척추동물 미토콘드리아 코드

Vertebrate mitochondrial code

척추동물 미토콘드리아 코드(번역표 2)는 모든 척추동물의 미토콘드리아에서 발견되는 유전자 코드다.

진화

AGA와 AGG는 척추동물 진화 초기에 미토콘드리아 정지 코돈이 된 것으로 생각되었다.[1]그러나 적어도 인간에게는 AGA와 AG 시퀀스가 종료 코돈으로 인식되지 않는다는 것이 이제 증명되었다.CO1과 ND6 개방형 판독 프레임(ORF)이 종료될 것으로 예측된 AGA와 AGG 코돈에서 -1 미토리보솜 프레임시프트가 발생하며, 결과적으로 두 ORF는 표준 UAG 코돈에서 종료된다.[2]

불완전한 중지 코돈

일부 척추동물(인간 포함)의 미토콘드리아 유전자는 U 또는 UA로 끝나는 불완전한 정지 코돈(codon)을 가지고 있으며, 이는 이후 다면체화 시 완전한 종료 코돈(UAA)이 된다.[3][4][5][6]

번역표

아미노산 생화학적 특성 무극성의 극성의 기본의 산성의 종료: 중지 코돈
표준유전자코드
첫 번째
밑의		 2루 3번째
밑의
U C A G
U UUU (페/F) 페닐알라닌 UCU (Ser/S) 세린 UAU (Tyr/Y) 타이로신 UGU (Cys/C) 사이스틴 U
UUC UCC UAC UGC C
UUA (Leu/L) 루신 UCA UAA 멈추다 UGA (TRP/W) 트립토판 A
UUG UCG UAG 어그 G
C CUU CCU (Pro/P) Proline CAU 히스티딘 CGU (아그/R) 아르기닌 U
CUC CCC CAC CGC C
CUA CCA CAA (Gln/Q) 글루타민 CGA A
CUG CCG CAG CGG G
A AUU (Ile/I) 이솔레우신 ACU (Thr/T) 트레오닌 AAU (Asn/N) 아스파라긴 AGU (Ser/S) 세린 U
AUC ACC AAC AGC C
AUA (Met/M) 메티오닌 ACA 아 (Lys/K) 리신 AGA 멈추다 A
8월[A] ACG AAG AG G
G GUU (Val/V) 발라인 GCU (알라/A) 알라닌 GAU (아스프/D) 아스파르트산 GGU (글리/G) 글리신 U
GUC GCC GAC GGC C
과 GCA GAA (글루/E) 글루탐산 GGA A
GUG GCG 개그 GGG G
A 코돈 AUG는 둘 다 메티오닌을 코드화하고 시작 사이트 역할을 한다: mRNA의 코딩 영역에서 첫 번째 AUG는 단백질로의 변환이 시작되는 곳이다.[7]

표준 코드와의 차이

DNA 코돈 RNA 코돈 이 코드(2) 표준코드(1)
AGA AGA STOP = Ter (*) Arg (R)
AGG AGG STOP = Ter (*) Arg (R)
ATA AUA Met (M) Ile (I)
TGA UGA Trp (W) STOP = Ter (*)

대체 개시 코돈

참고 항목

참조

  • 이 글은 안드르제즈(안제이) 엘자노프스키와 짐 오스텔이 편찬한 NCBI 페이지의 공개 도메인 텍스트를 담고 있다.[9]
  1. ^ S. Osawa, T. Ohama, T. H. Jukes and K. Watanabe (September 1989). "Evolution of the mitochondrial genetic code. I. Origin of AGR serine and stop codons in metazoan mitochondria". J Mol Evol. 29 (3): 202–7. Bibcode:1989JMolE..29..202O. doi:10.1007/bf02100203. PMID 2506356. S2CID 21051869.{{cite journal}}: CS1 maint : 복수이름 : 작성자 목록(링크)
  2. ^ R J Temperley; R Richter; S Dennerlein; R N Lightowlers; Z M Chrzanowska-Lightowlers (January 2010). "Hungry codons promote frameshifting in human mitochondrial ribosomes". Science. 327 (5963): 301. Bibcode:2010Sci...327..301T. doi:10.1126/science.1180674. PMID 20075246. S2CID 206522983.
  3. ^ Temperley, R. J.; Wydro, M; Lightowlers, R. N.; Chrzanowska-Lightowlers, Z. M. (2010). "Human mitochondrial mRNAs--like members of all families, similar but different". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 1797 (6–7): 1081–5. doi:10.1016/j.bbabio.2010.02.036. PMC 3003153. PMID 20211597.
  4. ^ W. R. Hou, Y. Chen, X. Wu, J. C. Hu, Z. S. Peng, J. Yang, Z. X. Tang, C. Q. Zhou, Y. M. Li, S. K. Yang, Y. J. Du, L. L. Kong, Z. L. Ren, H. Y. Zhang and S. S. Shuai (December 2006). "A complete mitochondrial genome sequence of Asian black bear Sichuan subspecies (Ursus thibetanus mupinensis)". Int J Biol Sci. 3 (2): 85–90. doi:10.7150/ijbs.3.85. PMC 1752227. PMID 17205108.{{cite journal}}: CS1 maint : 복수이름 : 작성자 목록(링크)
  5. ^ Oh, D. J.; Kim, J. Y.; Lee, J. A.; Yoon, W. J.; Park, S. Y.; Jung, Y. H. (2007). "Complete mitochondrial genome of the rabbitfish Siganus fuscescens (Perciformes, Siganidae)". DNA Sequence. 18 (4): 295–301. doi:10.1080/10425170701248525. PMID 17541835. S2CID 38458668.
  6. ^ Ki, J. S.; Hwang, D. S.; Park, T. J.; Han, S. H.; Lee, J. S. (2009). "A comparative analysis of the complete mitochondrial genome of the Eurasian otter Lutra lutra (Carnivora; Mustelidae)". Molecular Biology Reports. 37 (4): 1943–55. doi:10.1007/s11033-009-9641-0. PMID 19757186. S2CID 24233602.
  7. ^ Nakamoto T (March 2009). "Evolution and the universality of the mechanism of initiation of protein synthesis". Gene. 432 (1–2): 1–6. doi:10.1016/j.gene.2008.11.001. PMID 19056476.
  8. ^ P. Desjardins & R. Morais (February 1991). "Nucleotide sequence and evolution of coding and noncoding regions of a quail mitochondrial genome". J Mol Evol. 32 (2): 153–161. Bibcode:1991JMolE..32..153D. doi:10.1007/bf02515387. PMID 1706782. S2CID 1974138.
  9. ^ 유전자 코드

외부 링크