대체평충 미토콘드리아 코드

Alternative flatworm mitochondrial code

대체 평충 미토콘드리아 코드(번역표 14)는 플라티헬민테스네마토데스의 미토콘드리아에서 발견되는 유전자 코드다.

코드

AAs = FFLLSSSSYYY*CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNNKSSSSVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = -----------------------------------M----------------------------
Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

베이스: 아데닌(A), 시토신(C), 구아닌(G), 티민(T) 또는 우라실(U)

아미노산:Alanine (Ala, A), Arginine (Arg, R), Asparagine (Asn, N), Aspartic acid (Asp, D), Cysteine (Cys, C), Glutamic acid (Glu, E), Glutamine (Gln, Q), Glycine (Gly, G), Histidine (His, H), Isoleucine (Ile, I), Leucine (Leu, L), Lysine (Lys, K), Methionine (Met, M), Phenylalanine (Phe, F), Proline (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonine (Thr, T), Tryptophan(Trp, W), Tyrosine(Tyr, Y), Valine(Valine)

표준 코드와의 차이

DNA 코돈 RNA 코돈 이 코드(14) 표준코드(1)
AAA AAA Asn (N) Lys (K)
AGA AGA Ser (S) Arg (R)
AGG AGG Ser (S) Arg (R)
TAA UAA Tyr (Y) STOP = Ter (*)
TGA UGA Trp (W) STOP = Ter (*)

체계적 범위 및 의견

코드 14는 STOP이 아닌 UAA를 Tyr로 번역하는 것만으로 코드 9(echinoderm 평충 미토콘드리아 코드)와 다르다.2000년의[1] 한 연구는 편충에서 Tyr에 대한 코돈 UAA 코드가 존재한다는 증거는 찾지 못했지만 다른 의견이 존재한다.코드 14로 번역되는 GenBank 레코드는 매우 드물지만, 테스트 번역은 이러한 레코드를 코드 9로 재번역하면 조기 종료를 야기할 수 있다는 것을 보여준다.더 최근에, UAA는 라도폴루스 시밀리스[2] 라도폴루스 아라보페아에서 타이로신을 코드화하는 것이 발견되었다.[3]

참고 항목

참조

기사는 공공영역에 있는 미국 국립 의학 도서관의 텍스트를 통합하고 있다. [4]

  1. ^ Telford MJ, Herniou EA, Russell RB, Littlewood DT (October 2000). "Changes in mitochondrial genetic codes as phylogenetic characters: two examples from the flatworms". Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 10. 97 (21): 11359–64. Bibcode:2000PNAS...9711359T. doi:10.1073/pnas.97.21.11359. PMC 17205. PMID 11027335.
  2. ^ Joachim EM Jacob; Bartel Vanholme; Thomas Van Leeuwen & Godelieve Gheysen (2009). "A unique genetic code change in the mitochondrial genome of the parasitic nematode Radopholus similis". BMC Res Notes. 2: 192. doi:10.1186/1756-0500-2-192. PMC 2761399. PMID 19778425.
  3. ^ "Taxonomy browser (Radopholus arabocoffeae)".
  4. ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "The Genetic Codes". Taxonomy browser. National Center for Biotechnology Information (NCBI), U.S. National Library of Medicine. Retrieved 1 July 2016.