RAD18

RAD18
RAD18
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭RAD18, RNF73, E3 유비퀴틴 단백질 리가아제, RAD18 E3 유비퀴틴 단백질 리가아제
외부 IDOMIM: 605256 MGI: 1890476 호몰로Gene: 48572 GeneCard: RAD18
직교체
종인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_020165

NM_001167730
NM_021385
NM_001381931
NM_001381932
NM_001381933

RefSeq(단백질)

NP_064550

NP_001161202
NP_067360
NP_001368860
NP_001368861
NP_001368862

위치(UCSC)Chr 3: 8.78 – 8.96MbChr 6: 112.6 – 112.67Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

E3 ubiquitin-단백질 RAD18은 인간에게 RAD18 유전자에 의해 암호화된 효소다.[5][6][7]

함수

이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 S. 세레비시아 DNA 손상 수리 단백질 Rad18과 매우 유사하다.효모 Rad18은 손상된 DNA의 복제 후 복구에 필요한 유비퀴틴 콘주깅 효소인 Rad6와의 상호작용을 통해 기능한다.이 단백질은 효모와 유사하게 보존된 약지 모티브를 통해 효모 Rad6 단백질의 인간 호몰로로그와 상호작용할 수 있다.이 모티브의 돌연변이는 UV에 손상된 DNA의 불완전한 복제와 다수의 돌연변이에 대한 과민성을 초래한다.[7]

동물 모델

모델 유기체는 RAD18 기능 연구에 사용되어 왔다.Rad18이라고tm1a(EUCOMM)Wtsi 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인은 [8]웰컴 트러스트 생거 연구소(Wellcome Trust Sanger Institute)에서 관심 있는 과학자들에게 질병의 동물 모델을 생성하고 배포하기 위한 고처리 돌연변이 유발 프로젝트의 일환으로 생성되었다.[9][10][11][12][13]래드18이 부족한 생쥐는 생존력이나 생식력에 큰 결함이 없어 수컷과 암컷이 표준화된 표현식 화면을 통해 삭제 효과를 파악했다.[14][15][10][16][17]

Rad18 녹아웃 마우스 표현형

25개의 테스트가 수행되었고 4개의 유의한 표현형식이 보고되었다.[17]

인간 대장암 세포 라인의 녹아웃인 HCT116도 만들어졌다.[25]

상호작용

RAD18은 HLTF,[26] UBE2B[5][6], UBE2A와 상호작용하는 것으로 나타났다.[5][6]

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG000070950 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000030254 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c Tateishi S, Sakuraba Y, Masuyama S, Inoue H, Yamaizumi M (July 2000). "Dysfunction of human Rad18 results in defective postreplication repair and hypersensitivity to multiple mutagens". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (14): 7927–32. Bibcode:2000PNAS...97.7927T. doi:10.1073/pnas.97.14.7927. PMC 16647. PMID 10884424.
  6. ^ a b c Xin H, Lin W, Sumanasekera W, Zhang Y, Wu X, Wang Z (July 2000). "The human RAD18 gene product interacts with HHR6A and HHR6B". Nucleic Acids Research. 28 (14): 2847–54. doi:10.1093/nar/28.14.2847. PMC 102657. PMID 10908344.
  7. ^ a b "Entrez Gene: RAD18 RAD18 homolog (S. cerevisiae)".
  8. ^ EUCOMM. "Rad18tm1a(EUCOMM)Wtsi". www.knockoutmouse.org.
  9. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (June 2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  10. ^ a b van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (June 2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biology. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
  11. ^ Dolgin E (June 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  12. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (January 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  13. ^ Auwerx J, Avner P, Baldock R, Ballabio A, Balling R, Barbacid M, Berns A, Bradley A, Brown S, Carmeliet P, Chambon P, Cox R, Davidson D, Davies K, Duboule D, Forejt J, Granucci F, Hastie N, de Angelis MH, Jackson I, Kioussis D, Kollias G, Lathrop M, Lendahl U, Malumbres M, von Melchner H, Müller W, Partanen J, Ricciardi-Castagnoli P, Rigby P, Rosen B, Rosenthal N, Skarnes B, Stewart AF, Thornton J, Tocchini-Valentini G, Wagner E, Wahli W, Wurst W (September 2004). "The European dimension for the mouse genome mutagenesis program". Nature Genetics. 36 (9): 925–7. doi:10.1038/ng0904-925. PMC 2716028. PMID 15340424.
  14. ^ Wellcome Trust Sanger Institute. "Viability at Weaning Data for Rad18". Mouse Resources Portal. www.sanger.ac.uk.
  15. ^ Wellcome Trust Sanger Institute. "Fertility Data for Rad18". Mouse Resources Portal. www.sanger.ac.uk.
  16. ^ a b Gerdin, AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  17. ^ a b Wellcome Trust Sanger Institute. "MGP Phenotyping of Rad18tm1a(EUCOMM)Wtsi". Mouse Resources Portal. www.sanger.ac.uk.
  18. ^ "Body weight data for Rad18". Wellcome Trust Sanger Institute.
  19. ^ "Dysmorphology data for Rad18". Wellcome Trust Sanger Institute.
  20. ^ "Indirect calorimetry data for Rad18". Wellcome Trust Sanger Institute.
  21. ^ "DEXA data for Rad18". Wellcome Trust Sanger Institute.
  22. ^ "Salmonella infection data for Rad18". Wellcome Trust Sanger Institute.
  23. ^ "Citrobacter infection data for Rad18". Wellcome Trust Sanger Institute.
  24. ^ 마우스 리소스 포털, 웰컴 트러스트 생어 연구소.
  25. ^ Shiomi N, Mori M, Tsuji H, Imai T, Inoue H, Tateishi S, Yamaizumi M, Shiomi T (2007-01-01). "Human RAD18 is involved in S phase-specific single-strand break repair without PCNA monoubiquitination". Nucleic Acids Research. 35 (2): e9. doi:10.1093/nar/gkl979. PMC 1802632. PMID 17158148.
  26. ^ Unk I, Hajdú I, Fátyol K, Hurwitz J, Yoon JH, Prakash L, Prakash S, Haracska L (March 2008). "Human HLTF functions as a ubiquitin ligase for proliferating cell nuclear antigen polyubiquitination". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105 (10): 3768–73. Bibcode:2008PNAS..105.3768U. doi:10.1073/pnas.0800563105. PMC 2268824. PMID 18316726.

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