형질전환영역관련단백질

Transformation/transcription domain-associated protein
트래프
식별자
에일리어스TRRAP, PAF350/400, PAF400, STAF40, TR-AP, Tra1, 형질전환/전사 도메인 관련 단백질, DEDDFA, DFNA75
외부 IDOMIM: 603015 MGI: 215322 HomoloGene: 39246 GenCards: TRRAP
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_003496
NM_001244580
NM_001375524

NM_001081362
NM_133901

RefSeq(단백질)

NP_001231509
NP_003487
NP_001362453

없음

장소(UCSC)Chr 7: 98.88 ~99.05 MbChr 5: 144.7 ~144.8 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

TRRAP라고도 알려진 변형/전사 도메인 관련 단백질인간에서 TRRAP [5][6]유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.TRRAP은 포스파티딜이노시톨 3-키나아제 관련 키나아제 단백질군에 속한다.

기능.

TRRAP은 어댑터 단백질로 히스톤 아세틸전달효소 활성(HAT)을 가진 다양한 다단백질 크로마틴 복합체에서 발견되며, 후생유전자 전사 활성화를 담당한다.TRRAP은 MYC(c-Myc) 전사 활성화에 중심적인 역할을 하며 MYC에 의한 세포 변환에도 참여합니다.p53/TP53-, E2F1- 및 E2F4에 의한 문자 변환의 액티브화에 필요합니다.그것은 또한 주요 [7]유전자의 전사를 규제하는 바이러스 온코프로틴아데노바이러스 E1A에 의해 매개되는 전사 활성화에 관여한다.

TRRAP은 또한 유사분열 체크포인트정상적인 세포주기 진행에도 필요하다.MRN 복합체(MRE11, RAD50NBS1)는 DNA Double-Strand Break(DSB; 이중 스트랜드 절단) 검출 및 복구에 관여합니다.TRRAP은 MRN 복합체와 관련되며 TRRAP이 제거되면 복합체는 cDNA 말단 결합 활성을 감소시킨다.따라서 TRRAP은 DSB 복구와 염색질 리모델링 [8][9]사이의 연결고리 역할을 할 수 있다.

모델 유기체

트랩녹아웃쥐표현형

모델 유기체는 TRRAP 기능의 연구에 사용되어 왔다.Trrap이라고tm1a(EUCOMM)Wtsi[15][16] 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인은 International Knockout Mouse Consortium 프로그램의 일부로 생성되었습니다.이것은 관심 있는 과학자들에게 [17][18][19]질병의 동물 모델을 생성하고 배포하는 높은 처리량 돌연변이 유발 프로젝트입니다.

수컷과 암컷은 표준화된 표현형 검사를 통해 [13][20]결실의 효과를 확인했습니다.돌연변이 생쥐에 대해 24개의 검사가 수행되었고 2개의 유의한 이상이 [13]관찰되었다.임신 기간 동안 동종 돌연변이 배아는 확인되지 않았고, 따라서 젖을 때까지 생존한 배아는 없었다.나머지 테스트는 헤테로 접합 돌연변이 성인 생쥐를 대상으로 수행되었으며, 이 [13]동물들에서 유의미한 이상이 관찰되지 않았다.

상호 작용

변환/전사 도메인 관련 단백질은 다음과 상호작용하는 으로 나타났다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000196367 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000045482 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c McMahon SB, Van Buskirk HA, Dugan KA, Copeland TD, Cole MD (August 1998). "The novel ATM-related protein TRRAP is an essential cofactor for the c-Myc and E2F oncoproteins". Cell. 94 (3): 363–74. doi:10.1016/S0092-8674(00)81479-8. PMID 9708738. S2CID 17693834.
  6. ^ Vassilev A, Yamauchi J, Kotani T, Prives C, Avantaggiati ML, Qin J, Nakatani Y (December 1998). "The 400 kDa subunit of the PCAF histone acetylase complex belongs to the ATM superfamily". Mol. Cell. 2 (6): 869–75. doi:10.1016/S1097-2765(00)80301-9. PMID 9885574.
  7. ^ Murr R, Vaissière T, Sawan C, Shukla V, Herceg Z (August 2007). "Orchestration of chromatin-based processes: mind the TRRAP". Oncogene. 26 (37): 5358–72. doi:10.1038/sj.onc.1210605. PMID 17694078.
  8. ^ Robert F, Hardy S, Nagy Z, Baldeyron C, Murr R, Déry U, Masson JY, Papadopoulo D, Herceg Z, Tora L (January 2006). "The Transcriptional Histone Acetyltransferase Cofactor TRRAP Associates with the MRN Repair Complex and Plays a Role in DNA Double-Strand Break Repair". Mol. Cell. Biol. 26 (2): 402–12. doi:10.1128/MCB.26.2.402-412.2006. PMC 1346889. PMID 16382133.
  9. ^ Herceg Z, Wang ZQ (March 2005). "Rendez-vous at mitosis: TRRAPed in the chromatin". Cell Cycle. 4 (3): 383–7. doi:10.4161/cc.4.3.1546. PMID 15711126.
  10. ^ "Haematology data for Trrap". Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. ^ "Salmonella infection data for Trrap". Wellcome Trust Sanger Institute.
  12. ^ "Citrobacter infection data for Trrap". Wellcome Trust Sanger Institute.
  13. ^ a b c d Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  14. ^ Wellcome Trust Sanger Institute의 마우스 리소스 포털.
  15. ^ "International Knockout Mouse Consortium".
  16. ^ "Mouse Genome Informatics".
  17. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  18. ^ Dolgin E (2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  19. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). "A Mouse for All Reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  20. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
  21. ^ a b Park J, Wood MA, Cole MD (March 2002). "BAF53 forms distinct nuclear complexes and functions as a critical c-Myc-interacting nuclear cofactor for oncogenic transformation". Mol. Cell. Biol. 22 (5): 1307–16. doi:10.1128/mcb.22.5.1307-1316.2002. PMC 134713. PMID 11839798.
  22. ^ a b Fuchs M, Gerber J, Drapkin R, Sif S, Ikura T, Ogryzko V, Lane WS, Nakatani Y, Livingston DM (August 2001). "The p400 complex is an essential E1A transformation target". Cell. 106 (3): 297–307. doi:10.1016/s0092-8674(01)00450-0. PMID 11509179. S2CID 15634637.
  23. ^ a b McMahon SB, Wood MA, Cole MD (January 2000). "The essential cofactor TRRAP recruits the histone acetyltransferase hGCN5 to c-Myc". Mol. Cell. Biol. 20 (2): 556–62. doi:10.1128/mcb.20.2.556-562.2000. PMC 85131. PMID 10611234.
  24. ^ a b Liu X, Tesfai J, Evrard YA, Dent SY, Martinez E (May 2003). "c-Myc transformation domain recruits the human STAGA complex and requires TRRAP and GCN5 acetylase activity for transcription activation". J. Biol. Chem. 278 (22): 20405–12. doi:10.1074/jbc.M211795200. PMC 4031917. PMID 12660246.
  25. ^ a b Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (October 2001). "Human STAGA complex is a chromatin-acetylating transcription coactivator that interacts with pre-mRNA splicing and DNA damage-binding factors in vivo". Mol. Cell. Biol. 21 (20): 6782–95. doi:10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001. PMC 99856. PMID 11564863.

추가 정보