체비

ChEBI
생물학적 이익의 화학적 실체(ChEBI)
ChEBI logo.png
내용
묘사화학 데이터베이스
데이터형
발동.		소량 화합물
연락
연구소유럽 분자 생물학 연구소 European Union
실험실.유럽생물정보학연구소 United Kingdom
주요 인용문마토스[1] 외
접근
웹 사이트www.ebi.ac.uk/chebi
다운로드 URLftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi
웹 서비스 URLwww.ebi.ac.uk/chebi/webServices.do
Sparql 엔드포인트바이오2RDF
도구들
웹www.ebi.ac.uk/chebi
여러가지 종류의
데이터 릴리즈
빈도수.		매월의
큐레이션 정책수동 큐레이션

ChEBI라고도 하는 Chemical Entities of Biological informatics Institute(EBI)[1][2]의 개방형 바이오메디컬 온톨로지(OBO) 노력의 일부인 '작은' 화학 화합물에 초점을 맞춘 분자 실체의 화학적 데이터베이스 및 온톨로지이다."분자 실체"라는 용어는 "구성상 또는 동위원소적으로 구별되는 원자, 분자, 이온, 이온 쌍, 라디칼, 라디칼 이온, 복합체, 컨포머 등"을 의미한다.[3]문제의 분자 실체는 잠재적인 생물 활성을 가진 자연 산물 또는 합성 산물이다.단백질 분해 분해에 의해 단백질로부터 유도되는 핵산, 단백질 및 펩타이드와 같이 게놈에 의해 직접 코드된 분자는 ChEBI에 포함되지 않는다.

ChEBI는 국제순수응용화학연합(IUPAC)과 국제생화학분자생물연합(NC-IUMB)의 명명위원회가 승인한 명명법, 상징성 및 용어를 사용합니다.

범위와 액세스

데이터베이스의 모든 데이터는 비독점적이거나 비독점 소스에서 파생됩니다.따라서 누구나 자유롭게 접근할 수 있고 이용할 수 있습니다.또한 각 데이터 항목은 완전히 추적 가능하며 원래 소스를 명시적으로 참조할 수 있습니다.ChEMBL, ChemSpider, DrugBank, MetaboLights 및 PubChem과 같은 다른 데이터베이스와 관련이 있다.

ChEBI 데이터는 퍼블릭 웹 애플리케이션, 웹 서비스, SPARQL 엔드포인트 및 다운로드를 [1][2]통해 이용할 수 있습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c de Matos P, Alcántara R, Dekker A, Ennis M, Hastings J, Haug K, Spiteri I, Turner S, Steinbeck C (2010). "Chemical Entities of Biological Interest: an update". Nucleic Acids Research. 38 (Database issue): D249-54. doi:10.1093/nar/gkp886. PMC 2808869. PMID 19854951.
  2. ^ a b Degtyarenko K, de Matos P, Ennis M, Hastings J, Zbinden M, McNaught A, Alcántara R, Darsow M, Guedj M, Ashburner M (2008). "ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest". Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D344-50. doi:10.1093/nar/gkm791. PMC 2238832. PMID 17932057.
  3. ^ IUPAC, 화학 용어집, 제2판('골드북') (1997).온라인 수정 버전: (2006–) "분자 실체"doi: 10.1351/goldbook.M03986
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