켐스파이더

ChemSpider
켐스파이더
내용
묘사1억개 이상의 화학적 구조, 특성 및 관련 정보
연락
연구소케임브리지, 영국
실험실.
접근
웹사이트www.chemspider.com
여러가지 종류의
면허증.크리에이티브 커먼즈 귀속 셰어라이크[2]

ChemSpiderRoyal Society of [3][4][5][6][7]Chemistry가 소유한 화학물질에 대한 온라인 데이터베이스입니다.여기에는 270개 이상의 데이터 소스에서 1억 개 이상의 분자에 대한 정보가 포함되어 있으며, 각 분자는 ChemSpider Identifier라는 고유 식별자를 받습니다.

원천

데이터베이스 소스는 다음과 같습니다.[8]

프로페셔널 데이터베이스

크라우드소싱

ChemSpider 데이터베이스는 화학 구조 증착, 스펙트럼 증착 및 사용자 큐레이션을 포함한 사용자 기여로 업데이트될 수 있습니다.이것은 온라인 화학 데이터베이스를 개발하기 위한 크라우드소싱 방식입니다.데이터의 크라우드소싱 기반 큐레이션은 생물 의학 및 화학 [10]문헌의 텍스트 마이닝 응용에 사용된 화학 구조와 관련된 화학 이름 사전을 생성했습니다.

그러나 데이터베이스 권한이 포기되지 않으며 데이터 덤프를 사용할 수 없습니다. 실제로 FAQ에는 제한된 다운로드만 [11]허용된다고 명시되어 있으므로 포크 권한이 보장되지 않으며 프로젝트가 무료/개방된 것으로 간주될 수 없습니다.

특징들

검색중

사용 가능한 여러 검색 모듈이 제공됩니다.

  • 표준 검색을 통해 체계적인 이름, 상호, 동의어 및 레지스트리 번호를 조회할 수 있습니다.
  • 고급 검색은 화학식과 분자량 범위, CAS 번호, 공급업체 등을 이용하여 화학 구조, 화학 하부 구조별로 상호작용 검색이 가능합니다.검색을 사용하여 이미 찾은 결과를 확대하거나 제한할 수 있습니다.
  • 모바일 기기에서 구조 검색은 iOS(아이폰/아이팟/아이패드)[12] 및 Android(운영체제)[13]용 무료 앱을 사용하여 할 수 있습니다.

화학문서 마크업

ChemSpider 데이터베이스는 텍스트 마이닝과 함께 화학 문서 마크업의 기초로 사용되어 왔습니다.ChemMantis,[14] Chemistry Markup and Nomenclature Transformation Integrated System은 알고리즘을 사용하여 문서와 웹 페이지에서 화학적 이름을 식별하고 추출하며 ChemSpider 데이터베이스에서 이름 대 구조 변환 알고리즘과 사전 검색을 사용하여 화학적 이름을 화학적 구조로 변환합니다.결과적으로 화학 문서와 ChemSpider를 통한 정보 검색 간의 통합 시스템이 150개 이상의 데이터 소스로 통합되었습니다.

합성 페이지

Synthetic Pages는 왕립 화학 협회에서 운영하는 [15]합성 화학 절차에 대한 무료 대화형 데이터베이스입니다.사용자는 사이트에 게시하기 위해 자신이 직접 수행한 합성 절차를 제출합니다.이러한 절차는 독창적인 작업일 수도 있지만 문헌 반응을 기반으로 하는 경우가 더 많습니다.해당하는 경우 원래 공개된 절차에 대한 인용이 이루어집니다.게시하기 전에 과학 편집자의 확인을 받습니다.그 페이지들은 과학 저널 기사처럼 공식적인 동료 평가를 받지 않지만, 로그인한 사용자들은 의견을 낼 수 있습니다.그 논평들은 또한 과학적인 편집자들에 의해 조정됩니다.실험실에서 유용한 화학적 합성을 수행하는 방법에 대한 실제 경험을 수집하고자 합니다.일반적인 학술지에 게재된 실험 방법은 형식적이고 간결하게 나열되어 있지만, ChemSpider Synthetic Pages의 절차는 더 실용적인 세부 사항과 함께 제공됩니다.격식을 차리지 않는 것이 좋습니다.제출자의 의견도 포함되어 있습니다.이와 유사한 양의 세부 사항을 가진 다른 출판물로는 유기 합성물과 무기 합성물이 있습니다.Synthetic Pages 사이트는 원래 Kevin Booker-Milburn 교수 (University of Bristol), Stephen Caddick 교수 (University College London), Peter Scott (University of Warwick), Max Hammond 교수에 의해 설립되었습니다.2010년 2월, 영국 왕립 화학 협회의 화학 구조 검색 엔진 켐스파이더와 합병이 발표되었으며[16], CSSP(ChemSpider Synthetic Pages)가 설립되었습니다.

기타서비스

많은 서비스를 온라인으로 이용할 수 있습니다.여기에는 화학적 이름의 화학적 구조로의 변환, SMILES 및 InChI 문자열 생성뿐만 아니라 많은 물리화학적 매개 변수의 예측 및 NMR 예측을 가능하게 하는 웹 서비스로의 통합이 포함됩니다.

역사

켐스파이더는 2009년 [17]5월 왕립화학회(RSC)에 인수되었습니다.RSC에 의해 인수되기 전, 켐스파이더는 개인 법인인 켐주 주식회사에 의해 지배되었습니다.이 시스템은 2007년 3월 베타 릴리스 형태로 처음 출시되었으며 2008년 3월 출시로 전환되었습니다.

오픈팩트

ChemSpider는 Innovative Medicine Initiative인 Open PACTS 프로젝트의 일환으로 화학 화합물 저장소 역할을 했습니다.오픈 PACTS는 소분자 약물 발견의 병목 현상 - 상이한 정보원, 표준 부족 및 정보 과부하 - [18]을 해결하기 위한 오픈 액세스 시맨틱 웹 접근 방식으로 표준을 개방하도록 개발되었습니다.

참고 항목

참고문헌

  1. ^ Van Noorden, R. (2012). "Chemistry's web of data expands". Nature. 483 (7391): 524. Bibcode:2012Natur.483..524V. doi:10.1038/483524a. PMID 22460877.
  2. ^ "ChemSpider Blog » Blog Archive » ChemSpider Adopts Creative Commons Licenses". www.chemspider.com. Archived from the original on 2015-04-02. Retrieved 2014-03-21.
  3. ^ Antony John Williams (Jan–Feb 2008). "ChemSpider and Its Expanding Web: Building a Structure-Centric Community for Chemists". Chemistry International. 30 (1).
  4. ^ Williams, A. J. (2008). "Public chemical compound databases". Current Opinion in Drug Discovery & Development. 11 (3): 393–404. PMID 18428094.
  5. ^ Brumfiel, G. (2008). "Chemists spin a web of data". Nature. 453 (7192): 139. Bibcode:2008Natur.453..139B. doi:10.1038/453139a. PMID 18464701.
  6. ^ Williams, A. J. (2011). "Chemspider: A Platform for Crowdsourced Collaboration to Curate Data Derived from Public Compound Databases". Collaborative Computational Technologies for Biomedical Research. pp. 363–386. doi:10.1002/9781118026038.ch22. ISBN 9781118026038.
  7. ^ Pence, H. E.; Williams, A. (2010). "ChemSpider: An Online Chemical Information Resource". Journal of Chemical Education. 87 (11): 1123. Bibcode:2010JChEd..87.1123P. doi:10.1021/ed100697w.
  8. ^ "Data Sources". Chemspider. Retrieved May 16, 2019.
  9. ^ "ChemSpider Blog » Blog Archive » The US EPA DSSTox Browser Connects to ChemSpider". ChemSpider. August 23, 2008. Archived from the original on 7 November 2017. Retrieved 7 November 2017.
  10. ^ Hettne, K. M.; Williams, A. J.; Van Mulligen, E. M.; Kleinjans, J.; Tkachenko, V.; Kors, J. A. (2010). "Automatic vs. Manual curation of a multi-source chemical dictionary: The impact on text mining". Journal of Cheminformatics. 2 (1): 3. doi:10.1186/1758-2946-2-3. PMC 2848622. PMID 20331846.
  11. ^ "ChemSpider Blog » Blog Archive » Who Would Like to Have the Entire ChemSpider Database?". www.chemspider.com. Archived from the original on 2015-09-24. Retrieved 2014-04-18.
  12. ^ "ChemSpider on the App Store". App Store.
  13. ^ "ChemSpider Mobile - Android Apps on Google Play". play.google.com.
  14. ^ ChemMantis가 ChemZoo에 온 것을 환영하고 지역사회의 기여를 요청합니다, 2008-10-23, A. Williams, 블로그 포스트 Wayback Machine에서 2015-09-24 아카이브
  15. ^ "ChemSpider SyntheticPages". Royal Society of Chemistry. Retrieved 26 June 2012.
  16. ^ "ChemSpider and SyntheticPages support synthetic chemistry". RSC Publishing. Royal Society of Chemistry. 2010-02-05. Archived from the original on 26 July 2012. Retrieved 2012-06-26.
  17. ^ "RSC acquires ChemSpider". Royal Society of Chemistry. 11 May 2009. Retrieved 2009-05-11.
  18. ^ Williams, A. J.; Harland, L.; Groth, P.; Pettifer, S.; Chichester, C.; Willighagen, E. L.; Evelo, C. T.; Blomberg, N.; Ecker, G.; Goble, C.; Mons, B. (2012). "Open PHACTS: Semantic interoperability for drug discovery". Drug Discovery Today. 17 (21–22): 1188–1198. doi:10.1016/j.drudis.2012.05.016. PMID 22683805.