데이비드 J. 립먼

David J. Lipman
데이비드 립먼
Paul Ginsparg and David Lipman (cropped).jpg
2013년 6월 David Lipman
태어난
데이비드 J. 립먼
모교브라운 대학교
버팔로 대학교 뉴욕 주립 대학교
로 알려져 있다BLAST(바이오테크놀로지)[1] 개발에 미치는 영향
어워드ISCB 시니어 사이언티스트 어워드
미국 국립과학원 회원
ISCB 펠로우[2]
과학 경력
필드생물정보학
계산생물학
시퀀스 비교 방법
비교 유전체학
분자 진화
기관국립생명공학정보센터
브라운 대학교
버팔로 대학교 뉴욕 주립 대학교
주목받는 학생스티븐 알츠철[3]
마크 보구스키[필요한 건]
웹 사이트www.ncbi.nlm.nih.gov/research/staff/lipman

David J. Lipman은 1989년부터 2017년까지[1] 국립보건원 [4][5]국립생명공학정보센터(NCBI) 소장을 지낸 미국의 생물학자입니다.NCBI는 International Sequence Database Consortium의 미국 노드인 [6]GenBank와 세계에서 생물의학 정보 검색 및 검색을 위해 가장 많이 사용되는 사이트 중 하나인 PubMed의 본거지입니다.Lipman은 BLAST 시퀀스 얼라인먼트 프로그램의 원저자 중 한 명이며, 생물 [7][8][9]정보학 분야에서 존경받는 인물이다.2017년, 그는 NCBI를 떠나 임파서블 [10]푸드의 최고 과학 책임자가 되었다.

교육

Lipman은 1980년 뉴욕 주립[11] 대학교 버팔로 대학에서 학사 학위를, M.D.를 받았다.

직업

립먼은 미국 국립보건원 의학도서관의 일부인 국립생명공학정보센터의 창립 소장이었다.그의 지도 하에 NCBI는 12명 미만에서 500명 이상의 과학자로 성장했으며, GenBank, PubMed, PubMed Central, dbGaP, DBSNP, Sequence Read Archive(SRA), RefSeq, Pubchem 등 수백 개의 과학 및 의료 데이터베이스를 보유하고 있습니다.NCBI의 내부 연구 프로그램에는 스테판 알츠철(또 다른 BLAST 공동 저자), 데이비드 랜즈먼(David Landsman), 유진 쿠닌[12](비교 유전체학 다작 작가), L(L) 등이 참여했다.아라빈드.

Lipman은 1983년 Wilbur-Lipman[13] 알고리즘에서 시작하여 1985년 FASTA 검색[14][15], 1990년[16] BLAST, 1997년 Gapped BLAST와 PSI-BLAST를 비롯한 일련의 시퀀스 유사성 알고리즘에 대한 중요한 연구로 잘 알려져 있습니다.BLAST는 결국 업계에서 가장 널리 사용되고 높은 평가를 받고 있는 시퀀스 얼라인먼트 프로그램(2021년 기준 160,000개 이상)이 되었습니다.현재 NCBI BLAST 서버는 가장 많이 사용되는 리소스 중 하나입니다.

립먼은 또한 데니스 A와 수년간 함께 일했다.엔씨비에서 벤슨과 다른 사람들은 게놈 및 단백질 배열 데이터의 세계 최대 데이터베이스 중 하나인 GenBank의 유지 및 개선에 대해 연구했습니다.GenBank는 유럽 뉴클레오티드 아카이브(European Nucleotide Archive) 및 일본 DNA 데이터 뱅크(DNA Data Bank of Japan)와 함께 완전히 개방된 무제한 게놈 배열 데이터베이스인 INSDC(International Nucleotide Sequence Database Collaboration)를 형성하고 있으며,[18][19][20] 1990년부터 이러한 데이터의 전 세계 저장소가 되었다.

그는 수천 개의 인플루엔자 바이러스 [citation needed]분리체의 게놈을 배열하고 사용할 수 있도록 하는 인플루엔자 게놈 배열 분석 프로젝트의 창안자 중 한 명이었다.

그는 오픈 액세스 [citation needed]출판에 관한 Bethesda 성명서의 최초 서명자 중 한 명이었다.

그는 또한 Biology [21]Direct라고 불리는 공개 접속되고 동료 평가를 받은 온라인 과학 저널의 편집장이기도 하다.

2017년 5월, 립먼은 NCBI에서 그의 역할을 떠나 식물에 기반을 둔 육류 회사인 임파서블 푸드에 최고 과학 [22]책임자로 합류했습니다.

수상과 영예우

Lipman은 1996년에 생체 분자 기술에 대한 뛰어난 공헌으로 Association of Biomolecular Resource Facilities Award를 수상했습니다.

2000년, 그는 국립 [23]의학 아카데미에 선출되었다.

2004년에는 ISCB 시니어 사이언티스트 어워드를 수상했으며 2009년에는 국제컴퓨터생물학회(International Society for Computational Biology)[2][24]로부터 ISCB 펠로우로 선출되었습니다.

2005년 립만 박사는 미국 [citation needed]국립과학아카데미에 선출되었다.

2013년, 그는 백악관 "오픈 사이언스"[25][26] 변화의 챔피언 상을 받았습니다.

레퍼런스

스콜리아는 데이비드 J. 립먼의 저자 프로필을 가지고 있다.
  1. ^ a b "Research Institute Posts Gene Data on Internet". The New York Times. June 26, 1997.
  2. ^ a b Anon (2017). "ISCB Fellows". iscb.org. International Society for Computational Biology. Archived from the original on 2017-03-20.
  3. ^ "Sense from Sequences: Stephen F. Altschul on Bettering BLAST". 2000. Archived from the original on 2007-10-07.
  4. ^ "David J. Lipman, MD, Director, National Center for Biotechnology Information". Archived from the original on 2013-09-26.
  5. ^ "Open Access Now Conversation with David Lipman". Biomedcentral.com. Archived from the original on 29 June 2011. Retrieved 2 July 2011.
  6. ^ Benson, D. A.; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Wheeler, D. L. (2007). "GenBank". Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D25–D30. doi:10.1093/nar/gkm929. PMC 2238942. PMID 18073190.
  7. ^ "david lipman – Google Scholar". Scholar.google.com. Retrieved 2017-03-26.
  8. ^ Microsoft[dead link] Academic에서 색인화한 David J. Lipman 출판물
  9. ^ DBLP Bibliography Server의 David J. Lipman 씨
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  11. ^ "David J. Lipman, M.D. Biography". nih.gov. Archived from the original on 2017-02-11. Retrieved 2017-02-09.
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  16. ^ Altschul, Stephen; Gish, Warren; Miller, Webb; Myers, Eugene; Lipman, David (1990). "Basic local alignment search tool". Journal of Molecular Biology. 215 (3): 403–410. doi:10.1016/S0022-2836(05)80360-2. PMID 2231712.
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  19. ^ Benson, D. A.; Karsch-Mizrachi, I.; Clark, K.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Sayers, E. W. (2011). "GenBank". Nucleic Acids Research. 40 (Database issue): D48–D53. doi:10.1093/nar/gkr1202. PMC 3245039. PMID 22144687.
  20. ^ Benson, D. A.; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Sayers, E. W. (2010). "GenBank". Nucleic Acids Research. 39 (Database issue): D32–D37. doi:10.1093/nar/gkq1079. PMC 3013681. PMID 21071399.
  21. ^ "Archived copy". Archived from the original on 2011-09-30. Retrieved 2011-10-28.{{cite web}}: CS1 maint: 제목으로 아카이브된 복사(링크)
  22. ^ "National Library of Medicine Announces Departure of NCBI Director Dr. David Lipman". www.nlm.nih.gov. Retrieved 2017-05-04.
  23. ^ "Institute of Medicine Elects New Members".
  24. ^ "ISCB Names 2004 Senior Scientist Accomplishment Award Winner, Dr. David Lipman ISCB Newsletter 7-3". Iscb.org. Retrieved 2 July 2011.
  25. ^ "Archived copy". whitehouse.gov. Archived from the original on 2017-01-21. Retrieved 2016-04-02 – via National Archives.{{cite web}}: CS1 maint: 제목으로 아카이브된 복사(링크)
  26. ^ "Dr. David Lipman Receives White House "Open Science" Champions of Change Award on Behalf of NCBI". Ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2 April 2016.