이러한 영역이 "무질서"하다는 것을 암시한다.단백질의 핵자기공명분광학은 또한 많은 해결된 구조 앙상블에서 크고 유연한 링커와 흰개미의 존재를 입증했다.

2001년 던커 교수는 2000년대에 [12]더 많은 양적 분석이 가능해지면서 새롭게 발견된 정보가 50년[11] 동안 무시되지 않았는지에 대해 의문을 제기했다.2010년대에 IDP가 알파-시뉴클레인 [13]및 타우와 같은 질병 관련 단백질에서 흔하다는 것이 명확해졌다.

풍부

현재 단백질은 유사한 구조의 앙상블로서 존재하며, 일부 영역은 다른 영역보다 더 제약이 있다고 일반적으로 받아들여지고 있다.IDP는 이러한 유연성의 스펙트럼의 최첨단을 차지하며 상당한 국소 구조 경향의 단백질 또는 유연한 다중 도메인 [14][15]어셈블리를 포함한다.

생물정보학적 예측은 내재성 질환이 단백질 데이터베이스의 알려진 구조보다 게놈과 프로테옴에서 더 흔하다는 것을 보여주었다.DISOPRED2 예측에 따르면, 특정 질병 [13]관련 단백질을 포함한 긴(잔기 30개 이상) 무질서 세그먼트는 시조류 2.0%, 유균 4.2%, 진핵생물 [12]단백질 33.0%에서 발생한다.

생물학적 역할

단백질의 고도로 역동적인 무질서 영역은 알로스테릭 조절 및 효소 촉매 [14][15]작용과 같은 기능적으로 중요한 현상과 연관되어 있다.많은 흐트러진 단백질은 번역 후 수정에 의해 조절된 수용체와 결합 친화력을 가지며, 따라서 흐트러진 단백질의 유연성은 수정 [16]효소 및 수용체와 결합하기 위한 다양한 구조 요건을 용이하게 한다고 제안되어 왔다.내인성 장애는 특히 세포 신호 전달,[17][18] 전사 및 염색질 리모델링 기능과 관련된 단백질에서 농축된다.최근에 태어난 유전자는 더 높은 장애를 [19][20]가지고 있는 경향이 있다.

유연한 링커

무질서 영역은 도메인을 연결하는 유연한 링커 또는 루프로서 자주 볼 수 있습니다.링커 배열은 길이가 매우 다양하지만 일반적으로 극성 무충전 아미노산이 풍부합니다.유연한 링커는 연결 도메인을 자유롭게 비틀고 회전시켜 단백질 도메인 역학을 통해 결합 파트너를 모집할 수 있도록 합니다.그들은 또한 그들의 결합 파트너가 장거리 알로스테리를 [14][2]통해 더 큰 규모의 구조 변화를 유도하도록 합니다.FKBP25의 2개의 도메인을 접속하는 FBP25의 유연한 링커는 FKBP25와 DNA의 [21]결합에 중요합니다.

선형 모티브

선형 모티브는 다른 단백질 또는 다른 생체 분자(RNA, DNA, 설탕 등)와의 기능적 상호작용을 매개하는 단백질의 짧은 무질서한 세그먼트이다.선형 모티브의 많은 역할은 세포 조절, 예를 들어 세포 형상의 제어, 개별 단백질의 세포하 국재화 및 조절된 단백질 교체와 관련이 있다.종종, 인산화와 같은 번역 후 수정은 특정 상호작용에 대한 개별 선형 모티브의 친화력을 조절한다(흔히 몇 가지 크기에 의해 조절된다.비교적 빠른 진화와 새로운 (저선호도) 인터페이스를 확립하기 위한 비교적 적은 수의 구조적 제약으로 인해 선형 모티브를 검출하는 것이 특히 어렵지만 광범위한 생물학적 역할과 감염된 세포를 효율적으로 재코딩하기 위한 많은 바이러스가 시기적절한 요생성을 강조한다.이 매우 도전적이고 흥미로운 주제에 대한 연구의 cy.구상 단백질과 달리, IDP는 공간적으로 배치된 활성 주머니를 가지고 있지 않습니다.그럼에도 불구하고, NMR에 의해 상세한 구조적 특성을 받는 IDP의 80%(~3개)에는 표적 인식을 위해 준비된 일시적인 2차 구조 요소인 PreSMOS(사전 구조 모티브)라는 선형 모티브가 있다.여러 경우에 이러한 과도 구조가 표적 결합 시 완전하고 안정적인 2차 구조(예: 나선 구조)가 된다는 것이 입증되었다.따라서 PreSMOS는 IDP의 [22]추정 액티브사이트입니다

결합 접기 및 바인딩

많은 구조화되지 않은 단백질은 목표물에 결합할 때 보다 질서 있는 상태로 전환된다(예: 분자 인식 특징(MoRFs)).[23]결합된 접힘과 결합은 국소적일 수 있으며, 소수의 상호작용 잔류물만 포함할 수도 있고 전체 단백질 도메인을 포함할 수도 있다.최근 결합된 접힘과 결합은 완전히 구조화된 단백질만이 훨씬 더 [24]클 때 가능한 넓은 표면적을 매장할 수 있도록 하는 것으로 나타났다.또한, 어떤 무질서한 영역은 작은 분자 결합, DNA/RNA 결합,[25] 이온 상호작용 등과 같은 분자 인식에 따른 질서 있는 배합으로 전환함으로써 특정 생물학적 기능을 조절하는 "분자 스위치" 역할을 할 수 있다.

무질서한 단백질이 결합하는 능력, 즉 기능을 발휘하는 능력은 안정성이 필수 조건이 아님을 보여준다.짧은 선형 모티브와 같은 많은 짧은 기능 부위는 무질서한 단백질로 과잉 표현된다.Hendra 바이러스, HCV, HIV-1 및 인간 유두종 바이러스와 같은 많은 RNA 바이러스에 특히 무질서한 단백질과 짧은 선형 모티브가 풍부하다.이것은 그러한 바이러스가 많은 숙주 세포 [26][27]단백질의 결합과 조작을 용이하게 함으로써 정보적으로 제한된 게놈을 극복할 수 있게 한다.

결합 상태에서의 장애(퍼지 복합체)

본질적으로 무질서한 단백질은 다른 단백질과 특이하게 결합할 때에도 그들의 입체구조적 자유를 유지할 수 있다.바운드 상태의 구조적 장애는 정적 또는 동적일 수 있습니다.퍼지 복합체에서는 기능을 위해 구조적 다중성이 필요하며, 바운드된 무질서 영역의 조작은 활동을 변화시킨다.복합체의 입체구조 앙상블은 번역 후 수정 또는 단백질 [28]상호작용을 통해 조절된다.DNA 결합 단백질의 특이성은 종종 대체 스플라이싱에 [29]의해 변화하는 퍼지 영역의 길이에 의존한다.다른 연구에서는 다른 농도 [31]조건에서 동일한 시스템에 대해 다른 친화력 값을 보였지만, 일부 퍼지 복합체는 높은 결합 [30]친화력을 보일 수 있다.

구조면

본질적으로 무질서한 단백질은 세포의 조건에 따라 생체 내에서 많은 다른 구조들을 적응시켜 구조적이거나 입체적인 [32][33]앙상블을 형성한다.

따라서 이들의 구조는 기능과 강하게 관련되어 있다.그러나, 소수의 단백질만이 그들의 고유 상태에서 완전히 무질서하다.장애는 대부분 잘 구조화된 단백질 내의 본질적으로 무질서한 영역(IDR)에서 발견됩니다.따라서 본질적으로 무질서 단백질(IDP)이라는 용어는 완전히 무질서한 단백질뿐만 아니라 IDR을 포함하는 단백질을 포함한다.

단백질 장애의 존재와 종류는 아미노산 [2]배열로 암호화되어 있다.일반적으로, IDP는 부피가 큰 소수성 아미노산의 함량이 낮고 극성 및 하전성 아미노산의 비율이 높은 것이 특징이며, 보통 낮은 소수성으로 [32]언급됩니다.이 성질은 물과 좋은 상호작용으로 이어집니다.또한 고순전하는 등전하 [33]잔류물에 기인하는 정전기 반발에 의해 무질서를 촉진한다.따라서 무질서한 배열은 안정적인 구상 단백질로 접히도록 소수성 코어를 충분히 묻을 수 없다.어떤 경우, 무질서한 배열의 소수성 클러스터는 결합 접힘과 결합을 겪는 영역을 식별하기 위한 단서를 제공한다(생물학적 역할 참조).많은 흐트러진 단백질은 규칙적인 2차 구조가 없는 영역을 드러낸다.이러한 영역은 구조화된 루프에 비해 유연하다고 할 수 있습니다.후자는 강성이며 라마찬드란 각도의 한 세트만 포함하지만 IDP는 여러 [33]각도의 집합을 포함한다.유연성이라는 용어는 잘 구조화된 단백질에도 사용되지만, 무질서한 단백질의 맥락에서 다른 현상을 설명한다.구조화된 단백질의 유연성은 평형 상태에 결합되지만,[33] IDP에서는 그렇지 않다.또한 많은 무질서한 단백질은 낮은 복잡성 배열, 즉 소수의 잔류물이 과도하게 표현된 배열도 나타낸다.저복잡도 배열이 무질서의 강력한 징후인 반면, 그 반대가 반드시 맞는 것은 아니다. 즉, 모든 무질서한 단백질이 저복잡도 배열을 갖는 것은 아니다.무질서한 단백질은 예측된 2차 구조의 함량이 낮다.

실험 검증

IDP 는, 몇개의 컨텍스트로 검증할 수 있습니다.IDP의 실험 검증을 위한 대부분의 접근법은 추출되거나 정제된 단백질로 제한되는 반면, 일부 새로운 실험 전략은 온전한 살아있는 세포 내에서 IDP의 생체 내 배치와 구조적 변화를 탐색하고 생체 내 및 생체 내 역학 간의 체계적인 비교를 목표로 한다.

생체내 접근법

내인성 질환의 생체 내 지속성에 대한 첫 번째 직접 증거는 정제된 IDP의 전기화 및 세포의 온전한 [34]상태로 회복 시 세포 내 NMR에 의해 달성되었다.

이제 비오틴 '도장'[35][36]을 사용하여 IDR 예측의 대규모 생체 내 검증이 가능합니다.

시험관내 접근법

본질적으로 전개된 단백질은 일단 정제되면 다양한 실험 방법으로 식별될 수 있다.단백질의 무질서한 영역에 대한 정보를 얻는 일차적인 방법은 NMR 분광법이다.X선 결정학 연구에서 전자 밀도의 부족도 무질서의 징후일 수 있습니다.

접힌 단백질은 높은 밀도(0.72~0.74 mL/g의 부분 비적)와 상대적으로 작은 회전반경을 가진다.따라서 전개된 단백질은 크기 제외 크로마토그래피, 분석적 초원심화, 소각 X선 산란(SAXS), 확산 상수 측정 등 분자 크기, 밀도 또는 유체역학적 항력에 민감한 방법으로 검출할 수 있다.전개된 단백질은 원 UV(170-250 nm) 원형 이색성(특히 200 nm에서 뚜렷한 최소값) 또는 적외선 분광법에 의해 평가된 2차 구조가 없는 것이 특징이다.그래서 그들은 선뜻 proteases에 의해,(팔짱 낀 단백질 일반적으로 dispersions은 아미드 양자를 위해 5ppm으로 큰 보여 주는 급속한hydrogen-deuterium 교환과 그들의 경수소 아미드 화학 교대로 전시회 작은 분산(<>1ppm)로 NMR.에 의해 측정된 것을 받다 cleaved 있Unfolded 단백질은 또한, 등뼈 펩티드 그룹 용매에 노출된 폭로했다.)최근에는 고속 [37][38]병렬 단백질 분해(FASTPP)를 포함한 새로운 방법이 도입되어 정제 필요 없이 접히거나 무질서한 비율을 결정할 수 있다.최근 트로포미오신-트로포닌 [39]단백질 상호작용을 사용하여 증명된 FASTpp를 사용하여 미센스 돌연변이의 안정성, 단백질 파트너 결합 및 (자기) 중합 유도 코일 접힘의 미세한 차이를 검출할 수 있다.완전 비정형 단백질 영역은 짧은 소화 시간과 낮은 단백질 분해효소 농도를 [40]사용하여 단백질 분해에 대한 과민성으로 실험적으로 검증될 수 있다.

IDP 구조와 역학을 연구하기 위한 벌크 방법에는 앙상블 형상 정보를 위한 SAXS, 원자론적 앙상블 미세화를 위한 NMR, 분자 상호작용과 구조 전환을 시각화하기 위한 형광, 그렇지 않으면 단단한 단백질 결정에서 더 많은 이동 영역을 강조하기 위한 X선 결정학, 프로의 덜 고정된 부분을 드러내기 위한 저온 전자파(cryo-EM) 등이 있다.통조림, IDP의 크기 분포를 모니터링하기 위한 빛 산란 또는 그 집합 속도론, IDP의 2차 구조를 모니터링하기 위한 NMR 화학적 이동 및 원형 이색성.

Single-molecule 방법의 IDP는 공부를 하기 위해 nanopores[43], 자기 tweezers[44]을 공부하기 위해 IDPs의 전역 형태 분포를 밝히는 것 ofstspFRET[41]의 IDP는의 형태 유연성 공부를 하고 구조적 전환의 동역학, 광학 tweezers[42]의 IDP는의 앙상블과 그들의 올리고 모는 또는 총체로 고해상도의 통찰력에 해당한다ructural 교통저력으로 장시간 이온, 고속 AFM을[45] 통해 IDP의 시공간 유연성을 직접 시각화할 수 있습니다.

장애 주석

비고 465 - 단백질 장애를 나타내는 X선 구조에서 누락된 전자 밀도(PDB: 1a22, 수용체에 결합된 인간 성장 호르몬).VMD를 통한 PDB 데이터베이스 및 분자 표현 스크린샷 편집. 파란색 및 빨간색 화살표는 각각 수용체 및 성장 호르몬에 잔류물이 없음을 나타냅니다.

내인성 장애는 실험 정보로부터 주석을 달거나 특수 소프트웨어로 예측할 수 있습니다.장애 예측 알고리즘은 1차 배열 구성, 단백질 X선 데이터 세트의 미지정 세그먼트와의 유사성, NMR 연구의 유연한 영역 및 아미노산의 물리 화학적 특성에 기반하여 높은 정확도(약 80%)로 고유 장애(ID) 성향을 예측할 수 있다.

장애 데이터베이스

내재적 장애 정보로 단백질 시퀀스에 주석을 달기 위한 데이터베이스가 구축되었다.DisProt 데이터베이스에는 무질서로 실험적으로 결정된 수작업으로 큐레이션된 단백질 세그먼트의 모음이 포함되어 있습니다.MobiDB는 실험적으로 큐레이션된 장애 주석(예: DisProt에서)을 X선 결정 구조 및 NMR 구조의 유연한 영역에서 누락된 잔류물에서 파생된 데이터와 결합하는 데이터베이스이다.

시퀀스별 IDP 예측

무질서한 단백질에서 무질서를 분리하는 것은 무질서 예측을 위해 필수적이다.IDP와 비 IDP를 구별하는 인자를 찾는 첫 번째 단계 중 하나는 아미노산 조성물 내에서 편견을 특정하는 것이다.다음의 친수성 하전아미노산 A, R, G, Q, S, P, E, K는 무질서 촉진아미노산이며, 순서 촉진아미노산 W, C, F, I, Y, V, L, N은 소수성 및 무전하이다.나머지 아미노산 H, M, T, D는 질서 있는 영역과 구조화되지 않은 [2]영역 모두에서 모호하다.보다 최근의 분석에서는 아미노산이 다음과 같이 무질서 영역을 형성하는 경향에 따라 순위가 매겨졌다(무질서 촉진 순서).W, F, Y, I, M, L, V, N, C, T, A, G, R, D, H, Q, K, S, E, P.[46]

이 정보는 대부분의 시퀀스 기반 예측 변수의 기초입니다.NO Regular Secondary Structure([47]NORS; 정규 2차 구조) 영역이라고도 하는 2차 구조가 거의 없거나 전혀 없는 영역과 복잡도가 낮은 영역을 쉽게 검출할 수 있습니다.그러나 모든 무질서한 단백질이 이처럼 낮은 복잡도 서열을 포함하는 것은 아니다.

예측 방법

주요 기사:장애 예측 소프트웨어 목록

생화학적 방법에서 무질서 영역을 결정하는 것은 매우 많은 비용과 시간이 소요됩니다.IDP의 가변적인 특성으로 인해 IDP 구조의 특정 측면만 검출할 수 있기 때문에 완전한 특성화를 위해서는 많은 다른 방법 및 실험이 필요합니다.이것에 의해, IDP 판정에 드는 코스트가 한층 더 증가합니다.이를 극복하기 위해 단백질 구조와 기능을 예측하기 위한 컴퓨터 기반 방법을 개발한다.예측을 통해 지식을 얻는 것이 생물정보학의 주요 목표 중 하나이다.IDP 함수 예측 변수도 개발 중이지만 선형 모티브 사이트 [4][48]등 구조 정보를 주로 활용한다.다른 구조 및/또는 생물물리학적 특성에 기초한 신경망 또는 매트릭스 계산과 같은 IDP 구조를 예측하는 다른 접근법이 있다.

많은 계산 방법은 단백질의 [49]무질서 여부를 예측하기 위해 시퀀스 정보를 이용한다.이러한 소프트웨어의 대표적인 예로는 IUPRED와 Disopred가 있습니다.방법에 따라 무질서의 정의가 다를 수 있습니다.메타 예측 변수는 서로 다른 기본 예측 변수를 결합하여 보다 적절하고 정확한 예측 변수를 생성하는 새로운 개념을 보여줍니다.

무질서한 단백질을 예측하는 다른 접근법 때문에, 그들의 상대적 정확성을 추정하는 것은 매우 어렵다.예를 들어, 신경 네트워크는 종종 다른 데이터 세트에 대해 훈련됩니다.장애 예측 범주는 2년마다 실시되는 CASP 실험의 일부로, 3D 구조가 누락된 영역(PDB 파일에 RARK465로 표시됨, X선 구조의 전자 밀도가 누락된 영역)을 정확하게 찾기 위해 방법을 테스트하도록 설계되었습니다.

장애와 질병

본질적으로 구조화되지 않은 단백질은 많은 [13]질병과 관련되어 있다.잘못 접힌 단백질의 집적은 그 단백질들이 서로 무작위로 결합하기 시작하고 암이나 심혈관 질환으로 이어질 수 있기 때문에 많은 시뉴클레오티스와 독성의 원인이다.따라서, 잘못된 접힘은 유기체의 일생 동안 수백만 개의 단백질 복사가 만들어지기 때문에 자연적으로 일어날 수 있다.본질적으로 구조화되지 않은 단백질 α-시뉴클린의 집적이 원인인 것으로 생각된다.이 단백질의 구조적 유연성과 세포 내 변형에 대한 민감성은 잘못된 접힘과 응집으로 이어진다.미토콘드리아 장애뿐만 아니라 유전학, 산화적 스트레스 및 질화적 스트레스는 구조화되지 않은 α-시뉴클레인 단백질 및 관련 [50]질병 메커니즘의 구조적 유연성에 영향을 미친다.많은 주요 종양 억제제는 p53 및 BRCA1과 같이 본질적으로 구조화되지 않은 큰 영역을 가지고 있습니다.단백질의 이 부분들은 그들의 많은 상호작용을 매개하는 역할을 한다.세포의 고유 방어 메커니즘을 모범 약물로 하여 유해 기질의 위치를 차단하고 억제함으로써 질병을 [51]중화시킬 수 있다.

컴퓨터 시뮬레이션

높은 구조적 이질성으로 인해 얻어진 NMR/SAXS 실험 매개변수는 매우 다양하고 무질서한 상태(무질서 상태의 앙상블)의 다수의 평균이 될 것이다.따라서, 이러한 실험 매개변수의 구조적 의미를 이해하기 위해서는 컴퓨터 시뮬레이션에 의한 이러한 앙상블의 정확한 표현이 필요하다.전체 원자 분자 동적 시뮬레이션은 이러한 목적을 위해 사용될 수 있지만, 그 사용은 무질서한 단백질을 나타낼 때 현재의 힘장의 정확성에 의해 제한된다.그럼에도 불구하고, 일부 힘장은 무질서 단백질에 대해 이용 가능한 NMR 데이터를 사용하여 힘장 매개변수를 최적화함으로써 무질서 단백질을 연구하기 위해 명시적으로 개발되었다.(예: CHARMM 22*, CHARM 32,[52] 오렌지 ff03* 등)

실험 파라미터(제한-MD)에 의해 억제된 MD 시뮬레이션은 무질서한 단백질을 [53][54][55]특징짓기 위해 사용되었다.MD 시뮬레이션(정확한 Force-field)이 충분히 오래 실행되면 원칙적으로 전체 구성 공간을 샘플링할 수 있습니다.매우 높은 구조적 이질성으로 인해 이 목적을 위해 실행해야 하는 시간 척도는 매우 크고 계산 능력에 의해 제한됩니다.그러나 가속 MD 시뮬레이션,[56] 복제품 교환 시뮬레이션,[57][58] 메타다이나믹스,[59][60] 다원적 MD 시뮬레이션 [61]또는 암묵적이고 명시적인[62][63][64] 용제와 함께 거친 입자의 표현을 사용하는 방법과 같은 다른 계산 기법이 더 작은 시간 척도로 더 넓은 구성 공간을 샘플링하기 위해 사용되었다.

또한 기능 IDP 세그먼트를 [65][66]이해하기 위해 유전자와 각각의 염색체 대역에서 GC 함량의 정량적 분석에 기초한 연구와 같은 다양한 프로토콜과 IDP 분석 방법이 사용되었다.

「 」를 참조해 주세요.

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