식물권

Phyllosphere
주로 잎이 차지하고 있는 식물 공중 표면에는 다양한 미생물이 서식하고 있어 식물권을 형성하고 있다.

식물권미생물의 서식지로 볼 때 식물의 지상 표면 총량을 가리키는 미생물학에서 사용되는 용어다.[1][2] 식물권은 콜로스피어(줄기), 필로플레인(레브), 안토스피어(꽃), 잉어스피어(과일)로 더욱 세분화될 수 있다. 지하 미생물 서식지(즉, 뿌리나 지하 줄기 표면을 둘러싸고 있는 얇은 토양의 부피)를 rhizoperlaimoper라고 한다. 대부분의 식물들은 박테리아, 곰팡이, 고고학, 그리고 원생물을 포함한 미생물의 다양한 공동체를 가지고 있다. 어떤 것들은 식물에 유익하고, 다른 것들은 식물의 병원균의 역할을 하며 숙주식물을 손상시키거나 심지어 죽일 수도 있다.

식물권 마이크로바이옴

잎 표면 또는 식물권은 다양한 박테리아, 고고학, 곰팡이, 조류, 바이러스로 구성된 마이크로바이옴을 포함하고 있다.[3][4] 미생물 결장자는 열, 수분, 방사선의 일야성 및 계절적 변동을 겪는다. 또한 이러한 환경적 요소들은 식물 생리학(광합성, 호흡, 물 흡수 등)에 영향을 미치고 미생물 구성에도 간접적으로 영향을 미친다.[5] 비바람은 또한 식물권 마이크로바이옴에 일시적 변동을 일으킨다.[6]

식물권은 식물의 전체 공중(지상 위) 표면을 포함하며, 이와 같이 줄기의 표면, 꽃과 과일, 특히 잎 표면이 포함된다. 소성권소내권과 비교해 볼 때, 식물권은 영양소가 부족하고 그 환경은 더 역동적이다.

이러한 많은 마이크로바이옴에서 식물과 관련 미생물 사이의 상호작용은 식물 건강, 기능 및 진화에 중추적인 역할을 할 수 있다.[7] 숙주 식물과 식물권 박테리아 사이의 상호작용은 숙주 식물 생리학의 다양한 측면을 촉진할 수 있는 잠재력을 가지고 있다.[8][2][9] 그러나 2020년 현재, 식물권 내 이러한 박테리아 연관성에 대한 지식은 비교적 겸손한 상태를 유지하고 있으며, 식물권 마이크로바이옴 역학에 대한 근본적인 지식을 발전시킬 필요가 있다.[10][11]

잎 표면에서 착생성 박테리아 집단으로 엄격히 정의할 수 있는 식물권 미생물 집단은 주변 환경에 존재하는 미생물 집단(즉, 확률적 결장)과 숙주 식물(, 생물 선택)에 의해 형성될 수 있다.[3][12][11] 그러나 잎 표면은 일반적으로 이산 미생물 서식지로 여겨지지만,[13][14] 식물권 마이크로바이옴 전체에 걸친 공동체 집회의 지배적 동인에 대해서는 의견이 일치되지 않는다. 예를 들어, 숙주별 박테리아 집단은 공동 발생 식물 종의 식물권에 보고되어 숙주 선택의 지배적인 역할을 시사하고 있다.[14][15][16][11]

반대로, 주변 환경의 마이크로바이옴은 또한 식물권 공동체 구성의 주요 결정요인으로 보고되었다.[13][17][18][19] 결과적으로, 식물권 공동체 집단을 추진하는 과정은 잘 이해되지는 않지만 식물 종 전반에 걸쳐 보편화 될 가능성은 낮다. 그러나 기존의 증거는 호스트 특정 연관성을 나타내는 식물권 마이크로바이옴이 주변 환경에서 주로 모집된 것보다 호스트와 상호작용할 가능성이 더 높다는 것을 나타낸다.[8][20][21][22][11]

공간 척도 물질
트리니다드
잎사귀
트리니다드의 면적은 약 5000평방 km(2000평방 mi)이다. 사람의 크기와 비교했을 때, 이것은 박테리아의 크기와 비교했을 때 일반적인 잎과 거의 같은 상대적 영역이다. 트리니다드 어딘가에 사람이 있다고 상상해보라. 움직일 다리가 없고, 볼 눈도 들을 귀도 없이 냄새와 만질 수 있는 능력만을 간직하고 있다. 이것은 개별 박테리아가 잎을 인지하는 방법과 유사하다. 가장 가까운 환경을 넘어서는 어떤 것도 지각할 능력이 없다. 박테리아는 이동을 위해 물이 필요하며 "설탕, 아미노산 또는 휘발성 물질과 같은 신호만 감지하여 점유지로 확산된다"고 한다.미생물 하비타트는 개별 박테리아의 경험과 그것이 어떻게 반응하는지를 결정한다.[23]

전반적으로, 식물권 공동체에는 높은 종의 풍요로움이 남아 있다. 곰팡이 공동체는 온대지방의 식물권에서 변동성이 크고 열대지방에 비해 다양하다.[24] 식물의 잎 표면에는 평방 센티미터 당 최대 107개의 미생물이 존재할 수 있으며, 전지구적 규모의 식물권의 박테리아 개체수는 10개의26 세포로 추정된다.[25] 곰팡이 식물권의 인구 크기는 더 작을 것 같다.[26]

서로 다른 식물의 식물권 미생물은 높은 수준의 세금에서 다소 유사한 것으로 보이지만, 낮은 수준의 세금에서는 상당한 차이가 남아 있다. 이는 미생물이 식물권 환경에서 생존하기 위해 미세 조정된 대사 조정이 필요할 수 있음을 나타낸다.[24] 프로테오박테리아가 지배적인 대장균인 것으로 보이며, 박테로이데테스악티노박테리아도 필로스피어에서 우세하다.[27] 원시권과 토양 미생물군 사이에는 유사성이 있지만, 식물권 집단과 야외 공기에 떠다니는 미생물(에로플랑크톤) 사이에는 유사성이 거의 발견되지 않았다.[28][5]

숙주와 관련된 미생물 집단의 핵심 미생물 탐색은 숙주와 그 미생물 사이에 발생할 수 있는 상호작용을 이해하려고 노력하는 데 있어 유용한 첫 번째 단계다.[29][30] 지배적인 핵심 마이크로바이옴 개념은 생태적 틈새의 경계선을 가로지르는 타조의 지속성이 그것이 점유하는 틈새 내에서 그것의 기능적 중요성을 직접적으로 반영한다는 개념에 기초하여 구축된다. 따라서 그것은 지속적으로 연관되는 기능적으로 중요한 미생물을 식별하기 위한 프레임워크를 제공한다.e 숙주종과 함께.[29][31][32][11]

건강한 아라비도시스 식물의 잎(왼쪽)과 난생물 돌연변이 식물의 잎(오른쪽)[33]

"핵심 마이크로바이옴"에 대한 다양한 정의가 과학 문헌 전반에 걸쳐 생겨났으며, 연구자들은 "핵심세사"를 구별하여 구별되는 숙주 마이크로하비타트 및 심지어 다른 종에 걸쳐 집요하게 구별하였다.[16][20] 로 지속적인 tissue-과 종의 호스트 microbiomes 내에 넓은 지리적 거리를 가로질러, 이 개념적인 framewor의 가장 생물학적으로 그리고 생태학적으로 적절한 응용 프로그램을 나타내는 미생물의 다른 숙주를 가로질러 기능적인 발산[16]과 microhabitats,[36]을 정의하는 핵심 TAXON의 복수 sensu stricto.k.[37][11] 광범위한 지리적 거리로 분리된 호스트 모집단에 걸친 조직 및 종별 고유 코어 마이크로바이옴은 루이엔이 정한 엄격한 정의를 사용하여 식물권에 대해 널리 보고되지 않았다.[2][11]

예: 마누카 식물권

마누카에서 핵심 식물권 세자의 상대적 풍부성
마누카는 꽃 문신이다. 이 차트는 비재배(녹색) 및 희귀(보라색) 데이터 집합에서 핵심 식물권 세금을 식별하는 풍부한 점유 분포를 보여준다. 각 점은 평균 로그 상대적 풍부함과 점유로 표시된 세금을 나타낸다. 점유율이 1인 택사(핑크)(즉, 89개 식물권 샘플 모두에서 검출)는 코어 마이크로바이옴의 구성원으로 간주되었다.[11]

흔히 마누카라고 알려진 꽃다루는 뉴질랜드 토착이다.[38] 마누카 꽃의 과즙에서 생산되는 마누카꿀은 과산화하지 않은 항균성으로 알려져 있다.[39][40] 이러한 비과산화 항균 성질은 주로 성숙한 꿀에서 메틸글리옥살(MGO)로 화학적 변환을 거치는 마누카 꽃의 과즙에 3탄소당 디히드록시아세톤(DHA)이 축적되는 것과 관련이 있다.[41][42][43] 단, 마누카 꽃의 과즙에서 DHA의 농도는 악명높은 것으로 악명이 높으며, 결과적으로 마누카 꿀의 항균 효능은 지역마다, 그리고 연도별로 차이가 있다.[44][45][46] 광범위한 연구 노력에도 불구하고, DHA 생산과 기후,[47] 에다피치 또는 [48]숙주 유전적 요인 사이에 신뢰할 수 있는 상관관계가 확인되지 않았다.[49][11]

{A} 왼쪽의 열 지도는 마누카 식물권과 관련 토양 공동체에서 운영 분류 단위(OTU)의 구성이 어떻게 유의하게 다른지를 보여준다. 노심토 마이크로바이옴은 검출되지 않았다.
(나) 오른쪽의 도표는 식물권과 관련 토양 공동체의 OTU가 상대적 풍요로움에서 어떻게 다른지를 보여준다.[11]

미생물은 마누카 왕족권 및 종족권에서 연구되어 왔다.[50][51][52] 이전의 연구는 주로 곰팡이에 초점을 맞췄으며, 2016년 연구는 지문 기법을 사용하여 지리적으로 환경적으로 구별되는 세 마누카 개체군으로부터 내생식 박테리아 집단을 처음으로 조사했고 조직 고유의 핵심 내포미크로바이옴을 밝혀냈다.[53][11] 2020년 연구는 모든 표본에 걸쳐 지속되는 마누카 식물권에서 서식지에 특유하고 상대적으로 풍부한 코어 마이크로바이옴을 확인했다. 이와는 대조적으로 비핵심 식물권 미생물은 환경적, 공간적 요인에 의해 강하게 추진된 개별 숙주 나무와 모집단에 걸쳐 상당한 변동을 보였다. 그 결과는 마누카의 식물권에 지배적이고 유비쿼터스한 핵심 마이크로바이옴의 존재를 입증했다.[11]

참고 항목

참조

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