LIPID 맵

LIPID MAPS
LIPID 맵
내용
설명지질학
연락처
1차 인용PMID 17584797
출시일자2003
접근
웹사이트www.lipidmaps.org

LIPID MAPS(Lipid DDCARTS and Patheters Strategy)는 Lipidomics 자원의 관문이 되도록 설계된 웹 포털이다.이 자원은 생물학적 지질의 분류에 앞장섰고, 그것들을 8가지 일반 범주로 나누었다.[1]LIPID MAPS는 예를 들어 지질의 질량 분광 분석을 위한 표준화된 방법론을 제공한다.

LIPID MAPS는 지질대사의[5] 연구와 지질학 분야의 급속한 발전과 표준화에 대한 감상이 증가하고 있다는 증거로 언급되어 왔다.

주요 LIPID MAPS 리소스는 다음과 같다.

  • LIPID MAPS Structure Database(LMSD) - 46,000개 이상의 서로 다른 지질을 포함하는 생물학적으로 관련된 지질의 구조와 주석을 데이터베이스로 한다.[8]PubMed에 따르면 이 자원을 설명하는 논문은 200번 이상 인용되었다.
  • LMISD(LIPID MAPS In-Silico Structure Database) - 일반적으로 발생하는 지질 클래스의 그룹 확장에 의해 생성된 계산적으로 예측된 지질 데이터 베이스
  • LIPID MAPS Gene/단백질 데이터베이스(LMPD) - 지질대사에[9] 관여하는 유전자와 유전자 생산물의 데이터베이스

과학자들은 LIPID MAPS에서 이용할 수 있는 도구를 사용하여 생물학적 검체에서 지질 분석을 위한 일반적인 방법인 질량 분광 분석 데이터에서 표본에 있는 지질을 식별할 수 있다.특히 LipidFinder는 MS 데이터 분석이 가능하다.지질에 관한 튜토리얼과 교육 자료도 현장에서 구할 수 있다.[11]

2020년 1월, LIPID MAPS는 ELIX가 되었다.IR 서비스.[12]

역사

LIPID MAPS는 NIH 기금으로 2003년에 설립되었다.2016년부터 발레리 오도넬 교수가 이끄는 카디프대와 마이클 와켈람 산하의 바브라함연구소, 웰컴 트러스트(Wellcome Trust)가 후원하는 UCSD 과학자 샨카 수브라마니암과 에드 데니스(Ed Dennis)의 공동 프로젝트였다.Wakelam의 부고문은 LIPID MAPS를 지질학 분야를 통일하는 것으로 묘사하고 있다.[13]

LIPID MAPS는 아반티 폴라 지질과 케이맨 화학이 후원한다.

참조

  1. ^ Fahy E, Subramaniam S, Murphy RC, Nishijima M, Raetz CR, Shimizu T, Spener F, van Meer G, Wakelam MJ, Dennis EA (April 2009). "Update of the LIPID MAPS comprehensive classification system for lipids". Journal of Lipid Research. 50 Suppl (S1): S9-14. doi:10.1194/jlr.R800095-JLR200. PMC 2674711. PMID 19098281.
  2. ^ Valeria Pereira Serafim P, Figueiredo JR, de Adiel G, Vitor Felipe A, Guimaraes Lo Turco E, Silva, Manoukian Forones N (2019). "STUDY OF LIPID BIOMARKERS OF PATIENTS WITH POLYPS AND COLORECTAL CÂNCER". Arquivos de Gastroenterologia. 56 (4): 399–404. doi:10.1590/S0004-2803.201900000-80. PMID 31800736.
  3. ^ Zheng H, Yang R, Wang Z, Wang J, Zhang J, Sun H (2020). "Characterization of pharmaceutic structured triacylglycerols by high‐performance liquid chromatography/tandem high‐resolution mass spectrometry and its application to structured fat emulsion injection". Rapid Communications in Mass Spectrometry. 34 (1): e8557. doi:10.1002/rcm.8557. PMID 31429125.
  4. ^ Sasaki H, White SH (2008). "Aggregation Behavior of an Ultra-Pure Lipopolysaccharide that Stimulates TLR-4 Receptors". Biophysical Journal. 95 (2): 986–993. Bibcode:2008BpJ....95..986S. doi:10.1529/biophysj.108.129197. PMC 2440428. PMID 18375521.
  5. ^ Muralikrishna Adibhatla R, Hatcher JF (2007). "Role of lipids in brain injury and diseases". Future Lipidology. 2 (4): 403–422. doi:10.2217/17460875.2.4.403. PMC 2174836. PMID 18176634.
  6. ^ "Phat on potential, lipidomics is gaining weight". Eureka Alert. 10 January 2019. Retrieved 10 June 2020.
  7. ^ "Lipidomics – A Niche but Rapidly Growing Field". Technology Networks. 11 September 2019. Retrieved 10 June 2020.
  8. ^ Sud M, Fahy E, Cotter D, et al. (January 2007). "LMSD: LIPID MAPS structure database". Nucleic Acids Res. 35 (Database issue): D527–32. doi:10.1093/nar/gkl838. PMC 1669719. PMID 17098933.
  9. ^ Cotter D, Maer A, Guda C, Saunders B, Subramaniam S (January 2006). "LMPD: LIPID MAPS proteome database". Nucleic Acids Res. 34 (90001): D507–10. doi:10.1093/nar/gkj122. PMC 1347484. PMID 16381922.
  10. ^ Fahy E, Alvarez-Jarreta J, Brasher CJ, Nguyen A, Hawksworth JI, Rodrigues P, Meckelmann S, Allen SM, O'Donnell VB (2019). "LipidFinder on LIPID MAPS: peak filtering, MS searching and statistical analysis for lipidomics". Bioinformatics. 35 (4): 685–687. doi:10.1093/bioinformatics/bty679. PMC 6378932. PMID 30101336.
  11. ^ Sud M, Fahy E, Cotter D, Dennis EA, Subramaniam S (December 2011). "LIPID MAPS-Nature Lipidomics Gateway: An Online Resource for Students and Educators Interested in Lipids". Journal of Chemical Education. 89 (2): 291–292. doi:10.1021/ed200088u. PMC 3995124. PMID 24764601.
  12. ^ "Service list". elixir-europe.org. Retrieved 10 June 2020.
  13. ^ Ferry, Georgina (24 April 2020). "Michael Wakelam obituary". The Guardian. Manchester. Retrieved 10 June 2020.