유전자 밀도

Gene density

유전학에서 유기체의 게놈의 유전자 밀도는 염기쌍의 수 당 유전자의 수의 비율로 보통 백만 염기쌍, 즉 메가베이스(Mb) 단위로 표기된다.인간의 게놈은 유전자 밀도가 11-15Mb인 반면, 선충의 게놈은 200개로 추정된다.[1]

겉보기에는 박테리아나 아메바와 같은 단순한 유기체는 인간보다 훨씬 높은 유전자 밀도를 가지고 있다.박테리아 DNA는 500-1000개의 유전자/Mb의 순서로 유전자 밀도를 가진다.이것은 박테리아 DNA가 인트론이 없다는 사실을 포함한 몇 가지 요인 때문이다.또한 박테리아 유전자에 있는 코돈은 더 적다.[2]

종

원생동물

종족 유전자의 수 게놈의 기본 쌍(Mb) 유전자 밀도
바베시아 마이크로티 3,685[3] 6.4[4] 575.8
베스노이티아 베스노이니티 8,546[5] 58.8[6] 145.3
크립토스포리디움 파르붐 3,887[7] 9.1[8] 427.1
자르디아장충류 5,388[9] 11.5[10] 468.5
레이슈마니아도노바니 8,123[11] 32.4[12] 250.7
팔치파룸 5,683[13] 23.5[14] 241.8
피토프토라인페스탄스 19,344[15] 203.2[16] 95.2
테트라히메나 열선충류 26,996[17] 130.4[18] 207
테일리아 파르바 4,141[19] 8.3[20] 498.9
도소플라즈마 곤디키 8,925[21] 64.5[22] 138.4
트라이파노소마 크루지 25,183[23] 32.5[24] 774.9

곰팡이

종족 유전자의 수 게놈의 기본 쌍(Mb) 유전자 밀도
아가리쿠스 비스포르스 11,459[25] 30.7[26] 373.3
아스페르길루스 니둘란스 9,586[27] 30.6[28] 313.3
아스페르길루스 니제르 10,828[29] 35.6[30] 304.2
칸디다알비칸스 6,263[31] 14.7[32] 426.1
크립토코쿠스 네오포르만족 7,004[33] 18.6[34] 376.5
데바리오미세스 한세니 6,495[35] 12.1[36] 536.8
뇌이토순쿠니쿨리 2,029[37] 2.3[38] 882.2
고시피이 에레모테키움 5,356[39] 9.1[40] 588.6
후사륨옥시스포럼 21,354[41] 52.4[42] 407.5
클루이버로미스 락티스 5,335[43] 10.6[44] 503.3
테오브로마과 13,054[45] 43.6[46] 299.4
노이로스포라 크라사 10,590[47] 41.3[48] 256.4
사카로마이오스 세레비시아아과 6,445[49] 11.9[50] 541.6
사카로마이오스 역설 5,840[51] 12[52] 486.6
정신분열체 포메 6,974[53] 12.8[54] 544.8
탈라로미세스 마르네페이 10,138[55] 28.3[56] 358.2
트레멜라 중간자충류 8,292[57] 27.9[58] 297.2
트리고데르마하지아눔 14,294[59] 40.7[60] 351.2
트리코피톤 루브럼 8,804[61] 23.1[62] 381.1
우스티라고 메이디스 6,909[63] 19.9[64] 347.2
왈레미아 이크티오파가 5,000[65] 9.5[66] 526.3
야로위아 리폴리티카 7,144[67] 20.3[68] 351.9

식물

종족 통칭 유전자의 수 게놈의 기본 쌍(Mb) 유전자 밀도
아나나스 코모수스 파인애플 25,758 382[69] 67.4
아라비도피스탈리아나 멱살을 잡다 38,311[70] 119[71] 321.9
아스파라거스속 아스파라거스 32,237[72] 1,187[73] 27.2
브라시카 라파 밭머스타드 51,592[74] 333[75] 154.9
대마초 사티바 대마초 31,170[76] 876[77] 35.6
카야누스 카잔 비둘기 완두콩 33,495[78] 593[79] 56.5
캡시쿰 안진공 후추 41,729[80] 2,909[81] 14.3
코페아 아라비카 커피 56,902[82] 1,094[83] 52
글리신 맥스 콩을 59,905[84] 995.7[85] 60.2
주글란스 레기아 잉글리시 호두 37,996[86] 634.7[87] 59.9
니코티아나 타바쿰 담배 74,273[88] 3,734.2[89] 19.9
올레아 유로페아 올리브 47,911[90] 1,316.7[91] 36.4
오리자 사티바 쌀밥 35,223[92] 385[93] 91.5
패닉홀리히 풀 31,528[94] 511.6[95] 61.6
물리침습관 패턴스 퍼지는 흙모스 23,747[96] 472[97] 50.3
프루누스 둘시스 아몬드 26,936[98] 236.9[99] 113.7
프루누스 페르시카 복숭아 26,412[100] 214.2[101] 123.3
푸니카 그라나툼 인과류 29,281[102] 308.4[103] 94.9
로사 치넨시스 로즈. 40,349[104] 513.9[105] 78.5
솔라눔 리코퍼시쿰 토마토 31,263[106] 813[107] 38.5
솔라눔 결핵균 감자를 33,606[108] 760[109] 44.2
테오브로마 카카오 코코아 24,957[110] 335[111] 74.5
제아 메이즈 옥수수를 49,796[112] 2,197[113] 22.7

무척추동물

무척추동물 종
종족 통칭 유전자의 수 게놈의 기본 쌍(Mb) 유전자 밀도
이집트인 황열 모기 19,623[114] 1,274[115] 15.4
아노펠레스 감비아아과 아프리카 말라리아 모기 13,247[116] 250[117] 53
아피스멜리페라 꿀벌 12,374[118] 226[119] 54.8
새너하브디트 엘레강아지 엘레건스 47,632[120] 102[121] 467
다프니아 마그나 물벼룩 21,549[122] 126[123] 171
드로소필라 멜라노가스터 초파리 17,868[124] 137[125] 130.4
하이드라 로코티스 히드라 22,980[126] 1,055[127] 21.8
리물루스 폴리페무스 편자 게 27,318[128] 1,828[129] 14.9
문어 시넨시스 문어 29,784[130] 2,719[131] 11
페디쿨루스 인형 인간의 생쥐. 10,993[132] 110[133] 99.9
강황색반지반죽반지반죽 자주색 성게 33,504[134] 921[135] 36.4

척추동물이 아닌

종족 통칭 유전자의 수 게놈의 기본 쌍(Mb) 유전자 밀도
앨리게이터 미시시피엔시스 아메리카악어 25,279[136] 2,161[137] 11.7
아놀리스 카롤리넨시스 아놀레 도마뱀 22,293[138] 1,799[139] 12.4
아스티야낙스 멕시칸투스 멕시코 테트라 31,695[140] 1,263[141] 25.1
콜럼바 리비아 비둘기적 26,679[142] 1,063[143] 25.1
다니오 레리오 제브라피쉬 47,350[144] 1,408[145] 33.6
갈루스 갈루스 닭의 24,402[146] 1,043[147] 23.4
노토브란치우스 페르세리 청록색의 킬리프. 25,387[148] 1,052[149] 24.1
오리자스 라티프스 일본쌀고기 26,846[150] 746[151] 36
페트로미존 마리너스 바다 등불꽃 22,167[152] 987[153] 22.5
태니오피기아구타타타타 얼룩말 지느러미 21,543[154] 1,069[155] 20.2
타키푸구 루브리페스 일본 복어 27,413[156] 384[157] 71.8
제노푸스열대 열대 발톱 개구리 28,863[158] 1,468[159] 19.7
크세노푸스 레비스 아프리카발톱개구리 37,283[160] 2,718[161] 13.7

척추동물 포유류

종족 통칭 유전자의 수 게놈의 기본 쌍(Mb) 유전자 밀도
주바투스 치타 34,482[162] 2,378[163] 14.5
아일루로포다멜라노레우카 자이언트 판다 32,950[164] 2,371[165] 13.9
아오투스난시마에 밤원숭이 31,331[166] 2,861[167] 11
아르티베우스 자메이켄시스 자메이카 과일 먹는 박쥐 31,480[168] 2,316[169] 13.6
아르비칸이닐로티쿠스 아프리카풀쥐 31,912[170] 2,496[171] 12.8
발라노프테라아쿠토라스트라타 고래를 밍크하다 26,805[172] 2,431[173] 11
발라놉테라 무스쿨루스 흰긴수염고래 27,194[174] 2,105[175] 12.9
들소 들소 아메리카 들소 27,488[176] 2,828[177] 9.7
보스 무투스 야생 야크 26,159[178] 2,703[179] 9.7
보스 황소자리 소 35,061[180] 2,715[181] 12.9
까니스 루푸스 익히니시스 개 36,717[182] 2,370[183] 15.5
친칠라라니게라 긴꼬리 친칠라 30,378[184] 2,390[185] 12.7
펠리스 카투스 고양이를 35,521[186] 2,521[187] 14
고릴라 고릴라 고릴라 35,419[188] 3,063[189] 11.6
호모 사피엔스 인간의 44,507[190] 2,861[191] 15.5
마카카 물라타 레수스원숭이 40,164[192] 2,970[193] 13.5
무스 무스쿨루스 집쥐 42,823[194] 2,689[195] 15.9
판 트로글로다테스 침팬지 40,769[196] 3,050[197] 13.4
라트투스 노르베기우스 갈색쥐 38,371[198] 2,743[199] 14
스스크로파 돼지를 30,345[200] 2,459[201] 12.3

유전자 수는 주어진 종 gtf 주석 파일의 최신 버전의 유전자 플래그 수로 계산된다.잘 연구된 유기체는 아마도 더 높은 유전자 수를 가질 것이라는 것을 명심하라. 왜냐하면 이 생물들은 더 나은 주석을 가지고 있기 때문이다. 따라서 이 숫자는 비교를 위한 추정치들이다.

참고 항목

참조

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