SNX5

SNX5
SNX5
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스SNX5, 정렬 nexin 5
외부 IDOMIM : 605937 MGI : 1916428 HomoloGene : 40944 GenCard : SNX5
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_152227
NM_001282454
NM_014426

NM_001199188
NM_024225

RefSeq(단백질)

NP_001269383
NP_055241
NP_689413

NP_001186117
NP_077187

장소(UCSC)Chr 20: 17.94 ~17.97 MbChr 2: 144.09 ~144.11 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

넥신-5를 선별하는 것은 인간[5][6][7]SNX5 유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.

이 유전자는 분류 넥신 계열의 일원을 암호화한다.이 패밀리의 구성원은 포스포이노시티드 결합 도메인인 Phox(PX) 도메인을 포함하고 세포 내 밀매에 관여한다.이 단백질은 포유류의 레트로머 [6]복합체의 구성 요소이며, 는 골기 횡단 네트워크로 화물 검색을 용이하게 합니다.그것은 또한 판코니 빈혈, 보완 그룹 A 단백질과 결합하는 것으로 나타났다.이 유전자는 동일한 단백질을 [7]코드하는 두 가지 전사 변형을 일으킨다.

모델 유기체

Snx5 녹아웃 마우스 표현형

모델 유기체는 SNX5 기능의 연구에 사용되어 왔다.Internationaltm1a(KOMP)Wtsi[13][14] Knockout Mouse Consortium 프로그램의 일환으로 Snx5라고 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인이 생성되었습니다.이것은 관심 있는 과학자들에게 질병의 동물 모델을 생성하고 배포하기 위한 높은 처리량 돌연변이 유발 프로젝트입니다.[15][16][17]수컷과 암컷은 표준화된 표현형 검사를 통해 [11][18]결실의 효과를 확인했습니다.호모 접합 돌연변이 성인 생쥐를 대상으로 25건의 검사가 수행되었지만 유의미한 이상은 [11]관찰되지 않았다.

상호 작용

SNX5는 FANCA[5]대화하는 으로 나타났습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000089006 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000027423 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Otsuki T; Kajigaya S; Ozawa K; Liu JM (Jan 2000). "SNX5, a new member of the sorting nexin family, binds to the Fanconi anemia complementation group A protein". Biochem Biophys Res Commun. 265 (3): 630–5. doi:10.1006/bbrc.1999.1731. PMID 10600472.
  6. ^ a b Wassmer T; Attar N; Bujny MV; Oakley J; Traer CJ; Cullen PJ (Dec 2006). "A loss-of-function screen reveals SNX5 and SNX6 as potential components of the mammalian retromer". J Cell Sci. 120 (Pt 1): 45–54. doi:10.1242/jcs.03302. PMID 17148574.
  7. ^ a b "Entrez Gene: SNX5 sorting nexin 5".
  8. ^ "Haematology data for Snx5". Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ "Salmonella infection data for Snx5". Wellcome Trust Sanger Institute.
  10. ^ "Citrobacter infection data for Snx5". Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. ^ a b c Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88 (S248): 0. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  12. ^ Wellcome Trust Sanger Institute의 마우스 리소스 포털.
  13. ^ "International Knockout Mouse Consortium".
  14. ^ "Mouse Genome Informatics".
  15. ^ Skarnes, W. C.; Rosen, B.; West, A. P.; Koutsourakis, M.; Bushell, W.; Iyer, V.; Mujica, A. O.; Thomas, M.; Harrow, J.; Cox, T.; Jackson, D.; Severin, J.; Biggs, P.; Fu, J.; Nefedov, M.; De Jong, P. J.; Stewart, A. F.; Bradley, A. (2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  16. ^ Dolgin E (June 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  17. ^ Collins FS; Rossant J; Wurst W (January 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  18. ^ van der Weyden L; White JK; Adams DJ; Logan DW (2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.

추가 정보