닐1

NEIL1
닐1
Protein NEIL1 PDB 1tdh.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭NEI1, FPG1, NEI1, hFPG1, NEi like DNA glycosylase 1
외부 IDOMIM: 608844 MGI: 1920024 HomoloGene: 11616 GeneCard: NEL1
직교체
종인간마우스
엔트레스

79661

72774

앙상블

ENSG00000140398

ENSMUSG00000032298

유니프로트

Q96FI4

Q8K4Q6

RefSeq(mRNA)

NM_001256552
NM_024608
NM_001352519
NM_001352520

NM_028347
NM_001357409

RefSeq(단백질)

NP_001243481
NP_078884
NP_001339448
NP_001339449

NP_082623
NP_001344338

위치(UCSC)Cr 15: 75.35 – 75.36MbCr 9: 57.05 – 57.06Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

엔도누클레스 VIII와 같은 1은 인간에서 NEIL1 유전자에 의해 암호화된 효소다.[5][6]

NEIL1은 박테리아 Fpg/Nei과에 속하는 DNA 글리코실라아제 종류에 속한다.이 글리코실라제는 반응성 산소종(ROS)에 의해 손상된 베이스를 분리하고 관련 라이아제 반응을 통해 DNA 가닥 분리를 도입함으로써 염기 분리 수리의 첫 단계를 시작한다.[6]

대상

NEEL1은 특정 ROS에 손상된 염기들을 인식(대상)하여 제거한 다음 β,Δ 제거를 통해 아바식 부지를 자극하여 3㎛와 5㎛ 인산염 끝을 남긴다.NEEL1은 산화 피리미딘, 포마미도피리미딘, 메틸 그룹에서 산화된 티민 잔류물, 티민 글리콜의 두 가지 스테레오이노머를 모두 인식한다.[7]인간 NEI1을 위한 최고의 기판은 8-oxoG의 추가적인 산화제인 하이드란토인 병변, 구아니디노하이드란토인, 스피로미노디하이드란토로 보인다.NEIL1은 또한 단일 가닥의 DNA뿐만 아니라 거품과 포크 DNA 구조에서도 병변을 제거할 수 있다.NEI1의 표현은 세포 주기마다 다르기 때문에, 그리고 그것은 포크 DNA 구조에 작용하고 PCNA와 FEN-1과 상호작용하기 때문에, NEI1은 복제와 관련된 DNA 복구에 기능할 것을 제안하였다.

암결핍증

NEIL1은 머리와 목의 편평한 세포암(HNSC)에서 가장 빈번하게 과메틸화 된 DNA 수리 유전자 중 하나이다.[8]HNSC 종양의 이상 메틸화에 대해 160개의 인간 DNA 수리 유전자를 평가했을 때, 종양의 62%가 NEI1 촉진자 지역에서 과메틸화 되어 NEI1 메신저 RNA와 NEIL1 단백질이 억제되었다.비소세포폐암(NSCLC) 종양에서 8개의 DNA 수리 유전자를 평가했을 때,[9] NEI1 추진자 지역에서 42%가 과메틸화되었다.이는 검사한 8개의 DNA 수리 유전자 중 가장 빈번하게 발견된 DNA 수리 결핍증이다.NEIL1은 또한 대장암에서 그들의 촉진자 지역에서 과메틸화 된 것으로 밝혀진 6개의 DNA 수리 유전자 중 하나였다.[10]

MGMT와 MLH1과 같은 다른 DNA 수리 유전자는 많은 종류의 암에서 후생적 억제에 대해 종종 평가되지만,[citation needed] NEIL1의 후생적 결핍은 보통 평가되지 않지만, 그러한 암에서도 중요한 것일 수 있다.

DNA 손상이 암의 주요 원인인 것으로 보인다.[11]DNA 수리가 부족하면 DNA 손상이 누적되는 경향이 있다.그러한 과도한 DNA 손상은 오류가 발생하기 쉬운 전이 합성 때문에 DNA 복제 중 돌연변이 오류를 증가시킬 수 있다.과도한 DNA 손상은 또한 DNA 수리 중 오류로 인한 후생유전적 변화를 증가시킬 수 있다.[12][13]그러한 돌연변이와 후생유전적 변화는 암을 유발할 수 있다(악성 신엽 참조).

대장암에서는 DNA 수리 유전자의 세균선 돌연변이가 발병하는 경우가 2~5%에 불과하다.[14]그러나 DNA 수리 유전자의 촉진 부위[10](NEI1 포함)의 메틸화는 결장암과 자주 관련되며 이러한 암의 중요한 인과 요인이 될 수 있다.[citation needed]

메모리 보존

NEIL1은 단기 공간 메모리 보존을 촉진한다.NEIL1이 부족한 생쥐는 물 미로 실험에서 기억력 보유가 손상되었다.[15]

뇌졸중 예방

NEIL1은 또한 허혈성 뇌졸중으로 인한 뇌 기능 장애와 생쥐의 사망으로부터도 보호한다.[15]NEIL1 결핍은 마우스 뇌졸중 모델에서 뇌손상과 기능적으로 결함이 있는 결과를 초래한다.

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000140398 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000032298 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Hazra TK, Izumi T, Boldogh I, Imhoff B, Kow YW, Jaruga P, Dizdaroglu M, Mitra S (Mar 2002). "Identification and characterization of a human DNA glycosylase for repair of modified bases in oxidatively damaged DNA". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (6): 3523–8. doi:10.1073/pnas.062053799. PMC 122556. PMID 11904416.
  6. ^ a b "Entrez Gene: NEIL1 nei endonuclease VIII-like 1 (E. coli)".
  7. ^ Nemec AA, Wallace SS, Sweasy JB (Oct 2010). "Variant base excision repair proteins: contributors to genomic instability". Seminars in Cancer Biology. 20 (5): 320–8. doi:10.1016/j.semcancer.2010.10.010. PMC 3254599. PMID 20955798.
  8. ^ Chaisaingmongkol J, Popanda O, Warta R, Dyckhoff G, Herpel E, Geiselhart L, Claus R, Lasitschka F, Campos B, Oakes CC, Bermejo JL, Herold-Mende C, Plass C, Schmezer P (Dec 2012). "Epigenetic screen of human DNA repair genes identifies aberrant promoter methylation of NEIL1 in head and neck squamous cell carcinoma". Oncogene. 31 (49): 5108–16. doi:10.1038/onc.2011.660. PMID 22286769.
  9. ^ Do H, Wong NC, Murone C, John T, Solomon B, Mitchell PL, Dobrovic A (2014). "A critical re-assessment of DNA repair gene promoter methylation in non-small cell lung carcinoma". Scientific Reports. 4: 4186. Bibcode:2014NatSR...4E4186D. doi:10.1038/srep04186. PMC 3935198. PMID 24569633.
  10. ^ a b Farkas SA, Vymetalkova V, Vodickova L, Vodicka P, Nilsson TK (Apr 2014). "DNA methylation changes in genes frequently mutated in sporadic colorectal cancer and in the DNA repair and Wnt/β-catenin signaling pathway genes". Epigenomics. 6 (2): 179–91. doi:10.2217/epi.14.7. PMID 24811787.
  11. ^ Kastan MB (2008). "DNA damage responses: mechanisms and roles in human disease: 2007 G.H.A. Clowes Memorial Award Lecture". Mol. Cancer Res. 6 (4): 517–24. doi:10.1158/1541-7786.MCR-08-0020. PMID 18403632.
  12. ^ O'Hagan HM, Mohammad HP, Baylin SB (2008). "Double strand breaks can initiate gene silencing and SIRT1-dependent onset of DNA methylation in an exogenous promoter CpG island". PLOS Genetics. 4 (8): e1000155. doi:10.1371/journal.pgen.1000155. PMC 2491723. PMID 18704159.
  13. ^ Cuozzo C, Porcellini A, Angrisano T, Morano A, Lee B, Di Pardo A, Messina S, Iuliano R, Fusco A, Santillo MR, Muller MT, Chiariotti L, Gottesman ME, Avvedimento EV (Jul 2007). "DNA damage, homology-directed repair, and DNA methylation". PLOS Genetics. 3 (7): e110. doi:10.1371/journal.pgen.0030110. PMC 1913100. PMID 17616978.
  14. ^ Jasperson KW, Tuohy TM, Neklason DW, Burt RW (Jun 2010). "Hereditary and familial colon cancer". Gastroenterology. 138 (6): 2044–58. doi:10.1053/j.gastro.2010.01.054. PMC 3057468. PMID 20420945.
  15. ^ a b Canugovi C, Yoon JS, Feldman NH, Croteau DL, Mattson MP, Bohr VA (September 2012). "Endonuclease VIII-like 1 (NEIL1) promotes short-term spatial memory retention and protects from ischemic stroke-induced brain dysfunction and death in mice". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109 (37): 14948–53. Bibcode:2012PNAS..10914948C. doi:10.1073/pnas.1204156109. PMC 3443144. PMID 22927410.

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