날라들2길

NAALADL2
날라들2
식별자
별칭2810043G22RikEG635702Gm1021N-acetrylated 알파연계산디펩타이드제 유사2NAALADL2
외부 ID호몰로진: 45786 진카드: [1]
직교체
종인간마우스
엔트레스

635702

n/a

앙상블

ENSMUSG00000102758

n/a

유니프로트

A0A0N4SUJ3

n/a

RefSeq(mRNA)

NM_001326288

n/a

RefSeq(단백질)

NP_0013217

n/a

위치(UCSC)Cr 3: 23.85 – 25.2Mbn/a
PubMed 검색[1]n/a
위키다타
인간 보기/편집

N-Acetrylated Alpha-Linked Athmic Dipptidase Like 2(NAALADL2)는 단백질로, 인간의 NAALADL2 유전자에 의해 암호화된다.NAALADL2는 전립선암 표식기 PSMA(FOLH1/NAALAD1)를 포함하는 글루탐산염 카르복시펩티아제 II 계열과 25%–26% 시퀀스 아이덴티티티 및 45% 시퀀스 유사성을 공유한다.[2]NAALADL2 유전자는 평균 유전자 크기인 28kb보다 약 49배 큰 1.37Mb에 이르는 거대 유전자다.[2][3]유전자 길이는 유전자의 대본 변종 수와 상관 관계가 있다. 예를 들어, NAALADL2는 광범위한 대체 스플라이싱을 거치며, 앙상블에서 정의한 12개의 스플라이스 변종을 가지고 있다.[4][5]

함수

NAALADL2의 현재 기능은 알려져 있지 않다.NAALADL2는 N-아세틸화 알파연동산성디펩타아제 및 트랜스퍼린 수용체에 대한 유의미한 동질감을 나타낸다.NAALADL2는 M28B 메탈롭티다제 계열과 일부 호몰로학을 공유하면서, 높은 보존성이 있고 메탈롭티다제 기능에 중요한 특정 핵심 위치에 선호 아미노산을 보유하지 않는데, 이는 메탈롭티다제 기능이 촉매적으로 비활성이라는 것을 암시할 수 있다.[2]

임상적 유의성

NAALADL2는 3Q26.3의 코넬리아 드 랭게 관련 번역 중단점에 의해 절단된 것으로 나타났다.[2]

NAALADL2의 rs17531088 SNP는 총 893 KD 사례와 인구 및 가족 통제를 합한 두 개의 독립적인 코호트로 구성된 대규모 GWAS에서 가와사키 질병과 관련이 있는 것으로 나타났다.[6]

암

NAALADL2는 전립선암에 대한 역할을 하는 것으로 밝혀졌다.[7]NAALADL2 단백질 표현은 전립선 종양 단계 및 등급과 연관되어 있으며, 소규모 코호트에서 급진적인 전립선 절제술에 따른 생존 불량 예측 mRNA 발현과 관련이 있다.[7]세포 라인에서 NAALADL2의 과다 압착은 이후 세포외 매트릭스(ECM) 성분으로 결합을 변경하고 전립선암 세포의 침습 능력을 강화했다.[7]NAALADL2 발현이 세포선에서 인위적으로 증가하면서 세포주기, 세포접착, 중피 전이까지의 상피, 세포골격계 리모델링에 관여하는 유전자가 변형되었다.[7]이러한 결과는 NAALADL2가 공격적인 전립선암을 유발하는 작용을 할 수 있음을 시사한다.[7]

12,518명의 전립선암 환자들에 대한 게놈 전체 연관성 연구(GWAS)는 높은 글리슨 합 점수와 관련된 3Q26.31 (NAALADL2) 로커 내에서 SNP; rs78943174를 발견했다.[8]공통 전사 계수 결합 사이트에서 발생하는 SNP에 대한 두 번째 연구는 GATA2 모티브 내에서 SNP; rs10936845를 식별했다.[9]이 SNP는 전립선암 환자의 NAALADL2 발현량을 증가시켰고, 발현량도 증가해 생화학 재발을 예측했다.[9]

전립선암의 경우 NAALADL2 체세포 복제수 증가가 국부성 질환 환자의 약 16%에서 나타나 글리슨 5급 질환의 30%, T 4기 질환의 50%로 증가하며 인접한 종양 TBL1XR1과 함께 발생한다.[10][10]NAALADL2에서 CNA가 증가하는 빈도는 글리슨 등급, 종양 단계, 양의 수술 여유 및 림프절까지 전이된 암을 포함한 다수의 공격적인 전립선암 임상 기록과 연관된다.[10]이 유전적 부위의 복사 번호 증가 빈도는 내성 및 신경내분비 전립선암에서도 증가한다.[10]NAALADL2를 둘러싼 지역은 온코게인(oncogenes)이 풍부하다.[11]NAALADL2의 복사 번호 이득은 BCL6, ATR 및 PI3K 가족 구성원을 포함한 인접한 산인과 종종 공존한다.[10]DNA 수준의 카피 번호 증가는 450개 이상의 알려진 온코겐에서 mRNA 발현 변화와 연관되어 이 지역이 공격적인 전립선암을 일으키는데 중요할 수 있음을 시사한다.[10]

전이성 거세 저항성 전립선암(mCRPC) 연구 결과, 건강한 자원봉사자에 비해 mCRPC 환자에서 NAALADL2(NAALADL2-AS2)의 항진성 가닥이 2배 이상 높은 것으로 나타났다.[12]NAALADL2-AS2 발현이 높은 환자들은 발현이 낮은 환자에 비해 엥잘루타미드에 대한 반응이 개선됐다.[12]

유방암에서 다세포종양영웅ids(MTS)는 차별화된 세포-세포 접합과 정의된 미세환경을 획득하는 3D 세포 배양액으로, 2D 단일 배양액과 비교했을 때 EPCAM, E-cadherin, Integin, syndecans와 같은 다수의 접착 분자를 다르게 표현한다.[13]NAALADL2는 2D 문화와 비교할 때 MTS로 다르게 표현되는 것으로 나타났다.[13]이러한 결과는 세포-세포 상호작용에서 NAALADL2의 역할을 지원하고 NAALADL2가 세포-ECM 상호작용에 영향을 미친다는 전립선암의 증거와 일치한다.[13][7]

NAALADL2의 SNP는 유방암과 폐암에 대한 암 위험 GWAS에서도 확인되었다.[14][15]

파손부위

NAALADL2를 인코딩하는 유전자는 파손되기 쉬운 유전적 위치인 취약한 부위 내에 위치한다는 것이 밝혀졌다.[16][17]암의 경우, NAALADL2 내에 위치한 연약한 부위는 최근 모든 연약한 부위 중 5번째로 많이 변형된 것으로 나타났다.[18]따라서, NAALADL2의 복사 번호 이득과 GATA2, PIK3CB, ATR, SMC4, TBL1XR1, SOX2 및 MUC4와 같은 주변 종양생물의 이득은 이 지역의 파손 및 유전적 보수 시도로 인해 발생할 가능성이 있다고 제안되었다.[19]이 연약한 부위가 파손되면, 포크의 멈춤과 템플릿 전환(FoSTeS)이라고 알려진 과정을 통해, 균열을 둘러싸고 있는 부위의 유전자의 추가 복제본이 복제될 수 있다.[19]NAALADL2의 추가 사본(복사 번호 증가)과 이를 둘러싸고 있는 유전자는 이러한 유전자의 mRNA 발현을 증가시켜 성장과 증식에 관여하는 암 관련 경로의 조절과 활성화를 더욱 어렵게 하는 것으로 나타났다.[10][19]

참조

  1. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  2. ^ a b c d Tonkin ET, Smith M, Eichhorn P, Jones S, Imamwerdi B, Lindsay S, et al. (July 2004). "A giant novel gene undergoing extensive alternative splicing is severed by a Cornelia de Lange-associated translocation breakpoint at 3q26.3". Human Genetics. 115 (2): 139–48. doi:10.1007/s00439-004-1134-6. PMC 4894837. PMID 15168106.
  3. ^ Venter JC, Adams MD, Myers EW, Li PW, Mural RJ, Sutton GG, et al. (February 2001). "The sequence of the human genome". Science. 291 (5507): 1304–51. Bibcode:2001Sci...291.1304V. doi:10.1126/science.1058040. PMID 11181995. S2CID 85981305.
  4. ^ Grishkevich V, Yanai I (September 2014). "Gene length and expression level shape genomic novelties". Genome Research. 24 (9): 1497–503. doi:10.1101/gr.169722.113. PMC 4158763. PMID 25015383.
  5. ^ Cunningham F, Achuthan P, Akanni W, Allen J, Amode MR, Armean IM, et al. (January 2019). "Ensembl 2019". Nucleic Acids Research. 47 (D1): D745–D751. doi:10.1093/nar/gky1113. PMC 6323964. PMID 30407521.
  6. ^ Burgner D, Davila S, Breunis WB, Ng SB, Li Y, Bonnard C, et al. (January 2009). "A genome-wide association study identifies novel and functionally related susceptibility Loci for Kawasaki disease". PLOS Genetics. 5 (1): e1000319. doi:10.1371/journal.pgen.1000319. PMC 2607021. PMID 19132087.
  7. ^ a b c d e f Whitaker HC, Shiong LL, Kay JD, Grönberg H, Warren AY, Seipel A, et al. (November 2014). "N-acetyl-L-aspartyl-L-glutamate peptidase-like 2 is overexpressed in cancer and promotes a pro-migratory and pro-metastatic phenotype". Oncogene. 33 (45): 5274–87. doi:10.1038/onc.2013.464. PMID 24240687. S2CID 40840044.
  8. ^ Berndt SI, Wang Z, Yeager M, Alavanja MC, Albanes D, Amundadottir L, et al. (May 2015). "Two susceptibility loci identified for prostate cancer aggressiveness". Nature Communications. 6: 6889. Bibcode:2015NatCo...6.6889.. doi:10.1038/ncomms7889. PMC 4422072. PMID 25939597.
  9. ^ a b Jin HJ, Jung S, DebRoy AR, Davuluri RV (August 2016). "Identification and validation of regulatory SNPs that modulate transcription factor chromatin binding and gene expression in prostate cancer". Oncotarget. 7 (34): 54616–54626. doi:10.18632/oncotarget.10520. PMC 5338917. PMID 27409348.
  10. ^ a b c d e f g Simpson BS, Camacho N, Luxton HJ, Pye H, Finn R, Heavey S, et al. (August 2020). "Genetic alterations in the 3q26.31-32 locus confer an aggressive prostate cancer phenotype". Communications Biology. 3 (1): 440. doi:10.1038/s42003-020-01175-x. PMC 7429505. PMID 32796921. S2CID 221118233.
  11. ^ Fields AP, Justilien V, Murray NR (January 2016). "The chromosome 3q26 OncCassette: A multigenic driver of human cancer". Advances in Biological Regulation. 60: 47–63. doi:10.1016/j.jbior.2015.10.009. PMC 4729592. PMID 26754874.
  12. ^ a b Benoist GE, van Oort IM, Boerrigter E, Verhaegh GW, van Hooij O, Groen L, et al. (June 2020). "Prognostic Value of Novel Liquid Biomarkers in Patients with Metastatic Castration-Resistant Prostate Cancer Treated with Enzalutamide: A Prospective Observational Study". Clinical Chemistry. 66 (6): 842–851. doi:10.1093/clinchem/hvaa095. PMID 32408351. S2CID 218650088.
  13. ^ a b c Pacheco-Marín R, Melendez-Zajgla J, Castillo-Rojas G, Mandujano-Tinoco E, Garcia-Venzor A, Uribe-Carvajal S, et al. (March 2016). "Transcriptome profile of the early stages of breast cancer tumoral spheroids". Scientific Reports. 6: 23373. Bibcode:2016NatSR...623373P. doi:10.1038/srep23373. PMC 4810430. PMID 27021602.
  14. ^ Murabito JM, Rosenberg CL, Finger D, Kreger BE, Levy D, Splansky GL, et al. (September 2007). "A genome-wide association study of breast and prostate cancer in the NHLBI's Framingham Heart Study". BMC Medical Genetics. 8 Suppl 1: S6. doi:10.1186/1471-2350-8-S1-S6. PMC 1995609. PMID 17903305.
  15. ^ Lan Q, Hsiung CA, Matsuo K, Hong YC, Seow A, Wang Z, et al. (December 2012). "Genome-wide association analysis identifies new lung cancer susceptibility loci in never-smoking women in Asia". Nature Genetics. 44 (12): 1330–5. doi:10.1038/ng.2456. PMC 4169232. PMID 23143601.
  16. ^ Sugio Y, Kuroki Y (May 1989). "Family study of common fragile sites". Human Genetics. 82 (2): 191–3. doi:10.1007/BF00284056. PMID 2722197.
  17. ^ Murano I, Kuwano A, Kajii T (August 1989). "Fibroblast-specific common fragile sites induced by aphidicolin". Human Genetics. 83 (1): 45–8. doi:10.1007/BF00274145. PMID 2504659.
  18. ^ Li Y, Roberts ND, Wala JA, Shapira O, Schumacher SE, Kumar K, et al. (February 2020). "Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes". Nature. 578 (7793): 112–121. doi:10.1038/s41586-019-1913-9. PMC 7025897. PMID 32025012.
  19. ^ a b c Simpson BS, Pye H, Whitaker HC (May 2021). "The oncological relevance of fragile sites in cancer". Communications Biology. 4 (1): 567. doi:10.1038/s42003-021-02020-5. PMC 8115686. PMID 33980983.