크리소크로물리나에키나바이러스

Chrysochromulina ericina virus
크리소크로물리나에키나바이러스01B
Thin sections of a cell from "Haptolina ericina" infected with CeV-01B
CeV-01B에[1] 감염된 합톨리나 에릭나 세포의 얇은 단면
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 바리드나비리아속
왕국: 밤포드비라과
문: 뉴클레오티토빌리코타
클래스: 메가바이러스 세트
주문: 이미테르비랄레스
패밀리: 미미바이러스과(?)
바이러스:
크리소크로물리나에키나바이러스01B

크리소크로물리나에키나바이러스 01B 또는 간단히 크리소크로물리나에키나바이러스(CeV)는 합토피타(Haptophyta)의 해양 미세 조류인[2] 합톨리나에키나(이전에는 크리소크로물리나)에 감염되는 거대 바이러스이다.CeV는 dsDNA [1]바이러스입니다.

역사와 분류법

CeV는 1998년 노르웨이 연안에서 발견되었다.그리고 나서 그것은 격리되고 [1]특징지어졌다.그리고 나서 그것은 다른 모든 알려진 조류 [1][3]감염 바이러스와 함께 피코드나바이러스과에 속하는 것으로 믿어졌다.아칸타모에바 폴리파가 미미바이러스의 발견은 미세조류를 [4]감염시킬 수 있는 해양 미미바이러스가 존재한다는 것을 발견하는데 도움을 주었다.이후 2013년[5] 메인만에서 CeV 변종이 발견됐으며 일부 특정 표지자 계통학적 분석 결과 미니바이러스와의 [3][5]근접성이 확인됐다.2015년에는 CeV를 미미바이러스과로[6] 분류하기 위해 완전 염기서열 분석을 실시했다.

최근에는 CeV를 합토피시스를 감염시키는 Phaeocystis globosa 바이러스(PgV)와 스트라모파일을 [7]감염시키는 Aureoccus anophageferens 바이러스(AaV)와 함께 포함하는 미미바이러스과 감염 미세조류 그룹이 제안되었다.

구조.

CeV의 직경은 160 nm입니다.그것은 20면체 구조를 가지고 있고 외부 [1]막이 없다.

게놈

Mimiviridae과[7] 5명의 유전자 함량

CeV의 게놈은 473,558 bp로 G-C 함량이 25%로 낮다.ORF는 512개가 [6]될 것으로 예상된다.CeV는 주요 캡시드 단백질 및 DNA 중합효소 B와 같은 다수의 핵심 유전자를 PgV 각각의 유전자에 근접하게 가지고 있다.CeV는 MutS7 및 ERCC4형 DNA 복구 핵산가수분해효소(DNA 수복에 관여)의 배열에 의해 제안되는 DNA 수복 능력을 가질 수 있다.이 마지막 효소는 광합성 [7]숙주를 감염시키는 미미바이러스과의 서식지와 일치하는 자외선으로 인한 DNA 손상을 복구하는 데 전형적으로 사용됩니다.또한[7] 공공 데이터베이스에서 일치하는 유전자를 찾지 못한 305개의 고유 유전자를 가지고 있다.

바이러스 순환

CeV의 주기에 대해서는 거의 알려져 있지 않다.그것은 숙주의 세포질에서 복제되고 용해 주기는 14시간에서 19시간 [1]지속된다.CeV는 게놈에 DNA 중합효소 및 2개의 RNA-중합효소 II DNA 의존성을 코드하는 배열을 가지고 있다.그것은 또한 12개의 tRNA를 가지고 있으며, 이는 [7]미미바이러스상에 특징적인 상대적으로 독립적인 복제와 비리온 형성을 가능하게 하는 중요한 기구를 나타낸다.

레퍼런스

  1. ^ a b c d e f Sandaa, Ruth-Anne; Heldal, Mikal; Castberg, Tonje; Thyrhaug, Runar; Bratbak, Gunnar (November 2001). "Isolation and Characterization of Two Viruses with Large Genome Size Infecting Chrysochromulina ericina (Prymnesiophyceae) and Pyramimonas orientalis (Prasinophyceae)". Virology. 290 (2): 272–280. doi:10.1006/viro.2001.1161. PMID 11883191.
  2. ^ Edvardsen, Bente; Eikrem, Wenche; Throndsen, Jahn; Sáez, Alberto G.; Probert, Ian; Medlin, Linda K. (August 2011). "Ribosomal DNA phylogenies and a morphological revision provide the basis for a revised taxonomy of the Prymnesiales (Haptophyta)". European Journal of Phycology. 46 (3): 202–228. doi:10.1080/09670262.2011.594095.
  3. ^ a b Larsen, J. B.; Larsen, A.; Bratbak, G.; Sandaa, R.-A. (21 March 2008). "Phylogenetic Analysis of Members of the Phycodnaviridae Virus Family, Using Amplified Fragments of the Major Capsid Protein Gene". Applied and Environmental Microbiology. 74 (10): 3048–3057. Bibcode:2008ApEnM..74.3048L. doi:10.1128/AEM.02548-07. PMC 2394928. PMID 18359826.
  4. ^ Monier, Adam; Larsen, Jens B.; Sandaa, Ruth-Anne; Bratbak, Gunnar; Claverie, Jean-Michel; Ogata, Hiroyuki (2008). "Marine mimivirus relatives are probably large algal viruses". Virology Journal. 5 (1): 12. doi:10.1186/1743-422X-5-12. PMC 2245910. PMID 18215256.
  5. ^ a b Wilson, William H.; Gilg, Ilana C.; Duarte, Amy; Ogata, Hiroyuki (October 2014). "Development of DNA mismatch repair gene, MutS, as a diagnostic marker for detection and phylogenetic analysis of algal Megaviruses". Virology. 466–467: 123–128. doi:10.1016/j.virol.2014.07.001. PMID 25063474.
  6. ^ a b Gallot-Lavallée, Lucie; Pagarete, António; Legendre, Matthieu; Santini, Sebastien; Sandaa, Ruth-Anne; Himmelbauer, Heinz; Ogata, Hiroyuki; Bratbak, Gunnar; Claverie, Jean-Michel (3 December 2015). "The 474-Kilobase-Pair Complete Genome Sequence of CeV-01B, a Virus Infecting Haptolina (Chrysochromulina) ericina (Prymnesiophyceae)". Genome Announcements. 3 (6). doi:10.1128/genomeA.01413-15. PMC 4669402. PMID 26634761.
  7. ^ a b c d e Gallot-Lavallée, Lucie; Blanc, Guillaume; Claverie, Jean-Michel; McFadden, Grant (15 July 2017). "Comparative Genomics of Chrysochromulina ericina virus and Other Microalga-Infecting Large DNA Viruses Highlights Their Intricate Evolutionary Relationship with the Established Mimiviridae Family". Journal of Virology. 91 (14). doi:10.1128/JVI.00230-17. PMC 5487555. PMID 28446675.